DNA Fragmentation & Morphology

アポトーシス後記の特長には、DNA断片化、クロマチン凝集、核膜の劣化、およびDNA鎖切断を含む核形態の変化などがあります。 Molecular Probes®では、アポトーシス中に起こる核の変化を解析するための様々な試薬を提供しています。それらの多くは、細胞の健康状態や生存率に関する様々なパラメーターの検出に用いる他の試薬や方法と組み合わせることが可能です。

フローサイトメトリー用核アッセイもご覧ください

核観察型アポトーシスアッセイ

アポトーシスが進行している細胞は、核クロマチン凝集の増加を示します。これはNucBlue® Live Cell Stainを用いて可視化されます。核染色は、生細胞または固定細胞に対して行われ、他の検出方法と容易に組み合わせられます。アポトーシスの過程で生ずるDNAの断片化はDNA鎖を切断します。このことは、TUNEL(terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end-labeling)アッセイを用いて解析できます。Click-iT® Plusテクノロジーを用いたTUNELアッセイは、FFPE処理試料を含む培養細胞や組織切片といったサンプルに最適です。

  • クロマチン凝集を可視化するためのDNA染色
  • イメージングおよびHCS用のTUNELアッセイ
  • 組織サンプル用のTUNELアッセイ

クロマチン凝集を可視化するためのDNA染色

Hoechst 33342は、おそらく、生細胞および固定細胞ならびに組織切片用の最も広く普及している核蛍光染色色素です。この細胞透過染色色素は優先的にDNAのATリッチ領域に結合します。DNAに結合した場合、UV光で励起すると460 nmで青色の蛍光を発します。Hoechst 33342のスペクトル特性とその大きなストークスシフトは、多色実験において緑色および赤色の蛍光体との使用に最適です。DNAに対する親和性が高いことから、Hoechst 33342は、アポトーシスを起こした細胞で凝縮した核を識別するために、しばしば細胞複製研究に用いられますNucBlue® Live ReadyProbes® Reagentとして処方することで、この古典的な染色は室温で安定であり、簡便なドロッパー ボトルで容易に使えます。 

image of cells stained with NucBlue® Live ReadyProbes® ReagentNucBlue® Live ReadyProbes® Reagentで染色した内皮細胞

イメージングやHCS(ハイコンテントスクリーニング)用のTUNELアッセイ

培養細胞で用いる場合、Click-iT® TUNEL Alexa Fluor®イメージングアッセイはHCSまたは顕微鏡イメージング用に最適化されています。小さくかつ特異的な標識部分により、迅速かつ高効率の実験プロトコールが可能になります。このアッセイは2時間以内に完了し、アポトーシスを起こした細胞が細胞集団内に大量にあっても効率よく区別することができます。蛍光標識を選択することで、Click-iT® TUNELアッセイは細胞表面および細胞内のバイオマーカー検出でのマルチプレックス化を可能にします。

  • HCS用に最適化済み
  • 効率的な標識プロトコール
  • 2時間以内にアッセイが完了
  • マルチプレックス化用に3種類の色素から選択可能
image of cells stained with Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 594 Imaging Assay reagents

Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 594 Imaging Assay, for Microscopy & HCSおよびHoechst 3334を用いて、Hela細胞をスタウロスポリンで処理し、アポトーシスを誘導した。 イメージの取得は、Thermo Scientific™ Cellomics® ArrayScan® VTIを用いて行った。

組織サンプル解析用のTUNELアッセイ

TUNELアッセイは、組織サンプルでDNA断片化を起こしたアポトーシス細胞を検出するために最も広く使われている方法です。小さい標識部分と明るい蛍光色素を用いることで、Click-iT® Plus TUNELアッセイは、いくつかの異なるFFPE(フォルマリン固定、パラフィン埋包)組織サンプルのアポトーシス細胞を検出することが実証されています。標識部分をDNAフラグメントに組み込んだ後、 GFPまたはRFPからの蛍光シグナルを保つのに十分な穏やかな条件を用いて、蛍光標識ファロイジンによるアクチン染色能を維持しながら、「Click」反応を介して検出を行います。

  • 組織切片サンプル用に最適化済み
  • 透過性の高い小さな標識
  • マルチプレックス化用に3種類の色素から選択可能
  • 穏やかな反応、GFPおよびPFPとの併用可能

Click-iT® Plus TUNELアッセイは、様々な実験条件を可能にするために、蛍光色素またはタンパク質をマルチプレックス化するために発光色を選択して、明るくて光安定性のある蛍光シグナルを生じます。

  

image of mouse intestine section stained using Click-iT Plus TUNEL Assay reagents上皮細胞でGFPを発現しているマウス腸のFFPE部分に対するアポトーシス染色を Click-iT® Plus TUNEL Assay with Alexa Fluor® 647を用いて行った。 Alexa Fluor® 555 Phalloidin を用いてアクチンを染色し、核をNucBlue® Live ReadyProbes® Reagentで染色した。

