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メチル化感受性移動度シフト アッセイ
MSMSA は、特定のアンプリコンにおけるメチル化の状態を評価する DNA フラグメント解析のひとつです。
フラグメント解析アッセイのサンプルはその後ダウンストリームの配列解析にも使用できるため、このアプリケーションはスクリーニングに最適です。 このアッセイのプライマーは、Methyl Primer Express® ソフトウェアを使用して CpG を含まない領域で設計します。そのため PCR では、メチル化の状態に左右されない増幅が可能です。
MSMSA は、特定のアンプリコンにおけるメチル化の状態を評価する DNA フラグメント解析のひとつです。
フラグメント解析アッセイのサンプルはその後ダウンストリームの配列解析にも使用できるため、このアプリケーションはスクリーニングに最適です。 このアッセイのプライマーは、Methyl Primer Express® ソフトウェアを使用して CpG を含まない領域で設計します。そのため PCR では、メチル化の状態に左右されない増幅が可能です。
メチル化感受性移動度シフト アッセイの手順
 DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。 推奨製品: DNA単離法 |
 methylSEQr™ Bisulfite Conversion Kits は、DNA サンプルに含まれる非メチル化シトシン（C）をウラシル（U）に変換します。 メチル化されたシトシンは変換されません。 バイサルファイト処理した DNA の配列を未処理の DNA と比較することでシトシンの変換を検出し（T 塩基として検出されます）、サンプルに含まれるどの CpG ジヌクレオチドのシトシンがメチル化されているかを特定します。 推奨製品: バイサルファイト処理の実行お客様に最適なキットとは？ |
 メチル化マッピングのための高品質 PCR プライマーを設計します。 お客様はプライマー設計ソフトウェアに対象領域をカット&ペーストするだけです。 このツールが CpG アイランドを検索し、in silico で DNA のバイサルファイト処理をシミュレーションします。 PCR を実行し、目的の領域を増幅します。 推奨製品: PCR の実行 |
 PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。 推奨製品: 解析サンプルの調製サイズ情報サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。 t
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 MSMSA プロファイルを解析します。 お客様に最適なデータ解析ソフトウェアとは? |
DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。 推奨製品: DNA単離法 |
methylSEQr™ Bisulfite Conversion Kits は、DNA サンプルに含まれる非メチル化シトシン（C）をウラシル（U）に変換します。 メチル化されたシトシンは変換されません。 バイサルファイト処理した DNA の配列を未処理の DNA と比較することでシトシンの変換を検出し（T 塩基として検出されます）、サンプルに含まれるどの CpG ジヌクレオチドのシトシンがメチル化されているかを特定します。 推奨製品: バイサルファイト処理の実行お客様に最適なキットとは？ |
メチル化マッピングのための高品質 PCR プライマーを設計します。 お客様はプライマー設計ソフトウェアに対象領域をカット&ペーストするだけです。 このツールが CpG アイランドを検索し、in silico で DNA のバイサルファイト処理をシミュレーションします。 PCR を実行し、目的の領域を増幅します。 推奨製品: PCR の実行 |
PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。 推奨製品: 解析サンプルの調製サイズ情報サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。 t
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メチル化感受性移動度シフト アッセイ用推奨製品
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