Digital lab for fast visualization and segmentation of complex paleontological, archeological, and anthropological specimens and artifacts.

Paleontologists and comparative biologists increasingly use volumetric imaging to enable exciting discoveries. Thermo Scientific Avizo Software offers a suite of trusted digital tools for viewing, digitally dissecting, and measuring such 3D data. Compelling animations and publication-quality figures can be rendered from data segmented using manual and automated tools. Texture classification and deep learning assist with challenging segmentation of bone from matrix or labeling contrast-enhanced CT. Routine tasks, such as trabecular bone analysis and endocast extraction, can be automated and shared as reproducible recipes. Interactive image processing with Image Stack Processing quantitatively measures microanatomy from thin section paleohistology. Extensions to Avizo Software enable quick tetra meshing for FEA and sophisticated DVC for biomechanics. Surfaces extracted from CT data can be viewed, edited, and optimized for 3D printing or digital sharing. Overall, Avizo Software provides a complete digital suite for these increasingly digital sciences.

Imaging data

Workflow using Avizo Software

Processing

Workflow using Avizo Software

Visualization

Workflow using Avizo Software

Analysis

Workflow using Avizo Software

カスタマイズ

信頼性

当社のデジタルイメージングベースのワークフローは、パワフルなセグメンテーションや画像処理能力およびワークフローを備えており、また科学コミュニティや数千人もの研究者との20年以上にわたるコラボレーション実績があるため、産業および科学分野の問題に対して信頼できる答えを提供することが実証されています。

カスタマイズ

カスタマイズ

お客様のニーズはそれぞれ異なり、常に進化しているため、当社のソフトウェアソリューションは非常に柔軟で、自由にカスタマイズできます。当社のスクリプトインターフェース(Python、TCL)、MATLABとのブリッジ、およびプログラミングAPIを利用することにより、当社のソフトウェアソリューションを拡張し、お客様独自のIP(知的財産)を統合できます。また必要に応じて、当社のプロフェッショナルサービスチームがお客様のニーズに合わせた独自ソリューションの設計をお手伝いします。

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サポート

当社は専用のプロフェッショナルサポートチームを配備しているため、トップエキスパートに問い合わせて、あらゆる質問に対する回答を得ることができます。また、当社のトレーニングやコンサルティングオプション、拡張し続けているチュートリアルやハウ・ツーを活用することで学習時間を短縮し、追求している答えを見つけることに集中できます。

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自動化

自動化機能や拡大を続けるアドオンのオンラインレポジトリ(Xtra Gallery)により、繰り返し可能なワークフローを再現が容易なレシピに変換きます。人工知能が追加されているため、画像処理専門家以外でも分析が可能で、複雑な分析に費やす時間を短縮しながら結果の一貫性を維持できます。


Scientific use cases using Avizo Software


Techniques

繊維解析

Avizo Softwareは、繊維質材料の視覚化、処理、および定量するためのオール・イン・ワンイメージ分析プラットフォームです。Avizo Softwareは、マトリックスの割れ、繊維/マトリックス剥離、または繊維破損などの製造プロセスでの損傷を検出できます。材料の欠陥は局所(隙間、割れ)、または全体(断面のゆがみ、または不均等)で定量できます。

詳細を見る

多孔性分析

Avizoソフトウェアは、多孔物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。Avizoソフトウェアを使用すると、複雑なアーチファクト(FIB-SEMにおけるポアバック効果など)を伴う画像でも、さまざまな種類の多孔性(結合型と分離型、マクロ細孔とマイクロ細孔など)の検出と分類が可能になります。

 

細孔ネットワーク分析

Avizoソフトウェアは、多孔物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。この拡張機能を使用すると、孔隙をモデル化(細孔ネットワークモデル)して細孔とその接続性を示すことができます。このモデルでは、さまざまな特性のカラーマッピングが可能です。高度な孔隙統計(細孔サイズ分布、細孔スロートサイズ分布、チャネル長など)の取得や、特性に基づくモデルのフィルタリングも行えます。

透過性分析

Avizoソフトウェアは、物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。Xlab拡張機能は、絶対透過性、熱伝導率、電気抵抗率、分子拡散率を計算するための数値シミュレーション機能を提供します。

不良解析

Avizoソフトウェアには、3Dラベル付き画像からシミュレーション対応メッシュを自動作成する、高速かつ堅牢なメッシュエンジンが搭載されています。Avizoソフトウェアは、大型の複数物質セグメント画像から、スムーズなコンフォーミングインターフェースを使用して高品質メッシュを生成できます。Avizoソフトウェアでは薄い構造とトポロジーが保持されるため、要素サイズ分布を細かく制御できます。メッシュは、境界条件と併せて一般的なソルバー形式でエクスポートできます。また、高度な視覚化ツールを使用して結果の後処理を行うために、ソルバーの出力をインポートすることも可能です。

