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二代测序 (NGS) 由于其具有高灵敏度和高通量特性越来越受欢迎,特别是在肿瘤学和生殖健康应用领域。我们可以使用多种方法和酶,助您为多种 NGS 平台组装自己的 NGS 文库制备试剂盒。 无论您选择何种测序平台用于开发您的分子检测产品,在我们的 NGS 相关产品线中,您都可以找到用于制备文库所需的各种试剂。
在努力实现目标的过程中不要盲目冒险。与我们合作,您可我们这里获得高质量产品、供应保障、定制服务和专业知识。
Dr. Eugene Wee, Head of Assay Development, Vela Diagnostics
从样本制备到检测试剂,Thermo Fisher 使基于创新技术的分子检测产品的商业化成为可能。 Dr. Wee 在这里讨论了使用SuperScript IV 反转录酶开发 NGS 试剂盒的结果。
特性 | SuperScript IV 反转录酶 | SuperScript III 反转录酶 | Maxima 反转录酶 |
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反应时间 | 10 分钟 | 50 分钟 | 30 分钟 |
抑制剂耐受能力 | 50°C | 50°C | 50°C |
抑制剂耐受能力 | +++++ | + | +++ |
灵敏度 | +++++ | +++ | +++ |
为了获得最佳结果,特别是对于困难样本,如福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织样本或低 样本起始量,Invitrogen SuperScript IV 反转录酶由于其增强的灵敏度而成为理想的选择。
Thermo Scientific T4 DNA Polymerase—T4 DNA 聚合酶是一种用于补平5‘ 突出末端以形成平末端的酶。它是模板依赖的 DNA 聚合酶,可催化单链 DNA 的5´–3´合成。该酶具有 3´–5´ 核酸外切酶活性,但缺乏 5´–3´ 核酸外切酶活性。T 4DNA 聚合酶在单链 DNA 上比在双链 DNA 上显示出更强的 3´–5´ 核酸外切酶活性,其核酸外切酶活性是DNA polymerase I, E.coli和 Klenow 片段的200倍以上。
Invitrogen DNA Polymerase I, Large (Klenow) Fragment——这种 DNA 聚合酶可用于补平 5´ 突出末端以形成平末端,以及去除 3´ 突出末端。它缺乏完整 DNA 聚合酶 I 的 5´–3´ 核酸外切酶活性,但具有 5´–3´ DNA 聚合酶和 3´–5´ 核酸外切酶活性。
dNTP——为了使用的方便性和灵活性,我们可提供多种形式、配方和浓度的高质量核苷酸。我们的 dNTP 高度稳定,纯度大于99%,核苷酸中不含核酸酶、人类和E.coliDNA。
Thermo Scientific T4 Polynucleotide Kinase——该酶在寡核苷酸上添加5´-磷酸基,方便后续进行连接反应。T4多核苷酸激酶(T4 PNK)催化γ-磷酸从 ATP 转移到单链或双链 DNA 和 RNA 、寡核苷酸或核苷3’-单磷酸(正向反应)的5‘-OH 基团上。该反应是可逆的。在存在 ADP 的情况下,T4多核苷酸激酶表现出5´-磷酸酶活性,并催化5´-P-寡聚-多聚核苷酸与 ATP 之间的磷酸基团交换(交换反应)。这种酶也是一种3' -磷酸酶。
Thermo Scientific Klenow, exo- ——Klenow, exo- 是 DNA polymerase I 的大片段。其具有 5´–3´ 聚合酶活性,但缺乏 DNA 聚合酶 I 的 3´–5´ 和 5´–3´ 核酸外切酶活性。该酶的 3´–5´ 核酸外切酶活性通过在 3´–5´ 核酸外切酶活性位点进行突变而消除。
dATP——我们提供各种浓度、配方和体积的高质量 dATP,以提供最大的便利性和灵活性。我们的 dATP 具有高度稳定性,纯度超过99%,并且不含核酸酶、人类和E.coli DNA。
Thermo Scientific T4 连接酶——该酶催化双链 DNA 或 RNA 中比邻的5'-磷酸基和3'-羟基末端之间磷酸二酯键的形成。该酶可以修复双链 DNA、RNA 或 DNA/RNA 杂合体中的单链缺口。其还可以连接粘性末端或平末端 DNA 片段,但是对单链核酸没有活性。
在大多数情况下,您制备的文库在测序之前需要进行扩增。 由于 NGS 是一种高灵敏 技术,因此建议您使用高保真 DNA 聚合酶,以确保模板 无错误,从而可以进行最准确的测序。Thermo Scientific 和 Invitrogen 高保真 DNA 聚合酶凭借出色的扩增能力和高保真性来扩增DNA 片段,甚至从最困难的模板中也可以准确快速地扩增 PCR 产物。
耐受抑制剂。使用Platinum SuperFi DNA 聚合酶或同类高保真 DNA 聚合酶扩增2 kb 的人类 gDNA 片段 (A—Q5 Hot Start High-Fidelity, B—KAPA HiFi HotStart PCR Kit, C—KOD Hot Start, and D—PrimeSTAR GXL) ,反应混合物中含有1-无抑制剂、2-肝素(0.15 µg / µl)、3-木聚糖(0.5 µg / µl)或4-腐植酸(0.5 ng / µl)。所用分子量标准为ZipRulerExpress DNA Ladder2
特点 | Invitrogen Platinum SuperFi DNA 聚合酶 | Thermo Scientific Phusion 热启动 II 高保真DNA聚合酶 |
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与Taq聚合酶的保真度比较 | >300x | 52x |
热启动 PCR | 基于抗体 | 基于亲合体 |
与 TaqMan 探针兼容 | 否 | 否 |
抑制剂耐受性 | ++++ | +++ |
多重检测能力 | 是 | 是 |
仅供科研使用,不可用于诊断目的。