Countess 全自动细胞计数仪的性能和应用数据

性能数据表明,Countess 3 细胞计数仪可以在多种类型的细胞上进行准确且精确的计数。应用数据显示了研究人员可以在活性、凋亡、转染效率、CAR-T 胞培养、CRISPR 转导等多种研究中获得有效且准确的数据。

 

有关更多应用数据,请下载本页面以及资源上的应用说明。


细胞计数准确性和精确度

机器学习算法可实现准确和精确的细胞计数,可与流式细胞仪计数媲美。

使用 Attune NxT 流式细胞仪(紫色柱)、Countess 3 FL 全自动细胞计数仪(红色柱)以及血球计数板搭配显微镜(手动计数,灰色柱)对 CHO-K1、人宫颈癌细胞、HEK293、白血病细胞和人 PBMC 进行了计数。Countess 3 FL 仪器和血球计数板直方图代表了 6 个独立计数的平均值且高度一致。手动计数要比 Countess 3 计数或流式细胞仪计数有更宽的误差范围(计数的标准差)。

机器学习算法可实现准确和精确的细胞计数,并且差异系数小于手动计数。

CHO-K1、人宫颈癌细胞、HEK293、白血病细胞和人 PBMC(各种大小)使用 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪进行了计数(蓝点),并手动使用血球计数板搭配显微镜进行了计数(绿点)。Countess 3 与血球计数板计数的中间值(短水平线)相似,但血球计数板不同用户的单个血球计计数(点)显示的差异则大得多——远超 20%。

具有挑战性的细胞类型

机器学习算法可对具有挑战性的细胞类型进行准确的细胞计数,并且精度高于手动计数。

 

因体积小、对比度低而计数难度极高的人类和小鼠外周血单核细胞 (PBMC) 使用 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪进行了计数(顶部)(蓝色柱),同时也使用血球计数板搭配显微镜进行了手动计数(绿色柱)。各柱代表六个计数。误差代表标准差,手动计数的标准差明显更高。图像(底部)显示识别并计数的人类(左侧)和小鼠(右侧)PBMC。


成团细胞

机器学习算法可对成团细胞和细胞碎片的准确计数。

 

在明场模式下使用 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪对 RAW 细胞(小鼠巨噬细胞)进行了计数,这些细胞体积小且容易成团。使用了台盼蓝染料来确定细胞活性。该图显示了原始图像(左侧)和增强图像(右侧),其中活细胞具有绿色轮廓,死细胞具有红色轮廓。计数算法能分辨细胞团块中的细胞并正确圈出细胞并对细胞进行计数。细胞碎片会被识别并自动排除在计数范围之外。


细胞活性

明场和荧光模式下小鼠 PBMC 的活性。

 

在明场和荧光模式下使用 Countess 3 和 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪对小鼠 PBMC(体积可能小到仅有 5 µm)进行了计数。在明场计数(左侧)中,使用了台盼蓝染料 (0.4%) 来区分活性。Countess 3 细胞计数器用绿色轮廓(圆圈)圈出活(半透明)细胞,用红色轮廓圈出死(深染)细胞,以指示其活性。

 

在荧光模式(右侧)下,吖啶橙和碘化丙啶 (AO/PI)检测可提高活/死状态的特异性。AO 将所有有核活细胞染为绿色,可通过 EVOS GFP 2.0 光立方检测,而 PI 将死细胞染为红色,可通过 EVOS Texas Red 2.0 光立方检测。这是反映荧光染色是比台盼蓝更准确的活性指标的一个例子。


细胞凋亡

荧光模式下的凋亡和死亡细胞检测。

 

在使用 2 和 4 µM 十字孢碱孵育后,用 1:400 CellEvent Caspase-3/7 绿色检测试剂标示了 USO2(人类骨肉瘤上皮)细胞以识别凋亡细胞,然后用 1:1,000 SYTOX Red 死细胞染料表示所有死细胞。将细胞在室温下培养 30 分钟,然后在配备 EVOS LED 光立方、GFP 2.0Cy5 2.0 的 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪上计数。随着药物剂量的增加,绿色和远红外信号均增强,这分别表明凋亡和细胞死亡显著增加。4µL 十字孢碱的百分比总和超过 100%,因为表达这两种染料的细胞中有 16% 在所有三个类别中都有计数。


使用 Countess 进行精准的单细胞计数和活性评估

了解我们最新的应用指南,重点介绍了 scRNA-Seq 和 scATAc-Seq 的单细胞和细胞核计数。 通过精准的细胞计数和活性评估,加强您的研究。 

 

单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和转座酶可接近染色质的单细胞测序(scATAC-Seq)技术通过提供单细胞水平的数据分辨率,为基因表达和调控提供了新的见解。为了获得高质量的单细胞数据,scRNA-Seq 和 scATAc-Seq 的方案需要将具有活性的悬浮单细胞或细胞核的准确计数作为起始量,并且尽可能减少细胞聚合和死细胞的存在。Invitrogen Countess 3 FL 自动细胞计数仪是一种可靠的解决方案,用于准确计数细胞和细胞核,评估其活力以及评估聚集。为助确保 Countess 3 FL 细胞计数仪在这些方案中实现出色性能,本应用说明提供了一份最佳实践指南。

scRNA-Seq 和 scATAc-Seq 的单细胞和细胞核的准确自动计数。 

 

