MocrobeBridge

利用 MicrobeNet 数据库推进传染病监测

Applied Biosystems™ MicrobeBridge™ 软件平台是一种先进的软件解决方案，可通过 16S 测序技术将 Sanger 测序结果无缝连接到美国疾病控制和预防中心 (CDC) MicrobeNet™ 在线虚拟参考数据库。该软件使研究人员能够采用主题专家整理出的单一数据库，更快地识别引发全球疫情的微生物病原体。

目前，测序数据分析是一个零散的过程，涉及多个软件包。MicrobeBridge 软件使研究人员能够更轻易地访问存储在 MicrobeNet 数据库中的公共卫生信息，并且提供了实验室监测信息和疾病爆发的总体情况。

MicrobeBridge 软件集成了所有 Applied Biosystems 毛细管电泳仪，可以自动将原始 Sanger 测序数据组装成可在 MicrobeNet 数据库中搜索的格式，并且可以自动对数据进行 QC，从而大幅降低了匹配和正确识别样本所需的工作量。

图1： MicrobeBridge 软件更便于用户查看序列的整体组装质量，并可突出显示变异之间的差异，还可对组装序列进行 QC，并一键连接到 MicrobeNet 数据库以进行细菌鉴定。 

图2：利用 MicrobeNet 数据库将扩增子序列与细菌 16S rRNA 基因序列文库进行比对，以确定细菌种类。

“扩展 MicrobeNet 将使世界各地的公共卫生实验室都能进行基于序列的测试、表型测试，最终进行其他测试，并将结果与包含独特病原体集的精选数据库进行比对。随着 MicrobeBridge™ 的增加，研究人员和公共卫生实验室现在能够轻松获取 CDC 病原体主题专家所整理的数千种生物体的信息。”

－ John R. McQuiston，博士，团队负责人，CDC 高后果病原体和病理学部细菌及特殊病原体科特殊细菌学参考实验室


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产品文献

MicrobeBridge 软件常见问题

仅供科研使用，不可用于诊断目的。