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Invitrogen Collibri Physically Sheared (PS) DNA Library Prep Kit 对于复杂基因组序列具有高覆盖度,不管是对于低丰度样本 (1 ng) 还是高丰度样本 (1,000 ng) ,均可提供一致的高覆盖度,适用于 Illumina 高通量测序系统。与 Illumina™、NEB™ 或 Kapa Biosystems™ 同类试剂盒相比,该建库试剂盒可确保高通量测序中更高的准确性。 可提供特有的双端标签 (UDI) ,以便排除 patterned flow cells 的 index-hopped reads。
Collibri PS DNA Library Prep Kit for Illumina Systems 和 Collibri PCR-Free PS DNA Library Prep Kit for Illumina Systems 可提供均一的 GC 覆盖度,增强了 1 到 1000 ng DNA 中单核苷酸多态性 (SNP) 和插入/缺失 (INDEL) 的检测能力。与其它文库制备方法相比,检测的灵敏度得到提高。
图 1.将 Coriell NA12878 DNA 制备成测序文库,并在 Illumina™NovaSeq™ 6000 系统上进行测序,每个样本测序数据为 372M reads。使用 FreeBayes v1.2.0 计算 SNP recall。
现在有多种方法可将 GC 偏好性降至最低,以获得均一的基因组覆盖度。
均一的 GC 覆盖度可实现对复杂基因组序列的高度覆盖,从而达到更均匀的全基因组覆盖。1 - 1,000 ng 样本中复杂基因组序列的覆盖度高度一致
图 2.使用制造商推荐的方案,将 100 ng 的 Horizon™ moderate damage FFPE DNA 制备成测序文库,并在Illumina NovaSeq 6000 系统上进行测序,测序长度为 2x150 bp。将得到的pass filter (PF) reads 归一化为 186 m reads。
在大型测序项目( 1–1000 ng DNA 样本起始量)中获得均一的的基因组覆盖度和一致的变异检测结果。
使用 Collibri PS DNA Library Prep kit 中加入 adaptor 过程中不需要进行 PCR 富集,PCR-free 建库方案适用于 500-1000 ng 的起始样本量。500 ng DNA 样本所获得的文库产量(经Collibri Library Quantification Kit检测),足以用来进行文库定量和在 Illumina NovaSeq 6000 系统上进行多次测序。
了解更多关于PCR-free kit 或 low input kit的信息。
图 3.使用制造商推荐的方案,将 Coriell NA12878 DNA 制备成测序文库,并使用 Collibri Library Quantification Kit 测量文库浓度。
通过使用更快的文库制备方案和实验流程,包括 DNA 提取、定量、文库制备和文库定量步骤,来助您提高实验室工作效率。以便您能将更多的时间用于科学研究,减少在实验疑难排除上花的时间。
我们可提供一系列的 Invitrogen 基因组 DNA 提取试剂盒,可用于从多种珍贵原始材料中进行灵敏、规模化的核酸纯化,以提高实验效率和确保下游实验结果。系列产品包括多种试剂盒,可从多种样本类型(包括组织、细胞、血液、血清、植物和法医样本等)中提取基因组 DNA。
使用基于磁珠的纯化技术和 KingFisher 仪器来实现 DNA 提取的自动化,用于结合、洗涤和洗脱 DNA,不仅可以减少动手操作时间,同时可保持高产量和出色的可重复性。
Qubit dsDNA high-sensitivity (HS) 和 broad-range (BR) assays 对双链 DNA (dsDNA) 的选择性高于对 RNA 和单链 DNA (ssDNA) 的选择性。high-sensitivity assay 推荐用于 dsDNA 浓度较低的样本,是珍贵样本的理想选择。
基于 qPCR 的 Collibri Library Quantification kit 适应通量较大样本的文库定量,同时也是珍贵样本或临床样本文库定量的理想方法。 Collibri Library Quantification kit 的定量准确性与 KAPA Library Quantification Kit 相当,另外在文库定量过程中还具有直观颜色变化提示的优势。
Qubit dsDNA HS Assay 是一种荧光检测试剂,使用 dsDNA 结合染料来准确定量 NGS 文库浓度,且每个样本只需几分钟的简单检测流程。
无论选择哪种检测方法,都需要良好的实验操作技术,以确保准确测量文库浓度和获得高质量的 Illumina 测序数据。
借助 Applied Biosystems QuantStudio 实时定量 PCR 系统,您可获得卓越的性能、可靠性及世界一流的支持服务,从中获得真正的价值。我们的仪器系列可使您能够获得所需的结果,与同事建立联系和协作,最终实现您的研究目标。
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Qubit dsDNA HS Assay 是一种荧光检测试剂,使用 dsDNA 结合染料来准确定量 NGS 文库浓度,且每个样本只需几分钟的简单检测流程。
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仅供科研使用,不可用于诊断目的。