赛默飞世尔科技致力于提高抗体性能和特异性检测能力。为了助力这一点,每种适用于 Western Blotting 应用的 Invitrogen 抗体均已使用与下文类似的方案进行了测试。这些测试有助于确定抗体性能,并确保在实验中使用时能获得出色的结果。
Invitrogen 抗体所采用的典型 Western Blot 实验方案如下。本实验方案包括:
备注: 此方案中的一些步骤需要根据所用的样本和抗体进行优化。
样本制备
- 将裂解缓冲液与 LDS 样本缓冲液(加或不加还原剂)中以 70℃ 下煮沸10分钟或者是在 95℃,制备所需浓度的待上样样本。
备注:一般情况下,根据蛋白质丰度、分子量和使用的凝胶类型,每孔可上样 10-50 µg 蛋白质。
- 让样本冷却并短暂离心,以收集沉淀物。
SDS-PAGE
- 组装 SDS-PAGE 凝胶系统,倒入 SDS PAGE 电泳缓冲液。
- 取下凝胶上的电泳梳。确保这些孔没有气泡或残留聚丙烯酰胺凝胶碎。用去离子水轻轻冲洗孔,以除去储存液 (确保孔指没有变形)。
- 上样,并加入合适的蛋白marker。
备注:蛋白marker 应覆盖预期分子量范围,以确保在检测步骤结束后可以准确预估分子量。
- 在 SDS-PAGE 凝胶系统中以不超过 150V 的电压(即使用预编程方法的 PowerEase Touch 电源,或使用不超过 150V 的其它电源)运行凝胶 (即小型凝胶槽,产品货号 NW2000)。确保电泳缓冲液不漏液,并且系统保持冷却,确保凝胶不会融化。
- 观察上样染料的前部和染色蛋白marker,确定电泳的时长。
湿式转印(建议用于高分子量和丰度非常低的蛋白)
- 将所有海绵和滤纸浸泡在转印缓冲液中,制备转印装置。
- 从 SDS-PAGE 凝胶系统中取出凝胶,然后用去离子水冲洗并在转印缓冲液中作平衡处理。
- 在印迹模块中(即 XCell II 印迹模块)制备转印膜组。膜组包括(从阴极到阳极):3 块吸水海绵、滤纸、凝胶、膜、滤纸和 3 块吸水海绵。
备注:将膜放在凝胶上时,请确保清除所有气泡。
- 将印迹模块放置在 XCell SureLock Mini-Cell 中,然后放入楔形板。
- 用转印缓冲液完全填充内部核心区域,并用去离子水完全填充外室。
- 在冷室中以 80 伏的电压运行 2-3 小时,或在 25 伏的电压下运行一整夜。
备注:转印蛋白质所用时间因蛋白质的分子量而异。
使用 iBlot 转印系统进行干式转印(建议用于 <250 kDa 的蛋白质)
- 用手柄打开 iBlot 3 蛋白质免疫印迹转印设备的盖子。确保装置印迹表面清洁。
- 拆开 iBlot 3 转印膜组的封条,分离顶部膜组,并将其放置在转印凝胶层朝上的一侧。将底部膜组置于透明塑料托盘中
- 打开凝胶盒,将预电泳凝胶短暂浸入去离子水中,然后将凝胶放在底部膜组的转印膜上。使用印迹滚筒去除所有气泡。
- 将 iBlot 3 滤纸短暂浸入去离子水中,并将预浸滤纸置于凝胶上。去除所有气泡。
备注:托盘上的电触点应与 iBlot 3 Western Blot 转印装置印迹表面的相应电触点对齐。
- 从顶部膜组上拆下并丢弃白色分离膜,然后将顶部膜组放在滤纸上,使铜电极朝上。去除所有气泡。
- 将吸收垫放在铜电极上方。
备注:预折叠铝条的较长一侧应朝上,并远离铜压片
- 将带有已组装转印膜组的托盘放置在印迹面上,并将托盘与设备上的转印膜组对齐指示器(+ 号)对齐。
- 关闭 iBlot 3 Western Blot 转印装置的盖子并选择适当的转印程序。
- 一旦转移完成,取出转印膜并继续进行染色或封闭步骤。
半干式转印
- 在浅盘中,将 2 张 2.5 mm 厚的印迹滤纸短暂浸泡于转印缓冲液中。
- 当滤纸仍浸泡在缓冲液中时,用印迹滚筒滚动滤纸膜组,以去除夹在滤纸之间的气泡。
- 将预浸滤纸的膜组放入半干式印迹装置的阳极板上。去除所有气泡。
- 将预浸印迹膜放在滤纸顶部并去除气泡。
- 小心地从凝胶盒中取出凝胶,浸泡在转印缓冲液中。
