Search Thermo Fisher Scientific
微卫星标记分析
微卫星标记是包含重复核苷酸序列的共显性多态性 DNA 基因座，通常每个重复单位有2到10个核苷酸。对于单个微卫星基因座内的大多数重复，重复单元中的核苷酸数量是相同的，但特定基因座的重复数量可能不同，从而产生不同长度的等位基因，这可以通过毛细管电泳的片段分析进行分析。由于微卫星标记受孟德尔遗传的影响，因此长度变异分析是一种广泛接受的应用工具，如微卫星不稳定性 (MSI) 分析。
微卫星不稳定性 (MSI) 分析
MSI 是一种基因组不稳定性形式，由于功能性错配修复 (MMR) 蛋白失调，导致复制期间插入或缺失 (indel) 在微卫星中积累。错配修复蛋白负责纠正 DNA 聚合酶在复制过程中产生的错误。它们通过识别 DNA 聚合酶滑动时产生的临时插入-缺失环来实现这一点。当插入-缺失环导致移码突变 (indel) 时，具有功能性 MMR 蛋白的细胞积累错误，导致在微卫星基因座出现新的等位基因，这可以通过片段分析很容易地识别。
除了癌症筛查外，最近还发现 MSI 能够预测对免疫疗法的反应。具有缺陷 MMR 蛋白质的肿瘤通常具有产生免疫原性新蛋白的突变的体细胞。这种肿瘤会引发免疫反应，并表现出对免疫疗法的易感性。
MSI 分析涉及比较正常样本和疾病样本中特定微卫星标记的等位基因图谱。
用于微卫星不稳定性分析的新 TrueMark MSI 测定
体验更高效、更具综合性的 MSI 检测，自动识别，无需常规控制，并扩展了13个 MSI 标记检测组合。
其他应用
嵌合体是一个用于描述单个生物体中发生遗传不同细胞类型的术语，此类细胞类型可能由输血或移植引起，也可能为遗传（例如，在植物中）。在骨髓移植的情况下，供体和受体细胞的相对数量可以用来确定是否已经进行了移植。
嵌合体可通过基于 PCR 的灵敏方法和微卫星标记分析进行监测。我们的3500系列基因分析仪具有灵敏度、数据质量和精密度，结合我们的五色化学分析和预优化运行条件，可为嵌合分析创造理想的解决方案。
短串联重复序列 (STR) 是由2至13个核苷酸组成的重复 DNA 基序。STR 分析测量重复单元的确切数量，并比较来自两个或多个样本的 DNA 上的特定基因座。 STR 分析的用途包括细胞系鉴定、人类生物样本库样本匹配和离体细胞治疗跟踪。
图1.在单个毛细管中共电泳的18个微卫星基因座的数据。Applied Biosystem 五种染料化学染色增加了可以在单个毛细管中运行的微卫星标记的数量，从而尽量提高了通量。
简单序列间重复 (ISSR) 分析是一种基于微卫星之间区域发现的变异而常用于 DNA 指纹识别的技术，主要用于植物物种。由于 ISSR 可能是一个保守或非保守的区域，这种技术不适用于区分个体，但具有广泛的研究应用，包括表征群体中的遗传相关性、遗传指纹识别、基因标记、克隆变异检测、品种鉴定、系统发育分析、基因组不稳定性的检测以及杂交的评估。
ISSR-PCR 使用单一荧光标记引物靶标，在相同微卫星之间扩增区域。其结果是由长度不同的短链扩增 DNA 链混合物产生。
嵌合体是一个用于描述单个生物体中发生遗传不同细胞类型的术语，此类细胞类型可能由输血或移植引起，也可能为遗传（例如，在植物中）。在骨髓移植的情况下，供体和受体细胞的相对数量可以用来确定是否已经进行了移植。
嵌合体可通过基于 PCR 的灵敏方法和微卫星标记分析进行监测。我们的3500系列基因分析仪具有灵敏度、数据质量和精密度，结合我们的五色化学分析和预优化运行条件，可为嵌合分析创造理想的解决方案。
短串联重复序列 (STR) 是由2至13个核苷酸组成的重复 DNA 基序。STR 分析测量重复单元的确切数量，并比较来自两个或多个样本的 DNA 上的特定基因座。 STR 分析的用途包括细胞系鉴定、人类生物样本库样本匹配和离体细胞治疗跟踪。
图1.在单个毛细管中共电泳的18个微卫星基因座的数据。Applied Biosystem 五种染料化学染色增加了可以在单个毛细管中运行的微卫星标记的数量，从而尽量提高了通量。
简单序列间重复 (ISSR) 分析是一种基于微卫星之间区域发现的变异而常用于 DNA 指纹识别的技术，主要用于植物物种。由于 ISSR 可能是一个保守或非保守的区域，这种技术不适用于区分个体，但具有广泛的研究应用，包括表征群体中的遗传相关性、遗传指纹识别、基因标记、克隆变异检测、品种鉴定、系统发育分析、基因组不稳定性的检测以及杂交的评估。
ISSR-PCR 使用单一荧光标记引物靶标，在相同微卫星之间扩增区域。其结果是由长度不同的短链扩增 DNA 链混合物产生。
微卫星标记分析工作流程
微卫星标记分析涉及使用荧光标记引物在重复序列侧翼进行微卫星基因座 PCR 扩增。然后通过 CE 分析标记的 PCR 产物，以按大小分离扩增子。
知识积累
获取日常 Sanger 测序和片段分析问题的简短答案
了解测序的历史，以及如何选择适合您研究需求的平台。