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人类样本鉴定中的短串联重复分析
短串联重复（STR）基因分型是一种重要工具，可用于验证人类细胞系的真实性，对储存的人类组织和体液进行质量控制以及评估已知混合物的性质。使用毛细管电泳（CE）法的 STR 分析工作流程是一种简单、经济的方法，也是建立人体样品身份的黄金标准。
对人类疾病发展的研究很大程度上依赖于对培养物中生长的分离的人细胞系的分析。但是，在体外生长的细胞可能被错误识别或被其他不相关的细胞系污染。细胞系的错误识别会产生误导性的结果，造成混乱，并增加研究成本。现在，期刊和资助机构要求研究人员证明他们使用的细胞系是真实的，并且在研究过程中一直保持如此。
观看此视频，了解如何使用 STR 基因分型进行鉴定细胞系。
对存储或处理人源生物样品时进行样品鉴定。在接收样本时建立样本的 STR 基因型，那么在存储或工作流程中的任何节点进行样本鉴定。
观看此视频，了解为什么以及何时进行样品鉴定很重要。
混合样品分析（MSA）是使用 STR 化学通过 PCR 评估两种或三种已知 DNA 样品之间的混合物百分比。通过增加模板 DNA 的量和减少扩增循环的数量，可以检查来自主要和次要贡献者的平衡谱。通过 MSA 识别样品中混合物或污染物的水平，对下游过程至关重要。
特色资源
对人类疾病发展的研究很大程度上依赖于对培养物中生长的分离的人细胞系的分析。但是，在体外生长的细胞可能被错误识别或被其他不相关的细胞系污染。细胞系的错误识别会产生误导性的结果，造成混乱，并增加研究成本。现在，期刊和资助机构要求研究人员证明他们使用的细胞系是真实的，并且在研究过程中一直保持如此。
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对存储或处理人源生物样品时进行样品鉴定。在接收样本时建立样本的 STR 基因型，那么在存储或工作流程中的任何节点进行样本鉴定。
观看此视频，了解为什么以及何时进行样品鉴定很重要。
混合样品分析（MSA）是使用 STR 化学通过 PCR 评估两种或三种已知 DNA 样品之间的混合物百分比。通过增加模板 DNA 的量和减少扩增循环的数量，可以检查来自主要和次要贡献者的平衡谱。通过 MSA 识别样品中混合物或污染物的水平，对下游过程至关重要。
特色资源
此外，Applied Biosystems 产品列表中还有几种不同的基于 PCR 的 STR 指纹图谱的试剂盒，可在 CE 仪器上使用。
- CLA Identifiler Plus PCR 扩增试剂盒经过优化，可分析 16 多种纯化的 gDNA 制剂中的高度变异的人类 STR
- 首先开发了 CLA Identifiler Direct PCR 扩增试剂盒，以分析相同的 16 STR 位点，从干血或颊粘膜斑（例如，在 NUCLEIC-CARD 设备上）或颊粘膜拭子开始。对于 NUCLEIC-CARD 设备，将卡片上的 1.2 毫米冲头直接放入 PCR 管或孔中，无需进一步纯化即可扩增。
- 如果需要额外的区分度，则 CLA GlobalFiler PCR 扩增试剂盒可 24 对位点进行 6 染色分析，16 该功能包含在 Identifiler 试剂盒中。
GeneMapper 软件 6 以及云端微卫星分析（MSA）软件解决方案通过使用预先建立的等位基因阶梯并对 Identifiler 试剂盒所涵盖的各种 STR 等位基因进行 bin 集大小筛分，来简化 STR 的分析。
Figure 1. Workflows for cell line authentication. Two methods are available for cell line authentication. (A) Cells can be spotted onto NUCLEIC-CARD devices, punches of the cards amplified directly using the CLA Identifiler Direct kit, and fragments analyzed on Applied Biosystems CE instruments using GeneMapper Software 6 or MSA cloud application. (B) Alternatively, gDNA can be purified from cell lines, amplified using the CLA Identifiler Plus or CLA GlobalFiler kit, and fragments analyzed by capillary electrophoresis and GeneMapper Software 6 or MSA cloud application.
产品列表
| 规格 | GlobalFiler™ PCR 扩增试剂盒 | AmpFℓSTR™ Identifiler Plus PCR 扩增试剂盒 | AmpFℓSTR™ Identifiler Direct PCR 扩增试剂盒 |
| 分子标记 | 24 （21 常染色体和 3 性别决定标记） | 16 （15 常染色体和釉质生成素） | 16 （15 常染色体和釉质生成素） |
| Applied Biosystems 仪器兼容性 | SeqStudio，3500 系列，3730 系列，3130 系列 | SeqStudio，3500 系列，3730 系列，3130 系列，以及 310 | SeqStudio，3500 系列，3730 系列，3130 系列，以及 310 |
| 聚合物/毛细管阵列 | POP-4，POP-7，36 cm，和 50 cm | POP-4，POP-7，36 cm，和 50 cm | POP-4，POP-7，36 cm，和 50 cm |
| Applied Biosystem 软件兼容性 | GeneMapper 软件 5 和 6 | ||
| Applied Biosystems 热循环仪兼容性 | GeneAmp PCR 系统 9700 （仅限金塞和银塞），Veriti 槽，和 ProFlex PCR 系统（96-槽, 2 x 96-槽，和 3 x 32-槽) | ||
| 试剂盒规格（反应物） | 200 | 200 | 200 |
| 反应体积 (µL) | 25 | 25 | 25 |
| 染色标记 | 6-染料物质（FAM、VIC、NED、TAZ、LIZ 和 SID） | 5-染料物质（FAM、VIC、NED、PET 和 LIZ) | 5-染料物质（FAM、VIC、NED、PET 和 LIZ) |
| 扩增子大小 | ≤400 bp；SE33 低于 450 bp | ≤360 bp | ≤360 bp |
| 扩增时间 | <90 min | 2.5–3 hr | 2.5–3 hr |
| 小位点–250 bp | 12 完全，3 部分，Y 插入缺失和釉质生成素 | 10 | 10 |
| 样品输入或者样品类型 | 5 微升；总计 1 ng，但也针对 2.5–5 ng 进行了优化 | 高达 10 µL；总计 1 ng，但也针对 2.5–5 ng 进行了优化 | 从处理过的纸上穿孔 1.2 毫米，或者用 2–3 μL 的 Applied Biosystems 制备缓冲液处理过的药签或从未经处理的纸上穿孔 1.2 毫米 |
自行构建途径
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外部资源
仅供科研使用，不可用于诊断目的。