crispr-mrna-kits

CRISPRによる高効率なマルチプレックスゲノム編集ツール

GeneArt® CRISPR Nuclease mRNAは、CRISPR/Cas9システムでゲノム編集を行うための、mRNAフォーマットの野生型Cas9です。 Cas9 mRNAはすぐにトランスフェクションでき、CRISPRベクターフォーマットを使用するときに必要な時間のかかるクローニングの手順を踏む必要がありません。Cas9 mRNAは、カスタムの GeneArt® CRISPR U6 Strings™ DNA、またはGeneArt® CRISPR T7 Strings™ DNAからin vitro転写によって調製したRNAと一緒にトランスフェクションして使用します。GeneArt® CRISPR Strings™ DNAは配列特異的なguide RNA (gRNA) をエンコードするようカスタムデザインされており、gRNAによってCas9ヌクレアーゼタンパク質が目的の遺伝子座に導かれ、二本鎖DNA を切断します。このシステムでは、複数のGeneArt® CRISPR Strings™ DNAを調製し、一度のトランスフェクションで複数のターゲット遺伝子の配列編集を同時に行うマルチプレックスのゲノム編集アプローチにも使用可能です。また、このシステムではCas9 mRNAはいつも共通で、標的配列を変更する場合はGeneArt® CRISPR Strings™ DNAの設計を変えることのみで対応できます。

GeneArt® CRISPR Nuclease mRNA product bulletin

Ready-to-transfectまたはRNAでの細胞導入に適したCRISPR Strings™ DNA

GeneArt® CRISPR Strings™ DNAは、CRISPR-Cas9システムの構成要素として、標的配列特異的に結合するguide RNA (gRNA) をエンコードするカスタムデザインされた二本鎖DNAフラグメントです。これらはU6またはT7プロモーター融合型で提供されます。U6プロモーターを含むCRISPR Strings™ DNAは、Ready-to-transfectのためCas9 mRNAと一緒に細胞に直接トランスフェクションすることができます。細胞内ではU6プロモーターがCRISPR gRNAの発現を制御し、共導入したCas9 mRNAから発現したCas9タンパク質との複合体が形成されます。T7プロモーターを含む CRISPR Strings™ DNAは、トランスフェクションの前に、当社のMEGAshortscript™ T7 Transcription Kitを使用してin vitro でgRNAを調製します。それから細胞へCas9 mRNAと共導入し、細胞内でCas9タンパク質との複合体が形成されます。トランスフェクション効率が低い細胞でのゲノム編集や、U6プロモーターがワークしない細胞においてプロモーターの制約が排除されるため、従来よりも幅広い細胞種でのゲノム編集が実現します。

Workflow diagram showing GeneArt U6 ready-to-transfect format

Figure 1. Ready-transfectフォーマットのワークフローGeneArt® CRISPR mRNAとGeneArt® U6 Strings™ DNAを組合せて用いる場合のワークフローを示します。ここでは3つの異なるGeneArt® U6 Strings™ DNAフラグメントをCas9 mRNAとともに1反応で共導入し、複数の遺伝子のゲノム編集を行いました。CRISPR Strings™ DNA (500 bpの合成DNA発現カセット) はU6プロモーターを含み、Cas9 mRNAとともに直接細胞へトランスフェクションすることができます。U6プロモーターはgRNAの発現を制御し、Cas9 mRNAから発現するCas9ヌクレアーゼタンパク質と複合体を細胞内で形成します。human Pol III promoter U6はnon-coding gRNAを高効率に発現します。本システムにおいてゲノム編集効率をより高くするには、Lipofectamine® 3000 transfection reagent (製品番号: L3000001)の使用を推奨します。