 

粒子分析

Avizo、粒子の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析ソフトウェアです。Avizoソフトウェアは高度なツールを提供し、アーチファクトを伴う複雑な画像上でも、粒子、粒子サイズ、分布、形状の検出、セグメンテーション、分析を可能にします。その後、粒子のフィルタリング、分類、分析を行い、サイズ、分布、形状の詳細な統計抽出を行えます。Avizoソフトウェアでは、カスタマイズの簡単なレシピで分析を自動化し、繰り返すためのツールも使用できます。

 

粒子分析

Avizo、触媒、合金、ポリマーなどの物質の粒子を可視化、処理、定量化して物質性能を高めるためのオールインワン画像解析ソフトウェアです。Avizoソフトウェアには、粒子の検出、セグメンテーション、分析を可能にする高度なツールが搭載されています。その後、粒子のフィルタリング、分類、分析を行い、サイズ、分布、形状の詳細な統計抽出を行えます。Avizoソフトウェアでは、カスタマイズの簡単なレシピで分析を自動化し、繰り返すためのツールも使用できます。

 

繊維解析

Avizo Softwareは、繊維質材料の視覚化、処理、および定量するためのオール・イン・ワンイメージ分析プラットフォームです。Avizo Softwareは、マトリックスの割れ、繊維/マトリックス剥離、または繊維破損などの製造プロセスでの損傷を検出できます。材料の欠陥は局所(隙間、割れ)、または全体(断面のゆがみ、または不均等)で定量できます。

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多孔性分析

Avizoソフトウェアは、多孔物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。Avizoソフトウェアを使用すると、複雑なアーチファクト(FIB-SEMにおけるポアバック効果など)を伴う画像でも、さまざまな種類の多孔性(結合型と分離型、マクロ細孔とマイクロ細孔など)の検出と分類が可能になります。

 

細孔ネットワーク分析

Avizoソフトウェアは、多孔物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。この拡張機能を使用すると、孔隙をモデル化(細孔ネットワークモデル)して細孔とその接続性を示すことができます。このモデルでは、さまざまな特性のカラーマッピングが可能です。高度な孔隙統計(細孔サイズ分布、細孔スロートサイズ分布、チャネル長など)の取得や、特性に基づくモデルのフィルタリングも行えます。

透過性分析

Avizoソフトウェアは、物質の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析プラットフォームです。Xlab拡張機能は、絶対透過性、熱伝導率、電気抵抗率、分子拡散率を計算するための数値シミュレーション機能を提供します。

不良解析

Avizoソフトウェアには、3Dラベル付き画像からシミュレーション対応メッシュを自動作成する、高速かつ堅牢なメッシュエンジンが搭載されています。Avizoソフトウェアは、大型の複数物質セグメント画像から、スムーズなコンフォーミングインターフェースを使用して高品質メッシュを生成できます。Avizoソフトウェアでは薄い構造とトポロジーが保持されるため、要素サイズ分布を細かく制御できます。メッシュは、境界条件と併せて一般的なソルバー形式でエクスポートできます。また、高度な視覚化ツールを使用して結果の後処理を行うために、ソルバーの出力をインポートすることも可能です。

 

粒子分析

Avizo、粒子の可視化、処理、定量を行うためのオールインワン画像解析ソフトウェアです。Avizoソフトウェアは高度なツールを提供し、アーチファクトを伴う複雑な画像上でも、粒子、粒子サイズ、分布、形状の検出、セグメンテーション、分析を可能にします。その後、粒子のフィルタリング、分類、分析を行い、サイズ、分布、形状の詳細な統計抽出を行えます。Avizoソフトウェアでは、カスタマイズの簡単なレシピで分析を自動化し、繰り返すためのツールも使用できます。

 

粒子分析

Avizo、触媒、合金、ポリマーなどの物質の粒子を可視化、処理、定量化して物質性能を高めるためのオールインワン画像解析ソフトウェアです。Avizoソフトウェアには、粒子の検出、セグメンテーション、分析を可能にする高度なツールが搭載されています。その後、粒子のフィルタリング、分類、分析を行い、サイズ、分布、形状の詳細な統計抽出を行えます。Avizoソフトウェアでは、カスタマイズの簡単なレシピで分析を自動化し、繰り返すためのツールも使用できます。

 

