Sanger 数据分析

我们提供广泛的 Applied Biosystems 软件解决方案组合,用于查看和解析您的 Sanger 测序和片段分析结果。了解以下的免费工具和市售产品。

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数据采集软件

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数据采集软件

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数据采集软件是一款用于仪器控制、数据采集、质量控制、碱基识别和样品大小识别的集成软件。仪器的操作取决于此软件。

Windows™ 7
Windows™ 10

SeqStudio 基因分析仪软件

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SeqStudio 基因分析仪软件是 SeqStudio 仪器上的嵌入式软件。不适用
科学平台,Sanger 测序解决方案支持从样品加入到测序的端到端样品跟踪,包括谱系、体积和浓度。使管理人员能够查找样品处理中的瓶颈,使实验室科学家能够在流程的每个步骤中识别准备进行处理的样品。科学平台

Sanger 测序软件

查看器
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Sequence Scanner 软件 v2.0

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序列扫描仪软件允许您在测序分析软件处理数据后查看、编辑、打印和导出使用 Applied Biosystems 基因分析仪器生成的数据。

Windows™ 7

质量检查模块

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质量检查 (QC) 模块可评估轨迹质量。易于解读的分析摘要提供了 Sanger 序列轨迹质量快照。“轨迹详细信息”页面允许您根据需要评估和编辑轨迹。“标记设置”页面允许您调整质量阈值。免费访问 Thermo Fisher Cloud
一级分析工具
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测序分析软件

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测序分析软件使用碱基识别算法,可识别纯碱基和混合碱基。该软件可分析、显示、编辑、保存和打印 Applied Biosystems DNA 分析仪和基因分析仪生成的样本文件。

Windows™ 7
Windows™ 10

Smart Deep 碱基识别软件

Smart Deep 碱基识别软件 (SDB) 采用了一种创新型新碱基识别算法,可让您获得优化后的 Sanger 测序结果,同时减少手动审核时间。Smart Deep 碱基识别软件可在测序分析软件 8 中使用。

备注:SDB 碱基识别可用于 SeqStudio Flex、SeqStudio、3730 和 3500 系列基因分析仪获得的数据。

Windows™ 10

二级分析工具
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Minor Variant Finder 软件

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Minor Variant Finder 软件使用 Sanger 测序,可检测到 5% 的体细胞变异。灵敏度的提高使得 Sanger 测序成为一种快速、经济且准确的方法,可以在相关靶标数量有限的情况下检测低频体细胞变异。

Windows™ 7 SP1(32或64位)或 Windows™ 10

SeqScape 软件

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SeqScape 软件是一款重测序软件包,专为突变检测和分析、SNP 发现和验证、病原体分型、等位基因识别和序列确认而设计。它提供了与已知序列组进行比较的文库功能,以及协助实现 21 CFR 第 11 部分合规性的功能(安全、审计和电子签名功能),这在临床研究实验室中至关重要。

Windows™ 7
Windows™ 10

Variant Reporter 软件

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Variant Reporter 软件专为参比和非参比法分析而设计,例如突变检测和分析、SNP 发现和验证以及序列确认。强大的算法将对使用 Applied Biosystems 基因分析仪生成的数据调用 SNP、突变、插入、缺失和杂合插入/缺失。

Windows™ 7
Windows™ 10

变异分析 (VA) 模块

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变异分析 (VA) 模块可对 Sanger 测序数据进行快速分析。VA 模块可以自动从基因组数据库中检索参考序列,报告具有基因组坐标的变异,并报告 SNP 的基因组注释。由于正向/反向链高度重叠,VA 模块对 SNP 识别具有相当高的灵敏度。VA 模块还以标准 .vcf 格式报告和导出变异文件。用户无需进行软件维护。免费访问 Thermo Fisher Cloud

