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赛默飞世尔科技可提供全面的实时荧光定量 PCR (qPCR) 解决方案,为科学家开展重要的 SARS-CoV-2 研究提供支持。实时荧光定量 PCR 是公认的冠状病毒检测金标准,并且是一项成熟的技术,可以帮助在以下 SARS-CoV-2 研究领域中加速获得拯救生命的发现:
为您的 SARS-CoV-2 研究需求组装独特的实时荧光定量 PCR 解决方案时,首先考虑您将使用的分析或应用类型:基因表达、遗传变异、或 miRNA 和非编码 RNA。针对每一种应用,我们提供了易于使用的端到端工作流程,并通过样本制备试剂、检测、预混液、仪器和分析软件组成的 协同生态系统提供支持。
对 SARS-CoV-2 的研究继续迅速发展,并且随着病毒的变体不断出现,了解病原体生物学和病毒-宿主相互作用的必要性变得至关重要。赛默飞世尔科技致力于提供全面的 qPCR 解决方案和相关信息,以加速获得能应对这种病毒的发现。
我们提供多种解决方案,从针对(如果不是全部) SARS-CoV-2 靶标的最常引用的预设计 Applied Biosystems TaqMan 检测试剂盒,到专门针对病毒进入因子、抗病毒限制因子和免疫信号转导介质而设计的新灵活阵列。
下载我们的解决方案手册,以了解我们为您的 SARS-CoV-2 研究提供的所有基因表达和遗传变异解决方案的更多信息。
深入了解病原体生物学和回答有关病毒-宿主相互作用的问题对于学习如何控制病原体和未来的变体至关重要。了解可使此可能拯救生命的研究更有效率的工具和解决方案,以助您更快地找到这些答案。
泡杯咖啡,然后观看以下两场以 SARS‑CoV‑2 研究为重点的在线点播网络讲座:
Archana Gupta 博士
应用研究员
基因科学,赛默飞世尔科技
Gupta 博士拥有免疫学和微生物学博士学位,
研究领域为病毒感染产生的慢性疾病。
Phillip Kilgas
基因表达测定和阵列产品经理
基因科学—qPCR,赛默飞世尔科技
Phillip 拥有神经科学学士学位,并在医学物理学领域进行了广泛研究。
实时荧光定量 PCR 是一项快速简便且经济实惠的技术,可用于定量测定病毒水平并进行基因表达、microRNA、SNP 基因分型和拷贝数变异分析。
SARS-CoV-2 是一种具有包膜的不分节段单股正链 RNA (+ssRNA) 病毒,并且是一种新近确认的 β 冠状病毒。SARS-CoV-2 以前并未在人类中出现,而且在病毒生命周期和发病机制方面存在许多未知。
检测和定量测定不同组织、培养物或标本中的 SARS-CoV-2 RNA,以阐明病原体生物学的基本原理,包括嗜性、复制动力学、传播和 发病机制 (1)。使用我们针对 SARS-CoV-2 N 和 S 基因而预设计的研究分析或使用定制引物和探针来检测其他目标病毒基因。
了解 SARS-CoV-2 基因变异性的表型影响,如 S 基因多态性残基 (2-4),从而深入了解感染性和致病性。使用我们的定制 TaqMan SNP 基因分型测定来检测目标变体或 SNP 时,可作为独立的工作流程或与 NGS 配合使用, 定量分析转录组学数据并对目标 SNP 进行后续研究。
探索病毒非编码 RNA 如何影响病毒生命周期和发病机制。近期的研究表明,病毒 miRNA 能够以表观遗传方式调节多条宿主信号转导通路,有助于免疫逃逸和发病机制 (5-8)。
与所有病毒一样,SARS-CoV-2 是一种专性细胞内病原体,需要宿主因子才能实现病毒进入、病毒 RNA 合成、病毒 mRNA 翻译以及病毒体装配。使用我们的实时荧光定量 PCR 解决方案 研究不同的宿主-病原体相互作用如何影响 病毒生命周期和发病机制。
通过研究 SARS-CoV-2 进入细胞所利用的宿主因子的表达模式 (9),包括 ACE2 受体 (1, 10-13)、TMPRSS2 丝氨酸蛋白酶 (12-14) 和 NRP1 (15),获得对病毒嗜性和传播的有价值的见解。 或者探讨宿主限制因子在抗病毒防御中的作用 (16-20)。我们的灵活内容检测产品组合包含多种研究病毒感染和疾病相关通路的新检测组合。
宿主遗传决定因素可影响对 SARS-CoV-2 的易感性或抗性 (20-22)。MGB 探针技术可对宿主等位基因中的单碱基差异进行较好的序列区分,使我们能提供预设计的测定,用于检测几乎所有的人类基因或 SNP。将我们的 TaqMan SNP 基因分型测定作为独立的工作流程或与 NGS 配合使用, 定量分析转录组学数据并对目标 SNP 进行后续研究。 探索我们精选的文献中已证明可影响 SARS-COV-2 严重程度的 SNP 列表。
研究在感染 SARS-CoV-2 后宿主 microRNA 如何 调节基因表达 (6,8,23)。已证明 miRNA 在调节 ACE2 和 TMRSS2 表达中起到重要作用 (6,24,25),这表明进一步的特征分析可能揭示有关宿主敏感性和 SARS-CoV-2 发病机制的重要见解。
感染 SARS-CoV-2 的后遗症存在很大差异,对无症状、轻度症状或急性疾病患者的先天免疫应答和适应性免疫应答的差异进行研究,对于了解疾病途径和可能的治疗靶标至关重要(20,26,28)。