Services

Amira-Avizo-Introductory-training_1160x600

初級者向けトレーニング

Amira、Avizo、およびPerGeosソフトウェアの新規ユーザー用に設計された初級者向けトレーニングは学習速度を高め、投資を最大化します。

このコースは講義と実践セッションで構成されています。トレーニング教材は、Amira、Avizo、およびPerGeosソフトウェアの基本的な特長や機能を取り上げています。

Amira-Avizo-advanced-training_1160x600

上級者向けトレーニング

Amira、Avizo、およびPerGeosソフトウェアの既存ユーザー用に設計された上級者向けトレーニングは投資を最大化し、結果までの時間の短縮します。

このコースは講義と実践セッションで構成されています。トレーニング教材は、Amira、Avizo、およびPerGeosソフトウェアの高度な特長や機能を取り上げています。

Amira-Avizo-Custom-Dev_1160x600

カスタム開発

サーモフィッシャーサイエンティフィックには25年以上にわたる3Dおよび画像処理の経験と、大小の規模の組織に提供してきたカスタムプロジェクトの実績があり、お客様の独自のニーズに合わせてソリューションを提供できます。

当社のソフトウェアソリューションをさまざまなレベルでカスタマイズおよび拡張できます。


Resources

Avizo Software for Digital Volume Correlation to understand the dessication process in Egyptian crocodile mummies.

Amira for Advanced Image Processing and Quantification - Automatic tooth analysis.

Amira is used by UZ Leuven(Belgium) for postoperative evaluation of orthognathic patients to quantify the accuracy of the surgical outcome of bimaxillary surgeries by comparing it to the 3D virtual preoperative planning.

Avizo Software for Digital Volume Correlation to understand the dessication process in Egyptian crocodile mummies.

Amira for Advanced Image Processing and Quantification - Automatic tooth analysis.

Amira is used by UZ Leuven(Belgium) for postoperative evaluation of orthognathic patients to quantify the accuracy of the surgical outcome of bimaxillary surgeries by comparing it to the 3D virtual preoperative planning.

Features

Import and process your imaging data

    • Handle any modality, at any scale, of any size:

    - X-ray tomography: CT, micro-/nanoCT
    - Electron microscopy
    - Synchrotron

    • Support for multi-data/multi-view, multi-channel, time series, very large data
    • Scaling, calibration, conversion, re-sampling
    • Image enhancement, comprehensive filtering and convolution, Fourier frequency transforms
    • Artifact reduction algorithms
    • Advanced multi-mode 2D/3D automatic registration
    • Image stack alignment, arithmetic, correlation, fusion

    Easily segment your imaging data

    • Thresholding and auto-segmentation, object separation, automatic labeling
    • Region growing, snakes, interpolation, wrapping, smoothing
    • Morphological processing, including watershed and basins
    • Machine Learning-based segmentation
    • Automatic tracing of individual fibers and filaments
    • Skeletonization and filament network extraction
    • 3D surface reconstruction
    • Grid generation for FEA/CFD

    Image-to-simulation workflows

    • 3D image-based meshing for Finite Element and CFD
    • Porosity/pore connectivity analysis and skeletonization for Pore Network Modeling
    • Direct 3D image-based simulation: absolute permeability, molecular diffusivity, electrical resistivity, and thermal conductivity computation

    Export your analysis and visualization work to seamlessly publish and present it

    • Animation and video generation
    • Advanced key frame and object animation
    • Mix images, geometric models, measurements and simulations
    • Annotations, measures legends, histograms and curve plots
    • Export spreadsheets, 3D models, high-quality images

    Visualize and explore your imaging data

    • Interactive high-quality volume
    • Orthogonal, oblique, cylindrical and curved slicing
    • Contouring and iso-surface extraction
    • Maximum Intensity or other types of projections
    • Vector and tensor visualization

    Analyze your imaging data and obtain quantitative information

    • Intuitive recipe creation, customization, automated replay
    • Built-in measurements, including counts, volumes, areas, perimeters, aspect ratios and orientations
    • User-defined measures
    • Results viewer with spreadsheet tool and charting
    • Automatic individual feature measurements, 3D localization and spreadsheet selection
    • Automated statistics, distribution graphs
    • Feature filtering using any measurement criterion
    • Data registration, deformation, comparison and measurements
    • Porosity detection and measurement
    • Fiber analysis
    • Pre-processing for structural and flow simulations
    • Import of CAD models for actual/nominal comparison

    Easily and quickly adapt Avizo Software to your specific needs

    • Custom C++ modules development
    • MATLAB™ bridge
    • Python scripting API

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