Search Thermo Fisher Scientific
Ion Torrent次世代シーケンサによるヒト・マウスのためのターゲットトランスクリプトームシーケンス
Ion AmpliSeq Transcriptome Mouse Gene Expression Kit
Ion AmpliSeq™ Transcriptome Mouse Gene Expression Kit と Ion GeneStudio™ S5 シリーズシステムをお使いいただくことで、限られた量のサンプルから迅速で手頃な価格で遺伝子発現解析を可能にします。わずか 10 ng の RNA から迅速なワークフローで、1 本のチューブで 20,000 を超える RefSeq 遺伝子の発現解析を行うことができ、腫瘍学およびトランスレーション研究において重要なツールとなります。
- 少ないサンプル量—わずか 10 ng のトータル RNA
- 簡単なワークフローによる迅速な遺伝子発現プロファイリング—Ion GeneStudio S5 シリーズおよび Ion Chef システムで自動化されたワークフローにより、RNA から 2 日以内（ハンズオンタイムはわずか 45 分）でデータ取得
- 合理化されたデータ解析—Torrent Suite Software を使用して既存の解析ソフトウェアにデータをエクスポート
Ion AmpliSeq Transcriptome Mouse Gene Expression Kit
Ion AmpliSeq マウス遺伝子発現キットデータと全トランスクリプトーム RNA-Seq データとの間の DEG の相関は 0.943
Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit
Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit および Ion GeneStudio S5 シリーズシーケンスシステムをお使いいただくことで、わずか 10 ng のRNAから FFPE サンプルにも対応の迅速なワークフローで、20,000 を超える RefSeq 転写産物の発現解析を行うことができ、お客様の研究を一変させることができます。
- 何週間もかけてサンプルをプールする必要がなく、高いコスト効率でトランスクリプトームシーケンシングを実現
- ライブラリー作製のハンズオンタイムは約1時間、RNA から遺伝子発現解析まで 2 日以内で遺伝子レベルの発現の解析を完了
- 既存のダウンストリームのマイクロアレイや次世代シーケンシング（NGS）パイプラインを活用。簡単で自動化された、遺伝子レベルの発現データ解析が可能
- わずか 10 ng の RNA から貴重なFFPEサンプルの解析が可能
関連資料・論文
Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit flyer
Read the Ion AmpliSeq Transcriptome app note to see a streamlined workflow for gene expression analysis
Read the Ion S5 application note to see how the Ion S5 System can be used for cancer genomics and transcriptomics research
Ion AmpliSeq™ Transcriptome Kit を用いて、トリプルネガティブ乳がんにおける遺伝子発現シグネチャーを探索
RNA-Seq ライブラリー調整の方法は1つしかないのでしょうか？インディアナ大学の Milan Radovich 博士が、トリプルネガティブ乳がんにおける発現に基づく遺伝子シグネチャーの研究について語っています。
定量的および遺伝子発現差解析表現型情報と遺伝子発現、および細胞経路分析を相関、遺伝子調節の分析を含む多くの生物学的研究用途の基本です。従来の遺伝子発現プロファイリング方法は、ハイブリダイゼーションベースの（マイクロアレイ）および増幅ベースの（qRT-PCR）技術を含む。ただし、メソッドにはいくつかの制限があります。
- 大量のRNAを必要とし、マイクロアレイはそれらの感度および特異性において制限される
- RT-PCR は遺伝子発現解析のゴールドスタンダードとして認められていますが、一般的にはスループットが低く、大量の遺伝子をテストする場合は相当量の RNA が必要です
そのため、FFPE 組織からの分解された RNA など、量または質が限られているサンプルを解析する場合、どちらの技術もワークフローの課題があります。NGS と Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit を使用したターゲットシーケンスでは、絶対的な発現を定量するだけでなく、分解されていないものと分解されたものの両方について、迅速かつ容易に低存在量の転写物を同定し、定量できます。
Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit および Ion Proton™ システムを使用し、遺伝子レベルの転写産物の検出感度が向上。MAQC マイクロアレイデータおよび Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit により同定された遺伝子の一致を示したベン図。
Ion AmpliSeq Transcriptome Human または Mouse Gene Expression Kit のワークフロー
逆転写反応を行い、1 回の反応で 20,000 以上のターゲットを増幅
製品：
- Ion AmpliSeq Transcriptome Human または Mouse Gene Expression Kits
- AmpliSeqRNA プラグインを実行し、簡単で使い易いリードカウントデータファイルを生成
- 簡単な統計解析を実施、または既存のマイクロアレイ解析パイプラインにファイルをインポート
逆転写反応を行い、1 回の反応で 20,000 以上のターゲットを増幅
製品：
- Ion AmpliSeq Transcriptome Human または Mouse Gene Expression Kits
- AmpliSeqRNA プラグインを実行し、簡単で使い易いリードカウントデータファイルを生成
- 簡単な統計解析を実施、または既存のマイクロアレイ解析パイプラインにファイルをインポート
Ion GeneStudio S5 シリーズシステム
ラボへの NGS の導入は、以前よりもシンプルです。Ion GeneStudio S5 シリーズ次世代シーケンシングシステムは、卓越したスピードと価格で、お客様のラボにもっともシンプルなターゲットシーケンシングワークフローをお届けします。パワフルなシステムでよりお客様の研究をサポートいたします。弊社の NGS システムはモジュール式に構成されているため、ひとつのシステムで複数のターゲットシーケンスアプリケーションを柔軟に実行できます。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.