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Qubit RNA IQ 检测的开发是为了快速评价 RNA 样本的完整性和质量 (IQ)。它使用两种染料:一种可与较大且完整和/或结构化的 RNA 结合,而另一种可与较小的降解 RNA 结合。
若要进行 Qubit RNA IQ 检测,仅需向 RNA IQ 工作缓冲液中加入最低至 1 µL 的样本(含 0.5-1.5 μg RNA),并可在 Qubit 4 或 Qubit Flex 荧光计上测定即可。此检测无需特殊处理、繁琐的样本制备或等待结果。样本的 IQ 评分是一个介于 1 和 10 之间的数值,代表样本中的大小 RNA 分子的百分比。
Qubit RNA IQ 检测结果
RNA IQ 评分是一个从 1 至 10 的数值,类似于其他 RNA 质量评分。这一评分基于一种专有算法,代表了样本中结构化大 RNA 分子与小 RNA 分子的比例。低评分 (A) 表明样本主要由小 RNA 分子组成,而高评分 (B) 表明样本主要由结构化大 RNA 分子组成。
如上表所示,与 Agilent™ Bioanalyzer™ 系统等其他方法相比,Qubit RNA IQ 检测更加简单、快捷。此外,Qubit RNA IQ 评分与 RT-qPCR RNA 质量测定结果的一致性要优于 Bioanalyzer 的 RNA 完整性数 (RNA),如 Sample Data(样本数据)页面所示。
仪器与检测 | Qubit 4 荧光计及 RNA IQ 检测 | Agilent 2100 Bioanalyzer™ 检测仪和 RNA 纳米芯片* |
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检测所需设备及试剂* | Qubit 4 荧光计 | Agilent 2100 Bioanalyzer 检测仪 |
Qubit RNA IQ 检测试剂盒 | RNA 6000 Nano 检测试剂盒 | |
移液器 | 移液器 | |
Qubit 检测管 | 微量离心管 | |
| 芯片注胶平台 | |
| IKA 涡旋仪 | |
| 小型离心机 | |
| 计算机 | |
| 热盖仪或水浴 | |
| 不含 RNase 的水 | |
设备设置 | 打开 Qubit 4 荧光计 | 依次用新 DNA 试剂盒替换芯片注胶平台上的注射器 |
调整芯片注胶平台的底盘 | ||
调整芯片注胶平台的注射器夹 | ||
调整 Bioanalyzer 芯片选择器 | ||
设置涡旋混合仪 | ||
加载芯片前启动软件 | ||
样品制备时间 | ~5 分钟 | ~30-45 分钟 |
样本制备 | 1.添加 RNA IQ 染料到 RNA IQ 缓冲液中以制备 Qubit RNA IQ 工作缓冲液 | 1.制备 RNA 分子量大小标记 |
2.添加样本 [1-20 μL (0.5––1.5 μg)] 和标准品到 Qubit RNA IQ 工作溶液中 | 2.制备凝胶(包含 10 分钟离心的步骤) | |
| 3.制备凝胶染料预混液(包含 10 分钟离心的步骤) | |
| 4.凝胶染料预混液加到芯片中 | |
| 5.marker加到芯片中 | |
| 6.加如 RNA 分子量大小标记和样本(包含 1 分钟 IKA 涡旋的步骤) | |
样本稳定性 | ~1 小时 | 在 5 分钟内使用芯片 |
分析运行时间 | 每样品 <4 秒 | 每芯片 30 分钟 |
常规维护 | 无 | 每月需要进行密封性测试以检测芯片注胶平台的性能 |
电泳检测方法:每日使用电极清洁器清洁电极 | ||
每月通过使用牙刷及蒸馏水彻底清洁电极 | ||
每月一次(或在任何液体溅落后)用异丙醇清洁聚焦滤镜 | ||
维护所需产品 | 无 | RNaseZAP(电极清洁) |
* 相关信息汇总自 Agilent G2938-90037 和 G2946-90003 用户手册以及 Thermo Fisher Scientific MAN0017210 快速参考卡片。 |
这一数据示例表明,Qubit RNA IQ 检测中的两种试剂分别对大 RNA 分子和小 RNA 分子具有高度特异性,而 RNA IQ 评分会随大 RNA 分子百分比的增加而相应增大。
该数据示例表明,当暴露于 RNase A 时,RNA 样品会随着时间推移降解,且 RNA IQ 评分降低。正如我们预计的那样,更高剂量的 RNase A 可加速降解。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.