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Fragment Analysis Software & Data Analysis
電気泳動が終了すると、Data Collection ソフトウェアが Raw Data のサンプル ファイルを作成します。 収集したカラーデータの画像を個々のヌクレオチド塩基やフラグメント解析のアレル コールに翻訳するには、ダウンストリーム用ソフトウェア アプリケーションを使用した詳しいデータ解析が必要となります。
図 2: Peak Scanner Fragment Analysis Software
増幅したフラグメントと適切なサイズ スタンダードがポリマーを充填したキャピラリを通過し、Data Collection ソフトウェア（DCS）が検出します。 電気泳動中に、DCS は蛍光強度を時間と波長の関数として記録します。波長はCCDカメラによって検出され、さまざまな範囲の波長が特定されます。 次に、このようにして記録したピークを、ユーザーの指定した解析パラメータとサイズ スタンダードの定義に従って一次解析および二次解析ソフトウェアで処理します。
Primary Fragment Analysis
図 3: GeneMapper Fragment Analysis Software
これらのソフトウェアは、Data Collectionで収集したデータをサイズ別の断片長のピークに変換します（図 2）。 For example, our Peak Scanner Software is a primary fragment analysis tool that can be used after data collection is completed. Peak Scanner ソフトウェアによって、サイジングや表示、編集、サンプル ファイルの印刷が可能となります。 Primary fragment analysis software processes the raw data in an *.fsa file using algorithms and applies user-specified analysis settings to the results.
Secondary Fragment Analysis
These tools allow you to further refine your results. GeneMapper® ソフトウェアは、すべての Applied Biosystems® ジェネティック アナライザで高品質の DNA サイジングとアレル コールを実現する、柔軟性の高いフラグメント解析ソフトウェア パッケージです。 このソフトウェアは、断片長や多型数の解析、相対蛍光定量、マイクロサテライトや SNP のジェノタイピング、高次構造多型解析などの幅広いアプリケーションをサポートします。 In addition to the functionality in primary fragment analysis, our secondary fragment analysis software (GeneMapper software) also performs a number of functions including allele calling and report table generation (Figure 3).
製品選択ガイド: Fragment Analysis Software for Data Analysis
| ソフトウェア | タイプ | 特徴 | アプリケーション |
|---|---|---|---|
| Peak Scanner™ 2 | Primary Fragment Analysis Tool |
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| GeneMapper® ソフトウェア 5 | 一次解析および二次解析ツール |
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Regulatory Status: 研究目的の使用のみとなっております。 診断にはご使用になれません。