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Oncomine 종합 어세이
Ion Torrent Oncomine 종합 어세이는 임상 암 연구를 위한 Oncomine 어세이 제품군의 일부입니다. Oncomine 어세이는 전 세계의 주요 암 기관에서 채택한 복수의 생물표지자(biomarker) 차세대 염기서열분석(NGS) 기반 어세이로서 NCI MATCH 임상 시험을 비롯한 다양한 응용 및 임상 연구 프로젝트에서 수천 개의 샘플을 분석하는데 사용되고 있으며 일관적이고 안정적인 결과를 제공합니다.
Oncomine Ion Ampliseq 기술을 기반으로 하고 Ion Torrent 플랫폼에서 사용할 수 있는 Oncomine 종합 어세이는 다음과 같은 기능을 제공합니다.
- 선도적인 종양학 연구 기관과 제약 회사의 협업 및 종양학 연구에서 가장 큰 규모로 정리된 증거 세트 중 하나인 Oncomine Knowledgebase의 증거를 기반으로 하는 가장 관련성 있는 콘텐츠
- 다양한 암 유형에 대한 호발 부위 SNV, indels, CNV 및 유전자 융합을 포함하는 복수의 생물표지자(biomarker) 유형 분석
- 향상된 QC를 포함한 ISO13485 준수 시설에서 시약의 완벽한 설계 및 향상된 제조 품질을 바탕으로 여러 연구 실험실에서 높은 특이성, 감도 및 재현성으로 입증된 신뢰할 수 있는 성능
- 10ngs의 DNA와 RNA만큼 적은 샘플 투입량의 FNA를 포함한 FFPE 조직 샘플에서도 도출되는 확실한 결과
- 높은 복합 유연성과 빠른 결과 도출 기능을 갖춘 Ion Chef 및 Ion S5 시스템의 효율적인 워크플로우
- Oncomine Knowledgebase 리포터를 포함하여 Ion Torrent 플랫폼 및 최적화된 Oncomine 어세이를 위해 개발된 향상된 생물정보학 및 보고 솔루션을 통해 샘플-특이적 변이에 대한 맥락에 맞는 분석이 가능하게 되어 최신 종양학 연구에서 이들의 관련성을 이해하게 되었고, 라벨, 지침 및 현재의 글로벌 임상 시험에 관련하여 이를 사용할 수 있게 되었습니다.
Oncomine 종합 어세이 콘텐츠
이 내용은 최신 과학 및 임상 연구 증거와 주요 학술 기관 및 제약 회사와의 협력을 기반으로 합니다.
2017년 5월에 출시된 Oncomine 종합 어세이 v3는 다음과 같이 확장되었습니다.
- 키나아제 영역 범위는 몇 가지 중요한 수용체 티로신 키나아제의 전체 키나아제 영역을 포괄합니다. 이를 통해 이미 확인된 널리 발생하는 작용 가능 변이(ALK, BRAF, DDR2, EGFR, ERBB2, KIT, MET, PDGFRA, RET, ROS1)와 더불어 기능적으로 관련된 돌연변이를 검출할 수 있는 가능성이 높아집니다.
- DNA 복구에 관여하는 유전자를 나타냄(DNA 복구 경로에 있는 31개 유전자)
- MAPK, PI3K 및 세포 사이클 유전자를 포괄함
Oncomine 종합 어세이 성능
진양성(true positive) | 위양성(false positive) | 위음성(false negative) | 감도 | 양성 예측값 | |
|---|---|---|---|---|---|
호발 부위(hotspots) | 504 | 9 | 4 | 99.21% | 98.25% |
Indel | 31 | 0 | 1 | 96.88% | 100% |
DeNovo SNV | 602 | 11 | 18 | 97.10% | 98.21% |
De novo InDel | 24 | 2 | 4 | 85.71% | 92.31% |
융합(fusions) | 82 | 4 | 4 | 95.35% | 95.35% |
표 1. Oncomine 종합 어세이 v3의 성능은 20개의 FFPE 암 조직 샘플과 HorizonDx, SeraCare의 상용 표준 물질을 사용하여 검증되었습니다.
Oncomine 종합 어세이 워크플로우
간소화된 워크플로우는 유연하며 다양한 플랫폼과 처리량이 가능합니다. Oncomine 종합 어세이 v3은 Ion Chef 시스템을 사용한 자동화된 라이브러리 준비를 통해 Ion S5 시스템에서 8개 샘플 처리량에 최적화되었습니다. 이 어세이는 수동 및 자동(라이브러리 준비를 위해 Ion Chef 시스템 사용)의 두 가지 구성으로 사용할 수 있으며 DNA 및 RNA 프라이머 패널 및 라이브러리 준비 시약이 포함되어 있습니다.
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.