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次世代シーケンスのためのIon PGM™システム
最も多く販売されているベンチトップ シーケンスソリューション がさらに改良
Ion AmpliSeq™テクノロジー、Ion PGM™システム、Ion Chef™システムを利用すれば、DNAサンプルから出力された変異のアノテーションまで2日のワークフローで完了します。
複数遺伝子のパネルに対しターゲットカバー率100%にも達し、Torrent Suite™ソフトウェア（Ion Torrent™用解析ソフトウェア）と改良されたバリアントコールアルゴリズムに基づく高品質なコンセンサス配列により、SNP検出を可能にします。
Ion PGM™ v2チップは1サンプルあたりのコストを大幅に低減。またIon PGM™システムは他の次世代シーケンサにくらべ手が届く予算で導入いただけます。
イオン半導体シーケンスにより、高性能な次世代シーケンサを誰でも利用できるようになりました。
今、より多くの研究室が強力な次世代シーケンス技術を導入することで、より速く研究の答えを手にすることができるようになりました。その鍵となるのは、スループットや精度の向上、そしてサンプル調製からデータ解析までの扱いやすいワークフローです。Ion PGM™ システム システムにより、ヒト疾患に携わる研究者がターゲットシーケンスによりがんや遺伝性疾患から変異を検出することができるようになりました。また微生物学者は細菌やウイルスを簡単に分類し、新規の微生物を分類することもできます。微生物ゲノムシーケンスソリューションのダウンロード
扱いやすく短時間のワークフロー
Ion AmpliSeq™テクノロジー、Ion PGM™システム、そしてIon Chef™システムにより自動化されたテンプレート調製方法を組み合わせることで、遺伝子パネルシーケンスのワークフローを簡単で短時間にしました。高マルチプレックスのIon AmpliSeq™ DNAパネルでは、他のシステムと比べてわずか半分の時間で生物学的に意味のある結果を入手することができます。またIon Chef™システムでは、ライブラリをセットすればシーケンス用チップ調製が自動で行われ、Ion PGM™システムにより迅速にシーケンスできます。サンプルから結果を得るまでに遠心分離のステップはなく、他のNGSワークフローに比べてピペッティング操作やハンズオンタイムが半分で済みます。
サンプルから結果を得るまでの時間が半分に短縮
Ion AmpliSeq™パネルにより、ディープシーケンシングの際、全ゲノムシーケンシングに関与した時間のかかるバイオインフォマティクス解析をする必要がなくなりました。
Tania Tabone 博士、 ポスドク研究員
西オーストラリア州がん評議会（Cancer Council Western Australia）
西オーストラリア大学、病理・臨床検査学部（Pathology and Laboratory Medicine, University of Western Australia）
Ion AmpliSeq™テクノロジーが私たちのニーズに応えてくれると信じて、Ion PGM™シーケンサを選びました。まずはじめに、カスタムデザインできるという点で臨床研究の需要に合致しています。次に、Ion AmpliSeq™テクノロジーはとても簡単に利用でき、NGSの経験が浅い技術者でも使えることが重要です。第3に、Ion PGM™ ではIon AmpliSeq™パネルのデータ解析を簡単に行うことができます。そして何より重要なのが、Ion AmpliSeq™シリーズが私たちの目指す臨床研究市場にちょうど良い利用しやすい価格に設定されていることです。
Zhao WeiWei, 技術部長
Kingmed Diagnostics
中国広州市
高精度な遺伝子パネル
遺伝子パネルのシーケンスで最も重要なのは、信頼できるバリアントコールです。Torrent Suite™ソフトウェアは遺伝子パネルシーケンスに欠かすことができません。この新しいTorrent Suite™ソフトウェアv3.6は、Ion AmpliSeq™ カタログパネルやCommunityパネル用に最適化されたバリアントコールを特徴とし、厳密性の高低または生殖細胞もしくは体細胞研究に応じたパラメータや初期設定解析モードを簡単に調整できます。
現在、さまざまな遺伝子解析がIon PGM™システムで行われています。データ解析により、実験的アプローチによる特異性が99%、解析感度の最高値が99%、そして信頼度が99%をいう結果が得られました。ハンズオンタイムの削減により、技術スタッフがラボの他の作業により多くの時間を割けるようになりました。
