Search Thermo Fisher Scientific
自下而上蛋白质组学
根据各部分之和测定整体
定性或自下而上蛋白质组学仍然是大多数蛋白质组学实验的主要手段。该工作流程的目的是尽可能多地鉴定生物样品中的蛋白质成分。自下而上蛋白质组学实验方法首先将蛋白质酶解为其多肽组分，然后用液相色谱 (LC) 分离这些组分，最后通过质谱分析鉴定多肽。产生的序列数据用于确定样品的原始组分。
本页内容
了解自下而上蛋白质组学方法
蛋白质组学的主要工作是自下而上分析，大多数蛋白质组学工作流程都涉及使用自下而上策略。在这种方法中，通常首先使用胰蛋白酶对蛋白质进行酶解消化。此操作将产生多肽，然后采用一种或多种 LC 技术分离这些多肽。通过电喷雾电离使 LC 洗脱液带电，然后在质谱仪中对多肽进行裂解和鉴定。
在广泛的动态范围内从复杂生物样品中得到高质量的多肽鉴定结果是自下而上蛋白质组学中极具挑战性但不可或缺的一个方面。幸运的是，高分辨精确质量数 (HRAM) Thermo Scientific Orbitrap 质谱仪具有出色的质量分辨率和精度，以及裂解性能和速度。多种裂解技术（CID、HCD、ETD 和 EThcD）可确保较大限度覆盖所分析多肽的序列。这些 Orbitrap 系统品质相结合，能够在复杂蛋白质组样品中实现比以往更高、更详细的自下而上蛋白质鉴定。
一旦生成原始分析文件，Thermo Scientific 蛋白质组学软件将挖掘丰富的 HRAM Orbitrap MS 数据，并将大型数据集转换为有意义的洞察信息。
自下而上蛋白质组学仪器
 Orbitrap Eclipse Tribrid 质谱仪 |  Orbitrap Exploris 480 质谱仪 |  Orbitrap Exploris 240 质谱仪 | |
| 优点 | 从蛋白质组全谱分析和定量、结构表征到多通路单细胞蛋白质组学，帮助您获取错综复杂的分子和生物系统的深入洞察信息。借助新型创新技术在实验范围内提供极大的灵活性，助您更快速地获取有影响力的结果，从而进一步突破当前科研成果。 | 从非靶向蛋白质组谱到靶向蛋白质组学实验，凭借行业领先的单细胞灵敏度，以及出色的准确度、精确度和简便性，获取较深入的定量洞察信息。借助可提供更高可用性的精选工作流程，该质谱仪可以加快您开展大规模研究的速度，提供经过验证的高质量数据并节省时间，使您可以更快地获取切实可行的结果。 | 将您的能力从小规模研究扩展到大规模研究，涵盖蛋白质鉴定、定量及多通路蛋白质组学研究等各种应用。凭借经过优化的方法，它能够快速将样品转换为结果，且操作简单。整合出色的性能，且占用空间小，便于日常使用。 |
| 分辨率 | 在 m/z 200（1M 选项）时可达 7,500-500,000 FWHM | 在 m/z 195 时可达 480,000 | 在 m/z 200 时可达 240,000 FWHM |
| 扫描速度 | 最高 40Hz | ||
| 质荷比范围 | 50 至 6,000（HMRn 可达 8,000） | 40 至 6,000 m/z（BioPharma 选项可达 8,000 m/z） | |
| 动态范围 | >5,000，同一张 Orbitrap 分析所得谱图内 | >5000:1 | |
| 质量精度 | 内标校准 < 1 ppm RMS；外标校准：<3 ppm RMS | ||
Thermo Scientific FAIMS Pro Duo 接口提高了母离子选择性，改善了大多数肽和蛋白质应用的定性和定量结果，同时减少了耗时的样品制备步骤。FAIMS Pro Duo 接口通过气相分馏和选择性增强肽化合物、降低 MS 谱图的复杂性并改善分析物信噪比，提高了分析性能。最终可实现更高的蛋白质组覆盖率、更高的灵敏度和更准确的定量。
自下而上蛋白质组学软件
利用强大的数据挖掘工具
Thermo Scientific Proteome Discoverer 软件是自下而上蛋白质组学研究较全面的数据分析平台。该软件提供了一套综合工具，可通过 SEQUEST HT、Mascot 和 Byonic 搜索引擎对 CID、HCD、ETD 和 EThcD 碎裂图谱进行数据挖掘，包括从单次运行中多种碎裂模式产生的混合原始文件获得的谱图。因此，Proteome Discoverer 软件可提供可靠的 PTM 鉴定和位点定位信息。
自下而上蛋白质组学工作流程
点击图片以放大
相关资源
相关支持