Mass Frontier 스펙트럼 해석 소프트웨어

온라인 데이터베이스 또는 사용자 제공 구조에서 구조적 검색의 모든 기능을 활용하여 MSⁿ 및 하위 구조 스펙트럼 매칭을 통해 더 많은 미지 물질을 확실하게 식별할 수 있습니다.

많은 전구체 및 MSⁿ 단편화 스펙트럼은 mzCloud 내의 각 화합물별로 스펙트럼 트리 형태로 논리적으로 구성됩니다. 각 스펙트럼 트리 수준은 MSⁿ 단계를 상징하며 여기서 최상위 수준은 n=1 또는 전구체 스펙트럼에서 시작합니다. 각 수준은 후속 단편의 광범위하고 대표적인 범위를 보장하기 위해 다양한 실험 조건을 사용하면서 데이터가 수집됨에 따라 수많은 스펙트럼을 포함할 수 있으며, 이는 고품질 검색 결과의 가능성을 높여줍니다.

mzCloud의 스펙트럼 트리에 대한 개략적 표현. 다중 극성이 있는 특정 화합물(ESI +/-)과 다양한 부가물에 대하여 MS 스펙트럼을 획득합니다. 각 전구체는 다양한 단편화 기법(CID, HCD)과 여러 충돌 에너지를 사용하여 각각의 단편화 수준(MS², MS³, MS⁴ 등)에서 남김없이 단편화되어 각 라이브러리 항목에 대한 포괄적인 스펙트럼 정보 트리를 생성합니다.

각 라이브러리 항목에 대한 광범위한 데이터는 Compound Discoverer와 Mass Frontier 데이터 분석 소프트웨어 패키지에서 제공하는 확실한 적합성과 데이터 시각화를 통해 실험적으로 얻은 데이터와 라이브러리 콘텐츠의 데이터가 서로 일치하는지 확인하면서 정확한 화합물을 식별하는 데 매우 중요합니다. 추가 도구에는 스펙트럼 라이브러리 화합물 항목만으로 식별할 수 없는 미지 물질을 신뢰성 있게 식별하기 위해 광범위한 단편화 정보를 사용하는 mzLogic 등이 있습니다.

Mass Frontier 소프트웨어는 mzCloud 또는 자체 선별된 스펙트럼 라이브러리에 포함된 광범위한 단편화 데이터를 사용하여 일부 또는 모든 스펙트럼 데이터가 일치될 확률을 높이고 데이터 세트에 대한 통찰력을 신속하게 제공할 수 있도록 여러 가지 다른 검색 유형을 제공합니다.

• MS² 대 MS² 식별 검색
• MSⁿ 대 MSⁿ 트리 검색
• 하위 구조 식별 검색(MSⁿ 대 MSⁿ)
• 하위 트리 검색(MSⁿ 대 MSⁿ)
• mzLogic

화합물을 식별하는 데 사용됩니다. MS² 대 MS² 식별 검색은 쿼리 트리의 MS² 스펙트럼을 mzCloud 또는 현재 사용 중인 참조 라이브러리의 MS² 스펙트럼과 비교합니다. 매칭이 이루어지려면 전구체 이온이 두 스펙트럼 모두에서 일치해야 합니다. 결과 식별 점수는 일치하는 두 MS² 스펙트럼 정보의 중복에 기반합니다.

MSⁿ 대 MSⁿ 트리 검색은 MS² 대 MS² 식별 검색과 유사합니다. 그러나 mzCloud 또는 참조 라이브러리에 대해 쿼리(Query) MSⁿ 트리를 검색합니다. 일치하는 모든 단편화 스펙트럼은 빨간색 테두리로 강조 표시되며, 일치하는 MSⁿ 스펙트럼이 많을수록 결과 일치 점수가 높아집니다.

MSⁿ 대 MSⁿ 트리 검색의 주요 장점은 MS² 대 MS² 식별 검색보다 더 높은 신뢰성으로 위치 이성질체를 구별할 수 있다는 점입니다. 이는 검색 중인 고차 단편화 스펙트럼에 구조적 진단 단편 이온이 존재할 가능성이 높기 때문입니다.

쿼리를 적용한 라이브러리 내에 사용 가능한 정확한 일치가 없는 경우에도 하위 구조 식별 검색(MSⁿ 대 MSⁿ)을 통해 광범위한 하위 구조 정보를 이용할 수 있습니다. 동일한 화합물 등급에 속하거나 공통 하위 구조를 공유하는 화합물은 검색된 라이브러리에서 쿼리 트리와 스펙트럼 트리 간 MSⁿ 스펙트럼의 일치를 통해 식별할 수 있습니다.

ID 하위 구조 검색과 유사하게 하위 트리 검색(MSⁿ 대 MSⁿ)은 MSⁿ 스펙트럼 일치를 기반으로 다시 라이브러리에서 하위 구조 매칭을 시도합니다. 주요 차이점은 여러 스펙트럼을 사용하여 일치 점수 계산이 달라지고 모든 일치 할당에 대한 신뢰도가 달라질 수 있다는 것입니다.

스마트 노트 다운로드

완전히 편집하고 추가할 수 있는 이미 포함된 Metabolika 생물학적 경로의 예.

MSⁿ 스펙트럼 트리의 자동 단편화 주석을 사용한 신뢰성 있는 구조 규명. 단편화 경로는 구조 제출을 기반으로 예측될 수 있으며 HighChem Fragmentation Library™를 최대한 활용합니다. 여기에는 52,000개 이상의 단편화 방식, 217,000개 이상의 개별 반응, 256,000개 이상의 화학적 구조 및 동료 평가 문헌의 216,000개 이상의 디코딩 메커니즘 정보가 포함되어 있습니다.

단편 이온 검색(FISh)을 사용하면 이론적인 단편 예측 또는 실험 MSⁿ 스펙트럼 이온 트리로 획득한 모체 화합물의 단편화 패턴을 기반으로 구조적으로 유사한 화합물을 빠르게 스크리닝할 수 있습니다. FISh는 상위 화합물 구조와 잠재적 대사체를 사용하여 대부분의 매트릭스 관련 배경 이온을 걸러내기 때문에 관련 정보를 빠르고 쉽게 식별할 수 있습니다. FISh는 I단계 및 II단계 바이오변환(biotransformation)의 광범위한 목록과 맞춤형 목록을 작성할 수 있는 기능을 제공합니다.

FISh는 구조적으로 유사한 화합물을 필터링할 수 있을 뿐만 아니라, 변형 부위와 라벨의 위치를 자동으로 확인하고 상위 항목과 필터링된 결과 모두에 공통되는 단편에 색상 코드를 적용할 수 있습니다. 위의 예에서 제안된 대사체 단편에 정확히 일치하는 것은 녹색으로 강조 표시됩니다. 변환 이동 일치는 파란색으로 강조 표시됩니다.

자동 단편 할당은 "단편화 경로의 이해" 섹션에 설명된 대로 HighChem 단편화 라이브러리를 사용하여 생성됩니다.

새로운 Curator 모듈은 독점권이 있는 화합물에 대한 스펙트럼 트리 선별, 단편 주석화 및 질량 재보정을 자동화하여 고품질의 엄선된 로컬 MSⁿ 라이브러리를 구축합니다.