TaqMan® OpenArray® Genotyping プレートは、設計済みまたはカスタムメイドの TaqMan® SNP Genotyping Assays、あるいは TaqMan® Drug Metabolism (DME) Assays を選択して、カスタムデザインすることが可能で、1日当たり7万を超えるジェノタイピングを処理できます。

シンプルなワークフロー

TaqMan® OpenArray® Genotyping プレートは、ご指定いただいた TaqMan® SNP Genotyping Assays をお客様の仕様で 6 種類のフォーマットから選択可能なプレートのスルーホールに予め分注後、乾燥させた状態で供給されます。あとは、サンプルと TaqMan® OpenArray® Genotyping Master Mix を混合して、OpenArray® プレートにロード後、密閉して、PCRを実施し、データを表示させるだけです。OpenArray® リアルタイム PCR システムのワークフローは、自動分注ロボットを必要とせずに一人で 1 日最大 256 SNP に対して 1,500 以上の検体の検証およびスクリーニングを行うことを可能とします。従って、1 日当たりの一人の処理能力は 70,000 以上のジェノタイピングとなります。

幅広いアプリケーション

このシステムは、複雑な疾患の関連性、マーカー支援選抜、あるいは大きなサンプルサイズが必要とされる他の研究のスクリーニングおよび検証に高い性能と再現性を提供します(図 1 および 2)。


図 1:サンプルサイズが大きいほど、検出感度が上昇


図 2:型判定できた SNP の割合および一致率

仕様

表 1:ヒト細胞株 DNA および 896 の TaqMan® SNP Genotyping Assays を使用した、OpenArray® リアルタイム PCR システムの実測性能 

特性性能*
Applied Biosystems® 7900HT リアルタイム PCR システムからのアッセイ変換率>95%
Applied Biosystems® 7900HT リアルタイム PCR システムでランしたアッセイの一致率99.7%
判定率>95%

表 2:TaqMan® OpenArray® Genotyping プレートフォーマットオプション

プレートフォーマットサンプル数/プレート最小注文枚数総サンプル数/最小注文枚数
12 アッセイ144101,440
26 アッセイ9610960
60 アッセイ4820960
120 アッセイ2440960
180 アッセイ1660960
240 アッセイ1280960