Low-Level Somatic Variant Detection in Tumor FFPE Samples

암의 분자 프로파일링은 개별 맞춤형 암 치료 연구 분야 또는 정밀 종양학에서 점점 더 중요해지고 있습니다. NGS(next-generation sequencing)는 많은 표적과 샘플을 다중화 및 스크리닝해야 할 때 고효율 어플리케이션을 지원하는 중요한 방법입니다. 그렇지만, 단일 분석물질이나 단일 유전자 표적과 같이 상당히 집중된 어플리케이션에서는 미량의 체세포 변이체를 검출할 수 있는 빠르고, 간편하고, 저렴한 방법이 확실히 필요합니다. Applied Biosystems™ Minor Variant Finder Software를 사용해 민감도를 개선한 덕분에 Sanger 시퀀싱은 그러한 문제를 해결해 주는 이상적인 기술입니다.

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Sanger 시퀀싱 사용에 대한 세부 정보는 아래 다루는 어플리케이션 노트에 나와 있고, 여기에서는 다음 사항을 잘 보여줍니다.

이상적인 어플리케이션 중 하나인 종양학 연구에서 고민감도 Sanger 시퀀싱의 강력한 기능
Minor Variant Finder Software와 함께 Sanger 시퀀싱을 사용해 미량의(5%까지) 체세포 변이체 검출
최고 표준의 확실한 NGS용 방법으로서의 역할 외에도 최우선 스크리닝을 위한 Sanger 시퀀싱의 유용성
method for NGS
최소 용량(0.1ng 정도)의 FFPE(formalin-fixed, paraffin-embedded) 샘플을 성공적으로 조사
단순한 workflow와 데이터 분석, 샘플당 저렴한 비용(제한적인 개수의 표적에서), 빠른 분석 시간을 포함한 Sanger 시퀀싱의 장점

Application Note: Low-level somatic variant detection in tumor FFPE samples by Sanger sequencing

This study demonstrates how the improved sensitivity achieved through Minor Variant Finder Software makes Sanger sequencing an ideal choice for oncology research applications.

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Sanger sequencing workflow

Our simple and fast Sanger sequencing workflow can be completed in less than one workday, from sample to answer. We offer Applied Biosystems products to support many steps of our recommended workflow, from PCR amplification to data analysis. Learn more about each step of our recommended Sanger sequencing workflow.