二代测序流程图
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二代测序 (NGS) 由于其具有高灵敏度和高通量特性越来越受欢迎,特别是在肿瘤学和生殖健康应用领域。我们可以使用多种方法和酶,助您为多种 NGS 平台组装自己的 NGS 文库制备试剂盒。   无论您选择何种测序平台用于开发您的分子检测产品,在我们的 NGS 相关产品线中,您都可以找到用于制备文库所需的各种试剂。

在努力实现目标的过程中不要盲目冒险。与我们合作,您可我们这里获得高质量产品、供应保障、定制服务和专业知识。

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SuperScript IV 一步法 RT-PCR :客户声音

Dr. Eugene Wee, Head of Assay Development, Vela Diagnostics

从样本制备到检测试剂,Thermo Fisher 使基于创新技术的分子检测产品的商业化成为可能。 Dr. Wee 在这里讨论了使用SuperScript IV 反转录酶开发 NGS 试剂盒的结果。

反转录酶选择表

特性SuperScript IV 反转录酶SuperScript III 反转录酶Maxima 反转录酶
反应时间10 分钟50 分钟30 分钟
抑制剂耐受能力50°C50°C50°C
抑制剂耐受能力+++++++++
灵敏度+++++++++++

为了获得最佳结果,特别是对于困难样本,如福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织样本或低 样本起始量,Invitrogen SuperScript IV 反转录酶由于其增强的灵敏度而成为理想的选择。

Thermo Scientific T4 DNA Polymerase—T4 DNA 聚合酶是一种用于补平5‘ 突出末端以形成平末端的酶。它是模板依赖的 DNA 聚合酶,可催化单链 DNA 的5´–3´合成。该酶具有 3´–5´ 核酸外切酶活性,但缺乏 5´–3´ 核酸外切酶活性。T 4DNA 聚合酶在单链 DNA 上比在双链 DNA 上显示出更强的 3´–5´ 核酸外切酶活性,其核酸外切酶活性是DNA polymerase I, E.coli和 Klenow 片段的200倍以上。

Invitrogen DNA Polymerase I, Large (Klenow) Fragment——这种 DNA 聚合酶可用于补平 5´ 突出末端以形成平末端,以及去除 3´ 突出末端。它缺乏完整 DNA 聚合酶 I 的 5´–3´ 核酸外切酶活性,但具有 5´–3´ DNA 聚合酶和 3´–5´ 核酸外切酶活性。

dNTP——为了使用的方便性和灵活性,我们可提供多种形式、配方和浓度的高质量核苷酸。我们的 dNTP 高度稳定,纯度大于99%,核苷酸中不含核酸酶、人类和E.coliDNA。

Thermo Scientific T4 Polynucleotide Kinase——该酶在寡核苷酸上添加5´-磷酸基,方便后续进行连接反应。T4多核苷酸激酶(T4 PNK)催化γ-磷酸从 ATP 转移到单链或双链 DNA 和 RNA 、寡核苷酸或核苷3’-单磷酸(正向反应)的5‘-OH 基团上。该反应是可逆的。在存在 ADP 的情况下,T4多核苷酸激酶表现出5´-磷酸酶活性,并催化5´-P-寡聚-多聚核苷酸与 ATP 之间的磷酸基团交换(交换反应)。这种酶也是一种3' -磷酸酶。

Thermo Scientific Klenow, exo- ——Klenow, exo- 是 DNA polymerase I 的大片段。其具有 5´–3´ 聚合酶活性,但缺乏 DNA 聚合酶 I 的 3´–5´ 和 5´–3´ 核酸外切酶活性。该酶的 3´–5´ 核酸外切酶活性通过在 3´–5´ 核酸外切酶活性位点进行突变而消除。

dATP——我们提供各种浓度、配方和体积的高质量 dATP,以提供最大的便利性和灵活性。我们的 dATP 具有高度稳定性,纯度超过99%,并且不含核酸酶、人类和E.coli DNA。

Thermo Scientific T4 连接酶——该酶催化双链 DNA 或 RNA 中比邻的5'-磷酸基和3'-羟基末端之间磷酸二酯键的形成。该酶可以修复双链 DNA、RNA 或 DNA/RNA 杂合体中的单链缺口。其还可以连接粘性末端或平末端 DNA 片段,但是对单链核酸没有活性。

在大多数情况下,您制备的文库在测序之前需要进行扩增。 由于 NGS 是一种高灵敏 技术,因此建议您使用高保真 DNA 聚合酶,以确保模板 无错误,从而可以进行最准确的测序。Thermo Scientific 和 Invitrogen 高保真 DNA 聚合酶凭借出色的扩增能力和高保真性来扩增DNA 片段,甚至从最困难的模板中也可以准确快速地扩增 PCR 产物。

Fidelity compared to Taq
amplification

耐受抑制剂。使用Platinum SuperFi DNA 聚合酶或同类高保真 DNA 聚合酶扩增2 kb 的人类 gDNA 片段 (A—Q5 Hot Start High-Fidelity, B—KAPA HiFi HotStart PCR Kit, C—KOD Hot Start, and D—PrimeSTAR GXL) ,反应混合物中含有1-无抑制剂、2-肝素(0.15 µg / µl)、3-木聚糖(0.5 µg / µl)或4-腐植酸(0.5 ng / µl)。所用分子量标准为ZipRulerExpress DNA Ladder2

特点Invitrogen Platinum SuperFi DNA 聚合酶Thermo Scientific Phusion 热启动 II 高保真DNA聚合酶
Taq聚合酶的保真度比较>300x52x
热启动 PCR基于抗体基于亲合体
与 TaqMan 探针兼容
抑制剂耐受性+++++++
多重检测能力

仅供科研使用,不可用于诊断目的。