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Sanger测序+片段分析(Seq + FA)应用将传统的Sanger测序与AppliedBiosystems®基因分析仪的高精度片段大小调整功能相结合。通过结合这两种技术的优势,该新应用可以:
推荐将Seq+FA应用用于:
对照其他主要技术测试了Seq + FA应用的灵敏度极限。要阅读完整的研究,请下载“提高Sanger测序的检测限KRAS变异检测方法的比较”。
Seq+FA 工作流程通过在BigDye Terminatorv1.1测序反应的一部分中添加分子量标准品,并使用片段分析运行模块将其分离。 用户可以收集峰高和比率的数据,并可以比较不同样品的基本谱 - 然后正确地将所有数据与核苷酸序列相关联。
Sanger测序使用BigDye TerminatorV1.1试剂进行。纯化的测序反应在毛细管电泳仪器的测序模式下运行,生成带有用于序列分析的数据的 “.ab”输出文件。
此步骤是可选的,只能对参考样品执行。该参考序列将用于确定序列并将测序谱与片段分析谱进行比较。
将GeneScan™600LIZ®大小标准添加到测序反应中,并在片段分析运行条件下在毛细管电泳仪上运行,生成以可以使用GeneMapper®软件进行数据分析的“.fsa”文件。
通过片段分析工作流程对测序反应进行二次分析,使研究人员能够从同一样本中获取更多数据。例如,通过对片段分析进行GeneMapper®软件分析,用户可以计算峰高和峰比,并可以比较每个碱基的峰或对不同样品的单碱基谱进行并排比较。序列数据不在片段分析运行中收集,因此这两个分析的组合 - 序列运行和使用GeneMapper®软件分析的片段分析 - 使得可以在核苷酸序列内正确定位片段分析数据。
Sanger测序使用BigDye TerminatorV1.1试剂进行。纯化的测序反应在毛细管电泳仪器的测序模式下运行,生成带有用于序列分析的数据的 “.ab”输出文件。
此步骤是可选的,只能对参考样品执行。该参考序列将用于确定序列并将测序谱与片段分析谱进行比较。
将GeneScan™600LIZ®大小标准添加到测序反应中,并在片段分析运行条件下在毛细管电泳仪上运行,生成以可以使用GeneMapper®软件进行数据分析的“.fsa”文件。
通过片段分析工作流程对测序反应进行二次分析,使研究人员能够从同一样本中获取更多数据。例如,通过对片段分析进行GeneMapper®软件分析,用户可以计算峰高和峰比,并可以比较每个碱基的峰或对不同样品的单碱基谱进行并排比较。序列数据不在片段分析运行中收集,因此这两个分析的组合 - 序列运行和使用GeneMapper®软件分析的片段分析 - 使得可以在核苷酸序列内正确定位片段分析数据。
仅供科研使用,不可用于诊断目的。