mzCloud 질량 스펙트럼 라이브러리

mzCloud는 광범위하게 선별된 고품질 질량 스펙트럼 단편화 라이브러리로서 각 항목별로 상당한 양의 스펙트럼과 메타데이터를 포함하고 있습니다. 또한 각 항목에는 다양한 충돌 에너지와 다양한 단편화 기법을 사용하여 얻은 포괄적인 고분해능 MS/MS 및 다단계 MSⁿ 스펙트럼이 포함됩니다.

각 원시 질량 스펙트럼은 노이즈를 제거하기 위해 필터링되고, 절대 질량 정확도를 보장하기 위해 재보정되며, 품질 및 일관성을 보장하기 위해 완전한 주석 처리와 선별 과정을 거쳤습니다.

마지막으로, 라이브러리의 내용은 매주 업데이트되어 폭넓은 화학 영역을 포괄하며 모든 저분자 애플리케이션과의 관련성을 보장합니다.

하위 구조 검색을 통해 미확인 화합물을 식별하기 위해 mzCloud의 콘텐츠를 활용하는 Mass Frontier 소프트웨어의 예: 실험적 단편 스펙트럼(왼쪽 상단)을 mzCloud 질량 스펙트럼 데이터베이스에서 검색합니다. 일치하는 스펙트럼이 해당 스펙트럼 트리(상단, 중간)에 표시되며 이와 함께 지원 스펙트럼 정보(왼쪽 하단)와 일치하는 단편화 스펙트럼에서 식별된 전구체 구조(오른쪽 하단) 및 해당 단편이 유래한 라이브러리 화합물 구조(오른쪽 상단)가 표시됩니다.

데이터베이스 컨텐츠의 내용과 품질은 일반적으로 상당히 다르며 데이터의 신뢰성과 얻어진 결과에 대한 신뢰도에 영향을 미칠 수 있으므로 데이터베이스 유형을 구분하는 것이 중요합니다.

• 화학 데이터베이스: 최소한으로 이름 및 화학식이 포함되는 화학 정보 모음. 여기에는 구조, 원소 조성, 머무름 시간 정보 및 추가적인 생물학적 또는 화학적 메타데이터가 포함될 수 있습니다.
• 정밀 질량(AM) 데이터베이스: AM 데이터베이스에는 정밀 질량 공식이 들어 있습니다.
• 정밀 질량 머무름 시간(AMRT) 데이터베이스: AMRT 데이터베이스에는 특정 분석 방법에 대한 정밀 질량 및 머무름 시간이 들어 있습니다.
• 라이브러리: 라이브러리는 위 항목 외에 화합물에 대한 참조 질량 스펙트럼 데이터, MS/MS 및/또는 MSⁿ 데이터도 포함하는 데이터베이스(AM 또는 AMRT)입니다.

mzCloud 내 스펙트럼 트리의 개략적 표현. 다중 극성이 있는 특정 화합물(ESI +/-)과 다양한 부가물에 대하여 MS 스펙트럼을 획득합니다. 각 전구체는 다양한 단편화 기법(CID, HCD)과 여러 충돌 에너지를 사용하여 각각의 단편화 수준(MS², MS³, MS⁴ 등)에서 남김없이 단편화되어 각 라이브러리 항목에 대한 포괄적인 스펙트럼 정보 트리를 생성합니다.

mzCloud는 폭넓은 화학 영역(따라서 모든 소분자 애플리케이션 분야 포함)을 기반으로 한 콘텐츠를 포함하는 포괄적인 질량 스펙트럼 라이브러리로서, CID 및 HCD를 사용하여 여러 부가물에 대하여 다양한 충돌 에너지로 고분해능 정밀 질량 데이터를 수집합니다. 모든 전구체 이온에 약 10–20개의 충돌 에너지가 포함됩니다. 이 다단계 다차원 MSⁿ 스펙트럼 데이터는 광범위하고 포괄적이며, 일반적으로 각 화합물에 대해 수백에서 수천 개의 스펙트럼을 포함하고 많은 수가 MS⁴ 단편화 단계를 초과하는 스펙트럼 트리에 배열됩니다.