使用基于 FL 的计数在 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪上对细胞核进行计数,可通过测序获得准确的计数结果。从 GM12878 细胞系 (A) 和 PBMC (B) 分离的细胞核的基于 FL 的计数比基于 BF 或 Countess II 仪器计数的细胞核计数更多。(C) 从脑组织中分离细胞核可获得准确的基于 FL 的计数,与 Cellaca™ MX 高通量自动细胞计数仪的计数相当。(D) 下一代测序 (NGS) 确认了可从基于 FL 的计数中准确加载2,000个目标细胞核。基于 FL 的计数可通过软件更新3在 Countess 3 FL 仪器上使用。通过 10x Genomics R&D 获得的数据。


转染效率

使用 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪,您可以快速验证成功转染或转导的细胞比例,然后再转向下游实验和分析。

在荧光模式下进行转染效率定量。

用 GFP 表达载体转染了白血病细胞。(左上)EVOS M5000 成像系统上采集的图像中,可以看到细胞附着在血管上(左下)。细胞进行了胰酶消化后,使用配备 EVOS LED GFP 光立方的 Countess 3 FL 细胞计数仪进行计数。分析表明,50% 的细胞成功转染。(中上)可对细胞进行亮度门控,以从最终计数中排除暗淡(低 GFP 表达)细胞(右上)

通过流式细胞术与自动化细胞计数测量转染效率的对比。

 

U2OS 细胞使用 Invitrogen CellLight Nucleus-GFP、BacMam 2.0 进行了转导,并培养了 36 小时。通过(左侧曲线图)流式细胞术和(右侧图像)配备 GFP 光立方的 Countess II FL 全自动细胞计数仪评估了细胞的荧光蛋白表达。两种方法测定的转染率几乎完全相同——分别为 49.5% 和 49%。


CAR-T 细胞扩增过程中的细胞培养质量控制

扩增 T 细胞进行 CAR-T 等新免疫疗法的研究和开发时,重要的是通过少量细胞样品快速评估 T 细胞健康状况,以帮助确保达到最大活性。Countess 3 FL 全自动细胞计数仪可以在细胞分离和激活前后,快速、准确地测定细胞活性和浓度,从而为以后的实验在节省宝贵的时间和细胞上提供一臂之力。

CAR-T 细胞培养质量控制。

 

使用 Dynabeads 非接触式人类 T 细胞试剂盒分离了 CAR-T 细胞,并使用用 Dynabeads 人类 T 活化剂 CD3/CD28对T 细胞进行了扩增和激活。扩增前后在 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪上使用台盼蓝染色通过明场计数对细胞培养物进行了监控。在图像(左)和柱状图(右)中,T 细胞和磁珠自动分化,T 细胞显示为活细胞(绿色),磁珠显示为死细胞(红色)。如果需要,也可根据大小和强度手动设门区分磁珠。


CRISPR-Cas9 转导细胞的活性和转导效率

在使用 CRISPR-Cas9 进行的基因组编辑实验中,慢病毒转导通常用于将 CRISPR-Cas9 复合物高效地送入细胞。表达荧光蛋白(如 GFP)的对照和可能敲掉的其他基因(如 HPRT)经常用于测量转染效率。Countess 3 FL 全自动细胞计数仪可用于对这些细胞内的活性和转染效率进行定量。

通过 GFP 表达测定的慢病毒转导效率。 

 

表达 Cas9 蛋白的 U2OS 细胞用 Lentiary CRISPR 阳性对照慢病毒、人类 HPRT、GFP 和阴性对照慢病毒(GFP 杂乱)按感染复数 (MOI) 1 和 2 进行了转导。两天后,在 Countess II FL 细胞计数仪上对细胞进行了 GFP 表达计数。(左)Countess II FL 仪器上显示的代表性计数结果。(右)柱状图显示 GFP 阳性细胞的百分比,表明转导成功。


流式细胞分析和细胞分选的样品和染色验证

许多流式细胞分析和细胞分选方案都建议使用特定的细胞浓度或范围进行最佳染色和分析。在流式细胞分析或荧光辅助细胞分选 (FACS) 之前,使用 Countess 3 全自动细胞计数仪进行初步筛选可以帮助提高实验成功率,并可能节省宝贵的时间和样品。您可以快速验证 (a) 您有足够的细胞完成方案;(b) 您使用了最佳数量的染色试剂;(c) 您在染色过程中没有丢失大量细胞;以及 (d) 您的细胞已得到有效染色或转导。

细胞浓度对流式细胞术细胞周期分析的影响。

不同浓度的白血病活细胞用恒定浓度 (10 μM) 的 Vybrant DyeCycle 橙色染料进行了标记,这种染料是一种细胞渗透性染料,在与 DNA 结合时会发出荧光,并在达到最佳染色效果时会产生“椅状”细胞周期柱状图。相同浓度的染料产生同时包含低(左)和高(右)细胞浓度的不良细胞周期柱状图,而用最佳细胞浓度 1 x 10⁶ 个细胞/mL(中心)则产生了正确的细胞周期柱状图。染色柱状图可以通过配备 EVOS 光立方,RFP 2.0 的 Countess 3 FL 全自动细胞计数仪快速、轻松地进行验证。


 

仅供研究使用。不可用于诊断程序。