研究在感染 SARS-CoV-2 后细胞因子、趋化因子和生长因子的差别基因表达如何调节信号转导通路 。已知 SARS-CoV-2 可使多条与炎症、氧化应激和早期抗病毒 T 细胞应答相关的通路 失调 (26,29-32)。
识别差异表达的宿主 microRNA,以了解这些分子在抑制或促进感染方面的作用,包括免疫细胞的扩增和活化或病毒对免疫系统监控的逃逸 (6,7,23,34)。
实时荧光定量 PCR 可应用于整个治疗产品和疫苗开发管线,研究人员能依此而 开发潜在的治疗产品,从而阻止病毒复制和扩散。
虽然 美国疾病控制与预防中心 (CDC) 发布的临床指南目前列出了与 SARS-CoV-2 相关的生物标志物,但研究人员迫切需要识别和开发其他生物标志物,作为潜在症状性感染和疾病进展的生物过程指标。
检查 SARS-CoV-2 患者中的差别基因表达通路,以识别新型生物标志物和 潜在治疗靶标 (20,26-28)。除了可以用于单重反应或多重反应以在单次反应中同时研究多个靶标的单个分析外,我们还提供了多种信号转导通路检测组合来同时探索多个靶标。
结合特异性病毒变体、模型系统或宿主遗传背景以识别生物标志物和靶标,从而了解宿主和病毒遗传决定因素如何影响对 SARS-CoV-2 的易感性或抗性 (20,21)。扩展的基因分型产品组合确保了我们有预设计的分析,以助您加速人和小鼠 SNP 基因分型的研究,同时我们的定制 SNP 基因分型 研究测定可开发用于任何易感染 SARS-CoV-2 的宿主生物。
分析可变的宿主 miRNA 表达,以识别血液中的潜在治疗靶标 (8,23,24,35) 或研究血液中的 microRNA 作为 SARS-CoV-2 的生物标志物 (34,36)。我们的通用 TaqMan miRNA 测定与组织和生物体液(包括血清和血浆)兼容,使其成为生物标志物研究的理想工具。
设计新的治疗产品需要多年的研究和大量的安全性和有效性试验,已确立安全性、药理学和毒理学数据的药物仍有可能再用于 SARS-CoV-2 研究。无论您是在研究新的候选化合物,还是在阐明现有药物的临床前景,实时荧光定量 PCR 解决方案均可加快您的研究。
进行宿主转录谱分析,以确定免疫基因(如促炎细胞因子和趋化因子)是否在给予潜在治疗产品后被激活或受调控 (29,37,38),或者定量测定给予抗病毒化合物前后的病毒 RNA。
识别编码药物代谢酶 (DME) 和相关转运蛋白的基因中的多态性,以阐明新药或再利用药物的有效性和潜在风险。TaqMan DME 测定利用我们高灵敏度和特异的 MGB 技术检测和鉴别重要的 PGX 遗传标记,涵盖 PharmaADME 工作组定义的 95% 的核心标记。我们提供超过 2,700 种独特的分析方法来检测 221 种基因中的多态性,包括单核苷酸多态性 (SNP)、多核苷酸多态性 (MNP) 和插入/缺失 (In/Del)。
使用我们的组织和血液兼容性 TaqMan miRNA 测定来分析宿主 miRNA 表达谱,以 研究对靶向治疗产品的反应 (7,36)。
实时荧光定量 PCR 是一款广泛用于疫苗研究和开发的不可或缺 工具,赛默飞世尔科技提供全面的实时荧光定量 PCR 产品组合,用于加速疫苗研究和开发。
进行宿主转录谱分析,以确定免疫基因(如促炎细胞因子和趋化因子)是否在给予这些疫苗和治疗产品后被激活或受调控 (39),或者定量测定感染或激发后的病毒 RNA (39-41)。
实时荧光定量 PCR 是一款广泛用于疫苗和治疗产品开发的不可或缺工具,包括定量测定病毒载体疫苗或基因疫苗的剂量以及监测病毒和生物生产培养物和储备液中的外源因子。
采用实时荧光定量 PCR 对核酸疫苗进行定量分析,确保疫苗生产时符合正确质量标准和剂量。实时荧光定量 PCR 测定提供金标准灵敏度、特异性和线性,非常适合定量分析核酸疫苗。
使用预设计的 TaqMan 基因表达测定来评估 大规模生物生产培养物和储备液中的微生物污染。我们的 TaqMan 测定以及定制引物和探针还可以实现在单次反应中多重检测多个靶标,实现更高的通量和更快的周转时间,以满足生产计划。
进行流行病学监测以定量分析 SARS-COV-2 感染在人群中的传播、影响该人群中感染易感性或清除的因素以及这些感染造成的健康和经济影响。这项研究也能为公共卫生政策的制定提供信息,帮助减少传播并改善临床成果。我们的检测、预混液和样本制备溶液组成的协调生态系统 可适应许多不同类型的样本。
病毒分型对于确定 SARS-COV-2 基因多样性的广度 和识别影响宿主感染的病毒变体至关重要。新一代测序 (NGS) 是 SARS-CoV-2 全基因组测序的理想工具,包括所有变体和潜在血清型,并且实时荧光定量 PCR 是验证 NGS 数据 和检测大量样本中特异性 SNP 或目标基因变体的金标准。
病毒监测对于确定传播模式和监测爆发遏制或缓解措施至关重要。监测还有助于了解病毒株的演变和人畜共患病的传播。实时荧光定量 PCR 为 SARS-CoV-2 疾病监测研究提供了所需的成本效益、通量和周转时间考量。
研究影响群体或大样本量中疾病的分布和模式的病毒和人类遗传决定因素。我们的预设计测定几乎可检测每个人类基因或 SNP,可立即用于 流行病学研究。 我们的定制测定设计工具可用于设计针对目标病毒 SNP 的测定,以监测病毒变体。
仅供科研使用,不可用于诊断目的。