核観察型アポトーシスアッセイ選択ガイド

核の凝集またはDNA断片化などのDNA形態の変化は、アポトーシスの有効な指標です。

 
NucBlue® Live ReadyProbes® Reagent
NucRed® Live 647 ReadyProbes® Reagent
NucBlue® Fixed Cell ReadyProbes® Reagent
Readout
Fluorescent staining of nucleic acids
Target
Membrane-permeable dyes targeting RNA and DNA
Membrane impermeable dyes target RNA and DNA
Common filter set
DAPI
Cy®5
DAPI
Labels
Hoechst 33342
NucRed® Live
DAPI
Ex/Em (nm)
360/460
638/686
360/460
Signal-to-noise ratio
Photostability
Multiplexing
Yes
Yes
Yes
Live cells
Yes
Yes
No
Fixed cells
No
No
Yes
Fixable
Yes
No
No
Format
6 x dropper bottles
6 x dropper bottles
6 x dropper bottles
Cat. No.
R37605
R37106
R37606
 
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 488 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 594 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 647 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Readout
Click-iT® TUNEL Assays for DNA fragmentation provide efficient discrimination of even high levels of apoptosis in a cell population.
Conjugated dye
Alexa Fluor® 488
Alexa Fluor® 594
Alexa Fluor® 647
Standard filter set
FITC
Texas Red®
Cy®5
Ex/Em (nm)
495/519
590/615
650/670
Bibliography
Citations
Fluorescence microscopy
Yes
HCS
Yes
HTS
No
Multiplexing
Yes
Live cells
No
Fixed cells
Mild fixation and permeabilization required
Fixable
Yes
Format
1 kit (1 microplate or 50 coverslips)
Cat. No.
C10245
C10246
C10247
 
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 488 dye
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 594 dye
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 647 dye
Readout
Click-iT® Plus TUNEL Assays for DNA fragmentation provide efficient discrimination of apoptosis in tissues with multiplexing capability for organic dyes and fluorescent proteins.
Conjugated dye
Alexa Fluor® 488
Alexa Fluor® 594
Alexa Fluor® 647
Standard filter set
FITC
Texas Red®
Cy®5
Ex/Em (nm)
495/519
590/615
650/670
Bibliography
Citations
Citations
Citations
Fluorescence microscopy
Yes
HCS
Yes
HTS
No
Multiplexing
Yes
Live cells
No
Fixed cells
Mild fixation and permeabilization required
Fixable
Yes
Format
1 kit/1 microplate or 50 coverslips
Cat. No.
C10617
C10618
C10619
 
NucBlue® Live ReadyProbes® Reagent
NucRed® Live 647 ReadyProbes® Reagent
NucBlue® Fixed Cell ReadyProbes® Reagent
Readout
Fluorescent staining of nucleic acids
Target
Membrane-permeable dyes targeting RNA and DNA
Membrane impermeable dyes target RNA and DNA
Common filter set
DAPI
Cy®5
DAPI
Labels
Hoechst 33342
NucRed® Live
DAPI
Ex/Em (nm)
360/460
638/686
360/460
Signal-to-noise ratio
Photostability
Multiplexing
Yes
Yes
Yes
Live cells
Yes
Yes
No
Fixed cells
No
No
Yes
Fixable
Yes
No
No
Format
6 x dropper bottles
6 x dropper bottles
6 x dropper bottles
Cat. No.
R37605
R37106
R37606
 
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 488 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 594 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Click-iT® TUNEL Alexa Fluor® 647 Imaging Assay, for microscopy & HCS
Readout
Click-iT® TUNEL Assays for DNA fragmentation provide efficient discrimination of even high levels of apoptosis in a cell population.
Conjugated dye
Alexa Fluor® 488
Alexa Fluor® 594
Alexa Fluor® 647
Standard filter set
FITC
Texas Red®
Cy®5
Ex/Em (nm)
495/519
590/615
650/670
Bibliography
Citations
Fluorescence microscopy
Yes
HCS
Yes
HTS
No
Multiplexing
Yes
Live cells
No
Fixed cells
Mild fixation and permeabilization required
Fixable
Yes
Format
1 kit (1 microplate or 50 coverslips)
Cat. No.
C10245
C10246
C10247
 
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 488 dye
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 594 dye
Click-iT® Plus TUNEL for in situ apoptosis detection with Alexa Fluor® 647 dye
Readout
Click-iT® Plus TUNEL Assays for DNA fragmentation provide efficient discrimination of apoptosis in tissues with multiplexing capability for organic dyes and fluorescent proteins.
Conjugated dye
Alexa Fluor® 488
Alexa Fluor® 594
Alexa Fluor® 647
Standard filter set
FITC
Texas Red®
Cy®5
Ex/Em (nm)
495/519
590/615
650/670
Bibliography
Citations
Citations
Citations
Fluorescence microscopy
Yes
HCS
Yes
HTS
No
Multiplexing
Yes
Live cells
No
Fixed cells
Mild fixation and permeabilization required
Fixable
Yes
Format
1 kit/1 microplate or 50 coverslips
Cat. No.
C10617
C10618
C10619