- 将凝胶放在印迹膜的顶部。
- 将剩余滤纸和膜组放在凝胶上。确保这些滤纸正确对齐并与凝胶/三明治膜齐平。去除所有气泡。
- 将阴极板盖放在膜组上并拧紧旋钮。
- 以 20 伏电压运行 30–60 min。
膜染色(可选)
为控制转印的均匀性,可以用 ponceau-S 对膜进行染色,操作步骤如下:
- 用 1X PBST (PBS-Tween 20) 对膜进行简单漂洗,并在膜上加入 ponceau-S 染色液进行染色。将膜放在凝胶摇床上 2 min。
- 用 1X PBST 漂洗膜 3-4 次,洗掉多余的染色液。
封闭
选择适合您特定工作流程的封闭缓冲液。与抗体浓度或检测底物一样,封闭缓冲液的选择对于获得良好结果至关重要,并且应对封闭流程进行优化。除下面的建议外,还可以使用各种即用型封闭剂。
- 用 5% 的脱脂乳或 5% 的 BSA 在 1X PBST 或 TBST (TBS-Tween 20) 或 1X Blocker FL 荧光封闭缓冲液封闭膜。 在室温下的凝胶摇床上,用 poncea-S 将膜进行染色1小时。
备注:对于磷酸化靶标,我们推荐使用 5% BSA 进行封闭。
HRP 偶联物
- 将膜与在封闭缓冲液中制备且经过适当稀释的一抗在 4℃ 下孵育一整夜,或于室温下在凝胶摇床上孵育 2-3 小时。
备注:一抗和二抗的用量可能会因所用的抗体以及正在运行的样品而异。良好的开始在于检查抗体数据表是否有推荐的稀释范围,并在该处进行滴定以获得实验所需的较佳抗体稀释度。
- 孵育后,用 1X PBST 或 TBST 漂洗膜三次,持续 5 min。
- 将膜与 HRP 偶联二抗(于室温下在凝胶摇床上通过封闭缓冲液制备)的推荐稀释液一起孵育 30-45 min。
- 去除二抗,并在凝胶摇床上用 1X PBST 或 TBST 漂洗膜三次,每次 5 min。
荧光偶联物
备注:建议对用于荧光 Western Blot 的缓冲液进行过滤-灭菌处理,以避免聚集物附着到膜上,成为荧光伪影。
- 将膜与在 4℃ 封闭缓冲液中制备的适量一抗稀释液一起孵育,或在室温下使用凝胶振荡器孵育 2-3 小时。
备注:如果进行多色荧光WB,请使用来自不同种属的一抗防止交叉反应。
备注:一抗和二抗的用量可能会因所用的抗体以及正在运行的样品而异。良好的开始在于检查抗体数据表是否有推荐的稀释范围,并在该处进行滴定以获得实验所需的较佳抗体稀释度。
- 孵育后,用 1X PBST 或 TBST 漂洗膜三次,持续 5 min。
- 将膜与荧光偶联二抗(于室温下在凝胶摇床上通过封闭缓冲液制备)的推荐稀释液一起孵育 30–45 min。用铝箔覆盖印迹容器,以保护荧光基团不受光影响。
备注:如果进行多色荧光WB,请使用交叉吸附型二抗以降低交叉反应的发生概率。此外,选择不同的荧光基团,可避免跨通道荧光渗漏。
- 去除二抗,并在凝胶摇床上用 1X PBST 或 TBST 漂洗膜三次,每次 5 min。
HRP Western Blot
- 使用 ECL 化学发光底物孵育印迹,持续 2-5 min。将膜放入透明薄膜中并除去任何多余的底物。
备注:如果接触时间超过几分钟、请考虑使用更灵敏的底物,例如 SuperSignal West Pico、SuperSignal West Dura 或 SuperSignal West Femto。
- 采用化学发光成像仪采集图像,例如 iBright 成像系统。
荧光 Western Blot
- 使用荧光成像仪采集图像。例如 iBright 成像系统。
- 使用前,用 70% 乙醇彻底清洁成像表面。
- 将印迹置于成像表面,确保其平坦、无气泡。
- 如果您正在进行多色荧光WB,则使用 800 nm 通道检测低丰度蛋白或弱靶点。使用 680 nm 通道检测更多高丰度蛋白质或强靶点。
最终数据输出示例
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