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Vector NTI® Advance softwareは、現在市販されている中で最も高度に統合された、多機能のデスクトップ型シーケンス解析パッケージソフトです。高度な統合、データ管理、スケール対応を可能にします。

Vector NTI®のバージョン11.5は、Parallels®5for Macを使用することによりMac OS X上で作動可能で、再起動を必要とせずシームレスに既存のMacアプリケーションと同時作業ができます。

Vector NTI®11.5の新機能

新しいDNAクローニングおよびゲノムスケールのアセンブリをサポートするワークフロー

 

GENEART® Seamless Cloning and Assembly KitおよびGENEART® High-Order Genetic Assembly Systemは、Life Technologiesが開発した次世代のクローニングツールであり、お客様の研究室で分子生物学および合成生物学の研究プロジェクトを実施可能にします。 上記の新しいツールは制限酵素、ライゲーション、または組換え部位に依存しません。 代わりに、DNA断片末端のホモロジーを利用し、目的のDNA配列をシームレスに直接アセンブルします。 Vector NTI®のバージョン11.5では、これらのワークフローをLocal Databaseで実施できるようになっています。

今後、お客様はアセンブルしたい配列を自由に指定し、ソフトウェアがバリデーションを実行し、適用できる場合は、PCR用またはスティッチング用のオリゴを設計するということが可能になります。

 

GENEART® Seamless CloningおよびHigh-Order Genetic Assembly詳細

新バージョンではさらにBioBrick™機能性も備わっています。 BioBrick™は合成生物学における重要なスタンダードを包括しており、「パーツ」と呼ばれる短く機能的なDNA断片の基本的な生成および操作をサポートしています。 アセンブルしたパーツからは「デバイス」を生成することができます。 Vector NTI®のバージョン11.5では、BB10、BB15、BB21、BB23、BB25およびBB36の仕様をサポートするBioBrick™ Assemblyワークフローを導入しています。

BioBrick™はBioBricks財団の商標です。 BioBrick™使用に関して資金供与、提携または是認はありません。 BioBrick™およびBioBricks財団についての詳細はhttp://bbf.openwetware.orgをご覧ください。

Mac適合性および拡張OSサポート

 

Macユーザーのお客様は、Parallels Desktop®5for Macをインストールしていただくことで最新バージョンのVector NTI Advance® softwareが持つパワーをフルに実感していただけます。Parallels Desktop®5for MacによりWindowsとMac OS Xのシームレスな同時使用が可能になり、OS間でファイルをドラッグアンドドロップでき、再起動することなくMacでWindowsのソフトウェアを使用できます。 さらにVector NTI® softwareはIntel®ベースのMacにおいてWindows® XP Pro上で作動できます。

Parallels Desktop® for Macについての詳細

PCユーザーのお客様は、日本語版を含むWindows®7、Vista、およびXP Pro上でVector NTI®をご使用いただけます。

TaqMan® Gene Expression Assayオンライン検索のための改良されたプロトコール

 

100万種を超える設計済みのTaqMan® Gene Expression Assay(在庫品または受注生産品)はLife TechnologiesのApplied Biosystems®セクションからご購入いただけます。 Vector NTI®のバージョン11.5では、配列またはサブ配列を、Vector NTI®から、検索およびCustom Design toolへと(別々に)送ることができ、ユーザーはシームレスに在庫品または受注生産品のTaqMan® Gene Expression Assayを検索、またはカスタムアッセイ設計の請求をすることができます。このように、Vector NTI®とオンラインリソースの一段階上の相互運用が可能になっています。

  • 設計済みのTaqMan® Gene Expression Assayを検索する際には、そのワークフローのほとんどをVector NTI® software内から操作することができます。 アッセイの検索から始めて、検索結果の製品をショッピングカートに追加し、Applied Biosystemsに発注することができます。
  • Database ExplorerまたはMVからは、配列の全体または一部を選んでCustom Assay Design Toolを呼び出すことができます。 配列のローカルリストを管理し、Applied Biosystems®のウェブサイトへ一斉に送ることができます。

Applied Biosystems®3500Systemのファイル形式をサポート

 

Vector NTI®のモジュールContigExpress(CEX)により、3500で生成された.ab1形式のファイルをCEX Project Windowにインポートできます。Menu OptionからCEX Project Windowにドラッグアンドドロップします。 Chromatogram ViewerにおいてV11.5は3500独自のタグ情報を表示できます。またユーザーはどのタグ情報を表示するかを「View Options」で設定できます。

プライマー―テンプレートアライメントインターフェース

 

Vector NTI®モジュールのMolecule Viewer(MV)ウィンドウで、テンプレート配列にプライマーをマッピングする機能は広く使われています。 最新バージョンでは、MVのモチーフを右クリックすることで、プライマーとテンプレート間のアライメントを塩基レベルで表示することができます。 さらに、Vector NTI® Report Generatorではテキスト形式またはGenBank®データベース形式で、1塩基ごとのモチーフアライメントを表示できます。

数千分子を扱うことができる本格的なパフォーマンス

V11.5ではLocal Databaseのパフォーマンスが向上し、最大で32,000のDNA/RNA/タンパク質分子、100,000のオリゴヌクレオチド、100,000の引用レコード、100,000のBLAST結果、100,000の解析結果、および5,000のGel MarkerレコードをLocal Databaseに保存できるようになりました。それでも深刻なパフォーマンスの低下は起こりません。

新機能はまだまだあります!

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