A comprehensive next-generation sequencing (NGS) assay for translational and early clinical research

适用于翻译研究和早期临床研究的全面高通量测序 (NGS) 检测试剂盒

Oncomine Comprehensive Assay v3是一种覆盖 161 种最相关的癌症基因的多生物标志物 NGS 检测试剂盒，其基于 Oncomine 知识库以及与领先的癌症研究机构和制药公司的合作内容。其低样本输入量要求支持对小规模和高检测难度的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本进行分析。

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Oncomine Comprehensive Assay v3 试剂盒的特点包括：

  • Oncomine Comprehensive Assay v3 仅需 10 ng 的 DNA 或 RNA 样本输入量，是分析高检测难度 FFPE 样本的理想解决方案
  • 在一个简化的工作流程中检测 161 种独特癌症相关基因的相关 SNV、CNV、基因融合和插入缺失
  • 在转译研究和临床研究项目（包括 NCI MATCH 试验）中，不同研究实验室的研究结果均显示出高度的特异性、灵敏度和再现性。
  • Ion Chef 系统加 Ion GeneStudio S5 或 Ion Torrent Genexus 系统上的高效工作流程具有高度的多重分析灵活性和快速得出结果的能力

"Oncomine 检测试剂盒仅需更低的 DNA 输入量，这是原始样本有限的情况下的重要优势。"

—John Bartlett 博士

转化病理学平台主任
安大略省癌症研究所

Oncomine Comprehensive Assay v3的检测内容

Oncomine Comprehensive Assay v3 包括：

  • 热点 SNV 和插入缺失、CNV 以及基因融合
  • 激酶结构域覆盖范围横跨多种关键受体酪氨酸激酶内的整个激酶结构域。除了已知的有实际价值且常见的变异（ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、KIT、MET、PDGFRA、RET、ROS1）外，检测出功能相关突变的可能性增加。
  • 具有参与 DNA 修复的基因（DNA 修复通路中的 31 种基因）
  • 包含 MAPK、PI3K 和细胞周期通路基因

 

根据体细胞变异类型分类的 161 种基因

87 种热点基因
43 种焦点 CNV 增益
48 种 DEL 突变完整 CDS
51 种融合驱动基因

要查看 Oncomine Comprehensive Assay v3 的全部基因内容，请下载彩页。


Oncomine Comprehensive Assay v3 在 Ion GeneStudio S5 测序仪上使用时的性能

 

真阳性

假阳性

假阴性

灵敏度

阳性预测值

热点

504

9

4

99.21%

98.25%

插入缺失

31

0

1

96.88%

100%

DeNovo SNV

602

11

18

97.10%

98.21%

DeNovo 插入缺失

24

2

4

85.71%

92.31%

融合

82

4

4

95.35%

95.35%

表 1. 使用来自 HorizonDx 和 SeraCare 的 20 份 FFPE 癌症组织样本和标准品材料验证了 Oncomine Comprehensive Assay v3 的性能。


检测试剂盒分析验证—来自NCI Match 的试验结果

Assay analytical validation--results of the NCI Match Trial
数据源自：Lih CJ, et al.Analytical validation of the NGS assay for a nationwide signal-finding clinical trial molecular analysis for therapy choice clinical trial. J Mol Diagn.2017 Mar;19(2):313-327.


灵活的配置，可满足您的需求

Oncomine Comprehensive Assay v3 已针对在 Ion GeneStudio S5 系统上运行的八份样本或在 Ion Torrent Genexus 系统上运行六份样本进行了通量优化。这款检测试剂盒可用于 Ion GeneStudio S5 系统，有两种配置：手动和自动（使用 Ion Chef 系统进行文库制备），且包含 DNA 和 RNA 引物检测板和文库制备试剂。Genexus 系统将制备、模板制作和测序结合在一个系统中。


订购信息

仅供科研使用，不可用于诊断目的。