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プロテオミクスデータの分析
データを単純化し、生物学的意味を付与します
生物系は複雑なため、実験設計が複雑になりがちです。高速かつ強力な質量分析計を用いると、プロテオミクス分析により大規模なデータセットをルーチンで生成できます。標準的なプロテオミクス実験には、ペプチドやタンパク質およびその翻訳後修飾（PTM）の同定だけでなく、生成されたデータから生物学的意味を見出す助けとなるような複数の統計学的解析も含まれます。
Thermo Scientific は、複雑な高分解能精密質量（HR／AM）Orbitrap データをマイニングし、得られた大きなデータセットを意味ある結果に変換することに特化して設計されている一連のプロテオミクスソフトウェアプログラムを提供します。
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データ解釈を単純化
予備的な同定および検証の後、科学者はプロテオミクスデータの解釈という重要かつ時間を要する作業に直面します。Thermo Scientific ProteinCenter ソフトウェアは、複数の複雑な質量分析データセットから迅速に意味ある生物学的情報を抽出し、データ解釈を促進します。簡潔に言うと、このウェブベースのソフトウェアはお客様のプロテオミクス実験に生物学的意味を付与します。
データの抽出および解釈を単純化
Thermo Scientific Proteome Discoverer ソフトウェアは、SEQUEST、Mascot、Byonic サーチエンジンを使用する CID、HCD、ETD、EThcD フラグメンテーションスペクトルのデータマイニングのための包括的なツールセットを提供します。シングルランで複数のフラグメンテーションモードから得られたスペクトルなどの生データの混合ファイルにも対応しています。ソフトウェアの高速かつ堅牢なアルゴリズムを用いることで、定量的プロテオミク研究のための精確なピークピッキングおよびペプチド定量が可能になります。Proteome Discoverer は信頼性の高い統計学的情報を提供し、定量結果を視覚的に検証し、PTM およびその局在性を同定できます。
ペプチドの定量と検証
創薬実験で目的のタンパク質を同定した後、その同一性を検証、確認します。Thermo Scientific Pinpoint ソフトウェアを用いることで、創薬から標的定量へのすんなりと移行できます。トリプル四重極ベースの選択反応モニタリング（SRM）標的定量ワークフローにおいて、このソフトウェアは装置のメソッドの構築、データ処理、レポート作成を支援します。Pinpoint は、HRAM Orbitrap ベースの質量分析計による標的定量を支援するだけでなく、Proteome Discoverer および ProteinCenter ソフトウェアとシームレスに一体化することで、同定されたペプチド配列に基づいて自動的に同位体または MS／MS フラグメントイオンの精密質量を求められます。