Workflow diagram showing GeneArt T7 complete RNA format

Figure 2. RNAフォーマットでの細胞導入のワークフローGeneArt® CRISPR mRNAとGeneArt® T7 Strings™ DNAを組合せて用いる場合のワークフローを示します。3つの異なるGeneArt® T7 Strings™ DNAフラグメント由来で、in vitro転写によって得たgRNA産物(IVT gRNAs) をCas9 mRNAとともに1反応で共導入し、複数の遺伝子のゲノム編集を行いました。元のCRISPR Strings™ DNA (500 bpの合成DNA発現カセット) はT7プロモーターを含み、MEGAshortscript™ T7 Transcription Kit (製品番号: AM1354)で事前にin vitro転写を行いました。IVT gRNAをCas9 mRNAとともにRNAフォーマットで共導入することで対象細胞におけるプロモーターの制約が無くなり、より幅広い細胞において高効率のゲノム編集が実現します。このシステムはモデルシステムの構築のため胚へのマイクロインジェクションといったin vivoのアプリケーションにも適しています。本システムにおいてゲノム編集効率をより高くするには、RNAの導入にLipofectamine® MessengerMax reagent (製品番号: LMRNA003)を使用することを推奨します。

CRISPR/Cas9システムを用いてゲノム編集を行うには、GeneArt® CRISPR mRNA のほか、GeneArt® CRISPR Strings™ DNAを別途購入いただくことが必要です。GeneArt® CRISPR Strings™ DNA order formをダウンロードしていただき必要事項を記入していただければ、標的遺伝子の配列からgRNAのデザインを弊社が行います。記入済みのオーダーフォームはjpgene@lifetech.comまでお送りください。

ご注文方法

GeneArt® U6 Strings™ DNA -ready-to-transfect

  1. CRISPR/Cas9システムを用いてゲノム編集を行うには、ほかにGeneArt® CRISPR mRNAも必要です。ご注文前に事前にご確認ください。
  2. GeneArt® U6 Strings™ DNA のご注文にはGeneArt® CRISPR Strings™ DNA order formをダウンロードの上、必要事項を入力いただき、jpgene@lifetech.comまでお送りください。

GeneArt® T7 Strings™ DNA –in vitro 転写用

  1. CRISPR/Cas9システムを用いてゲノム編集を行うには、ほかにGeneArt® CRISPR mRNAも必要です。ご注文前に事前にご確認ください。
  2. またin vitro 転写にはMEGAshortscript™ T7 Transcription Kitの使用が推奨です。
  3. GeneArt® T7 Strings™ DNA のご注文にはGeneArt® CRISPR Strings™ DNA order formをダウンロードの上、必要事項を入力いただき、jpgene@lifetech.comまでお送りください。

いずれのCRISPR Strings™ DNAもお客様の標的とする遺伝子配列からgRNAをデザインするオプションサービスを無償で提供します。サービスを利用しない場合には、既に決定されたCRISPR配列をオーダーフォームにご入力ください。

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CRISPR/Cas9システムによるゲノム編集の成功例

複数の細胞タイプにおけるCRISPR/Cas9によるゲノムDNA切断効率
切断効率はGeneArt® Genomic Cleavage Detection Kittによって検出を行いました。このキットは、CRISPR/Cas9によって切断された標的配列において、細胞のNHEJ修復機構の過程において生じる塩基の欠失や挿入(indels) をミスマッチ認識酵素が検出し、電気泳動で評価するアッセイ法に基づいています。

cleavage efficiency data for CRISPR Nuclease mRNA system

Figure 3. 様々な細胞タイプにおけるGeneArt® CRISPR Nuclease mRNAシステムによる効率的なゲノム編集ここに示す結果は異なるヒト細胞- (A) 293FT; (B) HCT116; (C) U2OS、を用いました。それぞれ24ウェルフォーマットでの培養細胞に対し、HPRTまたはRelA遺伝子を標的としてゲノム編集を行いました。細胞に導入したCRISPRの各フォーマットおよび標的遺伝子の情報は、それぞれの図の中に示します。従来のオールインワンベクターGeneArt® CRISPR Nuclease OFP vectorはLipofectamine® 3000 reagentでトランスフェクションされ、他のフォーマットについてはLipofectamine® MessengerMax reagentが 用いられました。トランスフェクション72時間後、細胞を回収し、GeneArt® Genomic Cleavage Detection Kitを用いてゲノム編集の効率について定量的に解析を行いました。CRISPRによって切断されたDNAは、電気泳動の画像中に矢印により示されます。

