生命科学および生物医科学科向けの Amira

2D-5D 画像解析ソフトウェア

Thermo Scientific Amira Software は、光学／電子顕微鏡画像、CT 画像、MRI 画像などのさまざまな画像取得装置のデータをもとに生命科学データや生物医学研究データの可視化・解析・把握を行う高性能かつ 2D-5D 画像解析ソリューションです。

驚異的な速度と柔軟性を兼ね備えた Amira Software は、構造生物学、細胞生物学から組織イメージング、神経科学、前臨床イメージング、生体工学に至るまでの各種研究分野における先進的な 2D–5D バイオイメージングワークフローをサポートします。

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生きている細胞とそのプロセスを理解するためには、さまざまなファイルフォーマットを使用するさまざまなイメージングシステムとモダリティのデータを解析する必要があります。実験のセットアップの際には、データ処理を行うにあたり独自の課題に直面することがあります。マルチスケールの動的プロセスでは、回折限界の粒子から細胞全体まで、さまざまなサイズのオブジェクトの追跡が必要です。データセットには数十から数万のオブジェクトが存在する場合があります。さらに、細胞内プロセスは細胞内構造によって支えらており、これも特定および定量化する必要があります。
Amira ソフトウェアは、細胞プロセスの時系列データを柔軟かつ正確に分析するため、さまざまなツールを備えています。研究者は、細胞内および細胞間画像に対して専用のセグメンテーションワークフローが実行でき、パワフルで自動化されたオブジェクトトラッキングの適用が可能です。

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線虫の細胞と細胞核Images collected with TLS-SPIM, Liang Gao lab, Stony Brook University.

神経科学

脳と神経機能の研究には、細胞の準備から画像の取得・分析まで、実験方法の幅広い選択に関する知識が必要です。
Amira ソフトウェアは、フィラメントトレースと編集、DTI 分析、脳灌流解析、オブジェクトトラッキングなど、もっとも頻繁に使用される画像分析技術において研究者を支援することを目的としています。Amira ソフトウェアの汎用性と最新の 3D 可視化および画像処理を組み合わせることで、研究者は画像から目的の種類の情報を正確に抽出するカスタムワークフローを作成できます。

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前臨床・臨床研究におけるイメージング

前臨床画像解析は、PET、SPECT、または光学イメージング機器からの機能データを使用した、マイクロ CT または MRI システムからの構造情報の拡張に基づいています。新薬候補の分析では、経時的な構造を捉える検査装置から得られた動物の解剖学的構造の画像内において、機能を捉える検査装置により取得された動的プロセスの位置を特定することが必要です。
Amira ソフトウェアにより、あらゆるタイプの前臨床画像データの融合が可能となります。互いに位置合わせされた画像は、Amira ソフトウェアの画像解析フィルターとアルゴリズムの膨大なライブラリを使用して、セグメンテーションおよび解析が可能です。画像セグメンテーションと定量化ワークフローは、動的プロセスの画像データの時系列全体に適用できます。Amira ソフトウェアのプロフェッショナルな可視化ツールを使用することで、CT および MRI から取得された構造情報により、セグメンテーション結果と機能画像を重ね合わせてレンダリングし、発症機序を明らかにする生理学的プロセスを直感的なアニメーションで可視化できます。

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