NGSライブラリクリーンアップおよびPCR精製

次世代シーケンシングワークフローのための核酸クリーンアップ

DNAクリーンアップ

DNAクリーンアップには、所定のサンプルから不要な断片や汚染物質を標的として除去します。NGSアダプター、プライマー、プライマーダイマー、未結合dNTP、およびその他の反応成分は、ダウンストリームアプリケーションで使用する前に除去されます。クリーンアップは、次世代シーケンシング（NGS）やPCRなどのゲノムアプリケーションに不可欠です。クリーンアップは、NGSライブラリ調製ワークフロー全体で広く使用されている固相可逆固定化（SPRI）磁気ビーズ技術を使用することで容易になります。

クリーンアップの最適化磁気ビーズを注文

NGSライブラリ調製用のDNAサイズセレクション

サイズセレクションは、シーケンシングプロセスの品質、効率、および精度の向上を模索している人にとって、次世代シーケンシングライブラリ調製ワークフローの重要なステップです。サイズセレクションには、シーケンシングステップに進む前に、調製したDNAフラグメントのプールから目的のサイズ範囲の特定のDNAフラグメントを選択します。

NGS library prep workflow highlighting size selection and cleanup

NGS用の磁気ビーズベースのクリーンアップとサイズ選択

固相可逆的固定化（SPRI）

固相可逆固定化（SPRI）は、シリカまたはカルボキシルコーティングの磁気ビーズを使用して、溶液から核酸を効果的に精製する方法です。このビーズは、ポリエチレングリコールや塩の存在下で核酸に可逆的に結合するように設計されています。SPRI技術は、タイプとサイズに応じて核酸を選択的に結合し、ターゲットを捕捉し、サンプル内の汚染物質を除去します。[1]

核酸の固定化は、サイズれセクション的なSPRIビーズがターゲット核酸に結合し、磁場を使用して所定の位置に固定されると実現します。

選択DNAが磁気ビーズに結合すると、汚染物質の除去および洗浄ステップが実行されます。DynaMag 96サイドマグネットなどの粒子捕捉には、強力なマグネットが使用されます。その後、dNTP、塩、プライマー、プライマーダイマーなどの汚染物質を完全に洗浄できます。ステップが完了すると、サンプルを磁場から外し、精製されたDNAをキャプチャーできます。

ビーズを磁場から外し、水または溶出バッファーに再懸濁すると核酸が溶出されます。核酸がビーズからリリースされ、混合物が再び磁場の近くに配置されると、ビーズおよび溶液が分離します。

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MagMAX Pure Bindは、マーケットをリードするクリーンアップビーズのすぐに使用可能な代替品です。既存のワークフローにシームレスに統合できます。

Post clean up yield comparison with magnetic beads vs Competitor A

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Removal of small unwanted fragments comparison with magnetic beads vs Competitor A

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図1.MagMAX Pure Bindは、他社製品と比較して、>90 bpのアンプリコン（PCR産物）を高い回収率で確実なPCRクリーンアップを可能にし、<90 bpの断片（プライマーおよびプライマーダイマー）を効率的に除去できます。ビーズ比1.8倍で断片化されたDNA 500 ngのインプットを使用し、クリーンアップ後の回収および除去効率をプレクリーンアップインプット量の割合として計算しました。