TaqMan hPSC Scorecard Assay

PSC の三胚葉分化能の定量分析

Applied Biosystems TaqMan hPSC Scorecard Panel は、リアルタイム qPCR アッセイと直観的に操作できるデータ解析ソフトウェアを用いて多能性および三胚葉への分化能の評価を行います。hPSC Scorecard アッセイは Alex Meissner 氏との共同により開発され、同氏の著名な論文(Cell 2011 144:439–452)に基づいています。付属の解析ソフトウェアを利用することにより、世界中の研究者は、自身の細胞株の遺伝子発現プロファイルを共通のリファレンスセットと比較することが可能になります。

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TaqMan hPSC Scorecard アッセイを選ぶ理由

Scorecard から得られる利点に関して、RUCDR/Infinite Biologics の Jennifer Moore 氏からのメッセージ

機器の要件

機器の要件

TaqMan hPSC Scorecard Panel と互換性のある機器、およびそれらのセットアップ方法をご確認ください。

データ解析

データ解析

TaqMan hPSC Scorecard Panel には、直感的に操作できるウェブベースの解析ソフトウェアへの無料アクセス権が含まれており、これにより、ご自身のサンプルの遺伝子発現プロファイルをリファレンスセットの遺伝子発現プロファイルと定量的に比較できます。

CellModel サービス

CellModel サービス

Scorecard Panel を利用するためのリソースや機器が不足していませんか?当社がお手伝いします !

どのようなものですか?

TaqMan hPSC Scorecard Panels は、胚性幹細胞および人工多能性幹細胞の両方の細胞株に関して、多能性(三胚葉分化能)を定量的に確認します。
hPSC Scorecard Panel(96 および 384 ウェルのフォーマット)は、93 遺伝子の TaqMan Gene Expression assays(内在性コントロールを含む)があらかじめアッセイプレートのウェルに乾燥状態でプレーティングされています。この遺伝子パネルは Alex Meissner 氏と共同で開発され、同氏の画期的な論文(Cell 144:439-452 (2011))に基づいています。

TaqMan hPSC Scorecard Panel


TaqMan hPSC Scorecard Panel でできること:

  • 多能性および三胚葉への分化能を定量的に評価
  • 発現プロファイルとリファレンススタンダードとの比較
  • 予めアッセイがプレーティングされているため操作が簡便で、直感的に操作できる専用ソフトウェアで解析


プロトコルの概要:

  1. 未分化細胞、自発的分化(EB)または誘導(単一層)分化のサンプルを用意
  2. RNA の抽出と精製
  3. cDNA の調製
  4. 互換性のある機器でリアルタイム PCR を実施 
  5. hPSC Scorecard 解析ソフトウェアに .eds ファイルをアップロード
  6. データを解析し、その結果をクラウドベースの解析アプリケーションからエクスポート
     

hPSC Scorecard Assay の流れ

未分化の ESC/iPSC

分化した ESC/iPSC:胚様体 (第 1 週)- または - 直接分化した細胞

サンプルの要件: >1 x 106 細胞/サンプル

RNA 抽出

組成

TRIzol 有機相抽出

サンプルの要件:6 cm 培養ディッシュあたり TRIzol 試薬 1 mL

[RNA](mg/mL)= A260 * 40

推奨される A260/A280 比 = 1.6 ~ 1.8

直観的に操作できる解析ソフトウェアを用いて TaqMan hPSC Scorecard Panel からのデータを解析

hPSC Scorecard 解析ソフトウェアにサインイン

未分化の ESC/iPSC

分化した ESC/iPSC:胚様体 (第 1 週)- または - 直接分化した細胞

サンプルの要件: >1 x 106 細胞/サンプル

RNA 抽出

組成

TRIzol 有機相抽出

サンプルの要件:6 cm 培養ディッシュあたり TRIzol 試薬 1 mL

[RNA](mg/mL)= A260 * 40

推奨される A260/A280 比 = 1.6 ~ 1.8

直観的に操作できる解析ソフトウェアを用いて TaqMan hPSC Scorecard Panel からのデータを解析

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For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.