각 라이브러리 항목별 광범위한 데이터는 Compound Discoverer와 Mass Frontier 데이터 분석 소프트웨어에서 제공하는 확실한 적합성과 데이터 시각화를 통해 실험적으로 얻은 데이터와 라이브러리 콘텐츠의 데이터가 서로 일치하는지 확인하면서 정확한 화합물을 식별하는 데 매우 중요합니다. mzLogic과 같은 Compound Discoverer와 Mass Frontier 소프트웨어의 추가 도구는 스펙트럼 라이브러리 화합물 항목만으로 식별할 수 없는 미지 물질을 신뢰성 있게 식별하기 위해 광범위한 단편화 정보를 사용합니다.

mzLogic에 대해 자세히 알아보기

Mass Frontier 소프트웨어에서 사용할 수 있는 질량 스펙트럼 콘텐츠 선별 도구의 예. mzCloud에 포함된 콘텐츠를 수동으로 선별하는 데 사용되는 모든 기능이 포함되어 있습니다. mzCloud의 힘은 콘텐츠의 범위와 높은 품질 모두에 있으며, 이를 통해 화합물 식별에 신뢰성을 제공합니다.

Thermo Scientific Orbitrap 기반 질량분석기는 일반적으로 3ppm 이하의 질량 오류를 전달하지만, 라이브러리를 검색하는 데 사용되는 모든 실험 데이터에는 약간의 부정확성이 존재합니다. 라이브러리 자체에 질량 오류가 있는 데이터가 포함되어 있으면 이러한 오류가 더욱 복합적으로 발생합니다. 복합적인 오류는 일치 점수가 높아도 식별이 어렵거나 신뢰도가 낮을 수 있음을 의미합니다.

mzCloud 내의 컨텐츠를 선별하면 데이터가 비교되는 참조 스펙트럼의 오류 및 변동성을 방지할 수 있습니다. 선별 프로세스에는 다음이 포함됩니다.

• 개별적으로 획득된 여러 스펙트럼의 평균 계산
• 질량 스펙트럼 노이즈 제거
• 전구체 이온의 알려진 원소 조성 및 구조에 기초하여 단편 이온 원소 조성에 대해 예측된 공식을 기반으로 질량 스펙트럼 재보정
• 모든 단편 이온을 단편 구조로 주석 처리
• 데이터 소스 및 모든 원본 원시 데이터 파일을 포함한 대량의 메타데이터 추가

이 선별 프로세스는 모든 스펙트럼, 즉 모든 충돌 에너지, 모든 단편화 유형, 모든 MSⁿ 레벨 및 각 전구체 이온에 대해 수행됩니다. 따라서 mzCloud의 스펙트럼 데이터는 품질이 매우 높으며 높은 수준의 제어로 인해 크라우드 소싱(crowd sourcing) 방식의 라이브러리에 비해 상당한 이점을 제공합니다.

각 MSⁿ 레벨에서 각 스펙트럼, 각 충돌 에너지, 각 단편화 유형에 대해 제공되는 모든 주석과 함께 m/z 213.05462에서 강조 표시된 피크에 오류가 없음을 보여주는 재보정 단편화 스펙트럼.

mzCloud는 여전히 미지 물질의 식별 및 특성 분석을 위한 탁월한 솔루션을 제공하며, Compound Discoverer 소프트웨어와 Mass Frontier 소프트웨어의 다양한 도구를 활용할 수 있습니다.

복잡한 시료에서 mzCloud의 어떤 화합물과도 일치하지 않는 완전히 새로운 미지 물질이 발견되거나, 식별된 단편이 너무 적어서 추정적인 식별이 불가능한 경우에도, 이 정보를 맞춤형 라이브러리에 저장할 수 있는 기능을 통해 사용자는 데이터를 검색하여 특정 ‘미지 물질’이 이전에 관찰된 적이 있는지 확인하고 이에 기반하여 유용한 정보 리포지토리를 구축할 수 있습니다. Compound Discoverer 소프트웨어를 사용하여 질량 스펙트럼 데이터를 기존 mzVault에 전송하거나 새 mzVault를 만들 수 있습니다. 그리고 Mass Frontier 소프트웨어에는 mzCloud와 동일한 표준으로 만들어진 mzVault 라이브러리를 가져오는 데 필요한 선별 도구가 포함되어 있습니다.

mzCloud MS용 오프라인 mzVault 다운로드²

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