二代测序确认 (NGC) 模块

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二代测序确认 (NGC) 模块可让用户将标准 NGS 变异文件的结果与赛默飞云环境中的 Sanger 测序仪生成的结果进行比较。
关键决策通常需要使用稳健的 Sanger 测序来验证 NGS 结果。NGC 模块可快速分析 AB1 文件并报告基因组坐标中的变异。结果会自动用当前基因组数据库中的已知 SNP 进行注释。
免费访问 Thermo Fisher Cloud

MicroSEQ ID 微生物鉴定软件

MicroSEQ ID 微生物鉴定软件是用于鉴定细菌和真菌的工具。该软件分析使用 Applied Biosystems MicroSEQ 化学试剂盒和基于毛细管电泳的 Applied Biosystems 基因分析仪生成的数据。Windows™ 7

MicrobeBridge 软件

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MicrobeBridge 软件是一款简化的桌面软件解决方案,可将 Applied Biosystems Sanger 测序仪生成的 DNA 序列与疾病控制与预防中心 (CDC) 的 MicrobeNet™ 数据库连接起来,使用 16S rRNA 基因测序分析进行细菌鉴定。无需建立本地数据库,可以轻松开发计算机资源。

Windows™ 7
Windows™ 10

SeqScreener 基因编辑确认应用程序 (SGC)

Applied Biosystems SeqScreener 基因编辑确认应用程序 (SGC) 是一款免费且方便使用的软件,用于确定 CRISPR-Cas9 实验中产生的突变的范围和频率。

免费访问 Thermo Fisher Cloud

片段分析软件
大小分析软件
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大小分析模块,Peak Scanner 软件

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Peak Scanner 模块是一款 DNA 片段大小分析软件,可执行 DNA 片段分析,根据 DNA 片段的大小分离混合物,提供分离曲线,并精确计算片段的大小。您可使用该软件查看、编辑、分析、打印和导出使用 Applied Biosystems 基因分析仪生成的片段分析数据。免费访问 Thermo Fisher Cloud

微卫星分析软件

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微卫星分析 (MSA) 软件是一款微卫星基因分型软件,可让您分析按大小分离的 DNA 片段混合物。该分析功能会提供分离曲线,精确计算片段的大小,并确定样品中存在的微卫星等位基因。微卫星分析通常用于癌症中的微卫星不稳定性、神经退行性疾病中的三联体重复扩增、物种鉴定和表征、人体样本鉴定。
免费访问 Thermo Fisher Cloud

Peak Scanner 软件

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Peak Scanner 软件是一款 DNA 大小分析软件,可以免费下载,也可以作为软件包免费获得。

使用该软件进行 DNA 片段分析,根据 DNA 片段的大小分离混合物,提供分离曲线,并精确计算片段的大小。您可使用该软件查看、编辑、分析、打印和导出使用 Applied Biosystems 基因分析仪生成的片段分析数据。

Windows™ 7

GeneMapper 软件

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GeneMapper 软件是一款灵活的基因分型软件包,可为所有基于毛细管电泳的 Applied Biosystems 基因分型系统提供 DNA 大小分析和质量等位基因识别。该软件专门提供多种应用功能,包括 Applied Biosystems 扩增片段长度多态性 (AFLP) 分析、杂合性缺失 (LOH)、微卫星和 SNP 基因分型分析。此外,安全和审核功能可帮助用户满足 21 CFR 第 11 部分的要求。

Windows™ 7
Windows™ 10

引物设计工具
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引物设计工具

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免费的在线引物设计工具,可让您从包含约650,000个预设计的引物对数据库中搜索合适的 PCR/Sanger 测序引物对,用于对人类外显子组和人类线粒体基因组进行重新测序。

网页工具

Methyl Primer Express 软件 V1.0

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Methyl Primer Express 软件 v1.0 可设计用于甲基化谱图实验的高质量 PCR 引物。直接剪切并粘贴目标区域即可。该工具会搜索 CpG 岛并在计算机模拟中模拟 DNA 的亚硫酸氢盐修饰。 

仅供科研使用,不可用于诊断目的。