invitrogen collibri library prep kits

提供多种 RNA 测序方法匹配您的实验目标,以满足您在基因表达、选择性基因表达、选择性基因剪切检测及预算方面的要求

  • 与其它同类建库试剂盒相比,全转录组建库或mRNA建库时间快至少50%以上
  • 使用 3’ mRNA测序,测序成本可降低多达90%
  • 使用ERCC对照来区分批次间差异和真正基因表达之间的区别
 collibri 3' mRNA stranded rna seq library prep kit

3’ mRNA 测序
collibri mrna seq library prep

mRNA 测序
collibri stranded rna seq library prep kit

全转录组测序
应用
  • 基因表达
  • 检测编码 RNA
  • 基因表达
  • 基因融合
  • 转录异构体
  • 对表型进行全面分析
  • 检测编码和非编码 RNA
  • 基因表达
  • 选择性基因表达
  • 基因和转录本丰度
  • 生物标志物鉴定
每个样本测序reads(百万)2–53060
动手操作时间(小时)1.751.53.5
总时间(小时)4.54.56.5
样本起始量范围100 pg–500 ng*1–25 ng**100–1000 ng
是否兼容 FFPE 样本
兼容的物种所有人、小鼠、大鼠

*建议样本起始量 >200 ng 以高效检测低丰度转录本。
**去除 rRNA 的 RNA 或富集的 mRNA

区分真正的基因表达和实验批次间差异

RNA-seq 表达数据的差异变化可归因于多种因素,包括原材料的质量和实验人员的操作差异。External RNA Controls Consortium (ERCC) 是由 National Institute of Standards and Technology (NIST) 主导的学术组织、私人组织和公共组织组成的一个特别小组,其开发了一套通用的外源 RNA 对照品,以区分这些变异性来源和真正的基因表达。对照物包括一组未标记的多腺苷酸化转录物,设计用于在样本分离后加入到 RNA 测序实验中,以根据定义的性能标准进行测量分析。

Invitrogen ERCC Spike-In Mix92是转录物的一种预制混合物,源于 NIST 认证的 DNA 质粒并可进行溯源。转录物模拟天然真核 mRNA,长度为 250 至 2,000 nt。将 ERCC 对照添加至 RNA 测序实验中,为基因表达实验中的数据比较建立了一套标准方法,从而可以检测实验的灵敏度(检测下限)和动态范围。

ERCC Spike-In Mixes 中的转录物摩尔比
图 1.ERCC Spike-In Mixes 中的转录物摩尔比。Spike-In Mix 1 和 Spike-In Mix 2 中的转录本分为四个亚组,其分子浓度比为定义的Mix 1:Mix 2。每个亚组包含跨 106 倍浓度范围的 23 个转录物,其转录物大小分布和 GC 含量大致相同。

仅供科研使用,不可用于诊断目的。