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Invitrogen链霉亲和素偶联的Dynabeads 磁珠是一种强大的多功能工具,可用于捕获特定 RNA 或 DNA 序列,然后将其直接从溶液中提取出来。这些单一尺寸的超顺磁性 Dynabeads 为硝酸纤维素膜提供了高效的固相替代方法,可为您提供优异的产物质量和数据一致性。出色的近液相反应动力学,可实现超快速实验方案。磁性处理固有的简便性使得下游操作和缓冲液更换非常简单,只需要使用磁力架将磁珠结合靶标吸附浓缩到管壁上,然后丢弃上清液即可。这些磁珠可兼容非常广泛的样本类型,包括大多数体液、植物、动物和微生物来源的粗裂解物,以及纯化的总 RNA 或 DNA。由于这些 Dynabeads 磁珠仅与特定的靶标 RNA 或 DNA 分子相互作用,因此几乎不需要对总 RNA 或 DNA 进行上游纯化。进一步了解为什么链霉亲和素偶联 Dynabeads磁珠已被30,000多份研究文献引用。
直接捕获流程涉及到将双链 PCR 产物固定在磁珠上。这些产物很容易转化为单链磁珠结合模板,然后直接从溶液中捕获特定的 RNA 或 DNA 分子。
在某些情况下,另一种间接捕获方法可实现更快的反应动力学。这种间接捕获方法可以在靶标固定到磁珠之前捕获靶标序列。首先,将生物素化捕获序列(单链 DNA)与样本一起孵育,让其与溶液中的靶标 RNA 或 DNA 分子杂交。然后将链霉亲和素偶联的 Dynabeads 磁珠加入混合物中,杂交序列会通过链霉亲和素-生物素键固定到 Dynabeads 磁珠上。
每毫克 1μm Dynabeads MyOne 链霉亲和素 C1磁珠 具有非常大的表面积,可高度富集低丰度的 RNA 或 DNA。如果需要从粘稠度较高的样本(如脑脊液)中捕获核酸时,建议使用粒径更大的 2.8 μm Dynabeads M-270 链霉亲和素磁珠。 这些 Dynabeads(MyOne 链霉亲和素 C1 和 M-270 链霉亲和素)磁珠经过优化设计,表面略带负电荷,可确保对非靶标核酸序列的非特异性结合微乎其微。
应用实例包括:RNA/DNA 致病因子分离 (1,2,3,4)、扣除杂交 (5,6,7)、cDNA 筛选和富集、突变序列检测和分离 (8,9,10)、细胞特异性转录本分离以及 mRNA 差异显示。
了解有关核酸捕获测定的更多信息
DNA 纯化是有针对性地去除样品中不需要的片段和杂质,比如NGS 接头、引物、引物二聚体、未掺入的 dNTP 和其他反应组分等。片段筛选则是在进行测序步骤前从准备好的 DNA 片段文库中选择所需大小范围的特定 DNA 片段。由于PCR纯化和片段筛选的不准确会极大地影响下游测序的效率和准确性,因此,可以说纯化和片段筛选是NGS文库制备工作流程中的关键步骤。