幅広い対象細胞と幹細胞でのアプリケーション

CRISPR/Cas9の2つのエレメントをともにRNAフォーマットで、かつLipofectamine® MessengerMax transfectionによってトランスフェクションすることで、幹細胞や従来トランスフェクション効率が低かった細胞での大幅なゲノム編集効率の改善がもたらされます。

cleavage efficiency data

Figure 4. GeneArt® CRISPR Nuclease mRNAは幅広い細胞でのゲノム編集実験を実現ここに示す結果は、マウスのNeuro 2A細胞において、ROSA26 およびNANOG遺伝子を標的としたゲノム編集です。細胞は24ウェルフォーマットでLipofectamine® 2000 reagentによってトランスフェクションされ、72時間後細胞を回収し、GeneArt® Genomic Cleavage Detection Kitを用いてゲノム編集の効率について定量的に解析を行いました。

cleavage efficiency data

GeneArt® CRISPR Nuclease mRNAとin vitro転写gRNAの組み合わせは、その他のフォーマットと比較してiPS細胞におけるゲノム編集の効率が最も高い。 Lipofectamine® MessengerMaxを用いてトランスフェクションをおこなった。細胞は24ウェルフォーマットで培養し、トランスフェクション72時間後の細胞を回収し、GeneArt® Genomic Cleavage Detection Kitを用いてゲノム編集の効率について定量的に解析を行いました。

効率的なマルチプレックスシステムが、よりシンプルなワークフローを提供します。1ウェルにおいて最大4ターゲットに対するゲノム編集を同時に行い、各ターゲットの切断効率を評価しました。Cas9 mRNAは複数のターゲットに対してデザインされたGeneArt® CRISPR Strings™ DNAとともにマルチプレックスゲノム編集に用いることができます。このアプローチによって、どのgRNAが標的配列に対して最も効果的にワークするか、あるいは異なるゲノム遺伝子座のゲノム編集を一度のトランスフェクションで行う、といったスクリーニングを実現できます。

diagram showing multiplex genome editing transfection strategy

cleavage efficiency data for multiplex genome editing experiment

Figure 6. GeneArt® CRISPR mRNA とGeneArt® U6 String DNAを用いたマルチプレックスゲノム編集。従来のオールインワンベクターGeneArt® CRISPR Nuclease reporter plasmid または、GeneArt® CRISPR Nuclease mRNA + U6 gRNA stringで同じターゲットに対してのゲノム編集効率を比較評価しました。またGeneArt® CRISPR Nuclease mRNAとU6 gRNA stringの組み合わせにより、同時にHPRTAAVS1EMX1遺伝子のうち2または3の複数ゲノム編集に対する効率を評価しました。実験は293細胞で行われました。

Cas9 mRNAはトランスジェニックモデル動物の作製アプリケーションにも有用。胚へのGeneArt® CRISPR nuclease mRNAのマイクロインジェクションやそのほかのin vivo実験のデータはまだ示されていませんが、一般的に多くの論文においてマウスやゼブラフィッシュ、Drosophilaといった幅広い生物種においてin vivoでのゲノム編集の成功例が報告されています。

diagram showing potential genome editing application in transgenic models

editing efficiency data for multiplexed genome editing experimentFigure 7. Cas9 mRNAとin vitro転写gRNAを用いて高効率なマルチプレックスゲノム編集を実現。 オールインワンベクターまたは、GeneArt® CRISPR Nuclease mRNA + U6 gRNA stringの組み合わせを用いて、同時に1~3ターゲットのゲノム編集に対する効率を評価しました。またすべての実験サンプルにおいて、RelA特異的な切断が行われていることを確認しました(data not shown)。

 

 

 

 

 

 

 

 

Ordering information

GeneArt® CRISPR mRNA
製品サイズ製品番号
GeneArt® CRISPR nuclease mRNA15 μgA29378 
GeneArt® Strings™ U6 DNA> 200 ng オーダーフォーム
CRISPRデザインツール
GeneArt® Strings™ T7 DNA> 200 ng オーダーフォーム
CRISPRデザインツール
GeneArt Precision gRNA Synthesis Kit25 reactionsA29377

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For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

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