Jose Carlos Machado 博士
分子病理・免疫学研究所（Institute of Molecular Pathology and Immunology）
ポルト大学、医学部（Faculty of Medicine at the University of Porto）
主任研究員およびトランスレーショナルリサーチ
これまでIon AmpliSeq™ BRCA 1& 2 パネルとIon PGM™シーケンサにより65の異なるサンプルのシーケンスを実施しましたが、今まで変異を見落としたことはありません。私たちのデータからサンガー法によるシーケンスと同等の感度が示され、ホモポリマー領域の解析に取り組んできました。
Marcel Nelen 博士
人類遺伝学部腫瘍遺伝学研究室（Department of Human Genetics, Laboratory of Tumor Genetics）
ラドバウド大学ナイメガン医療センター（Radboud University, Nijmegen Medical Centre）
オランダ
1000人ゲノムプロジェクトによって作成されたヒト変異カタログによると、正常ヒト変異の90%超が1塩基多型、すなわちSNPに起因しています。つまり正常変異の多くをSNPが占めるのです。がんゲノムアトラスプロジェクトにより、20種のがんを網羅するがんエクソームデータからなる大型データセットが作成されました。4000超サンプルのうち、最もよく見られた20のがん遺伝子中で頻繁に生じた体細胞変異を解析したところ、その99%でがん遺伝子の変異がSNPに起因していました。
SNPは、塩基置換変異を最も正確に検出できるプラットフォームで測定するのが適しています。最近Nature Biotechnology誌に発表された 論文 （doi:10.1038/nbt.2522）によると、Ion PGM™ 200ベースシーケンシングキットを用いてIon PGM™システムから得られたデータが、他のあらゆるベンチトップ次世代シーケンサと比較し最も低い塩基置換エラー率を示しました。
低ランニングコスト
第2世代Ionチップにより、チップあたりのサンプル数が増加、サンプルあたりのコストを大幅に低減しました。Ion 314™、316™ v2チップのスループットはそれぞれ10倍の100 Mbと1 Gbに増加し、Ion 318™チップは2倍の2 Gbになりました。例えば、バーコード化サンプルをIon 318™ Chip v2を用いて一般的な200アンプリコンのIon AmpliSeq™カタログパネルで解析した場合、サンプルあたりのコストは100ドル程度です。
以前に、Ion 314v1のチップでIon AmpliSeq™ BRCA 1 & 2の3つの臨床研究サンプルをシーケンスしました。v2チップを用いることで、チップあたり解析できるサンプル数が5サンプル増えました。特に、期待するリード長を持つリード数が増え、これら完全長リードの質も向上していました。全体的にシーケンスの質は向上し、スループットも高くなっています。
José Luis Costa博士、ポスドク研究員
分子病理・免疫学研究所（Institute of Molecular Pathology and Immunology）
ポルトガル、ポルト
新しい318™チップを用いた初期の研究では、非常に高いローディング効率が再現性よく得られました。このため、安定した高いスループットにより、以前より多くのサンプルをバーコード化することでサンプルあたりのコスト削減につながることを期待しています。
Dag Harmsen医学博士、教授
歯周病学研究部門長（Head of Research Department of Periodontology）
ドイツ、ミュンスター大学病院（University Hospital Münster）
すべての人に手頃なシーケンス技術を提供することで、Ion Torrent はライフサイエンスに変革をもたらしています。 Ion PGM™システムは他の次世代シーケンサの半分程度の予算で導入いただけます。
おもな製品分野
製品& サービス
Ion Torrent™シーケンサ、チップ、試薬、アクセサリーの詳細情報とご注文について
コミュニティ
Ion Torrent™コミュニティは製品を使用する研究者らがコラボレーションして投稿しています。ぜひご参加ください。
*同等の遺伝子パネルとの比較に基づいています。
**ここで提供される内容は正式販売されていない製品に関する場合があり、予告なしに変更されることがあります。
研究目的の使用のみとなっております。 診断にはご使用になれません。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.