蛋白质组学质谱工作流程

蛋白质酶解和标记技术与液相色谱和质谱 (LC-MS) 技术联用，为鉴定和定量多肽、蛋白质和翻译后修饰 (PTM)（如磷酸化和糖基化）提供了强有力的方法。我们为您的蛋白质组学质谱工作流程提供了一系列产品解决方案、方法和实验方案，涵盖蛋白质发现和定量，以及蛋白质结构和功能的研究及分析。

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• 单细胞蛋白质组学
• 推荐用于蛋白质组学的质谱仪

定性或自下而上的蛋白质组学工作流程旨在通过一系列方法和协议（包括蛋白酶解、LC 分离、质谱和数据解析）尽可能多地鉴定出生物样品中的蛋白质成分。

磷酸化是蛋白质中研究较多和较重要的翻译后修饰之一，通常称为磷酸蛋白质组学，在调节许多细胞过程以及涉及样品富集、分离、质谱和数据挖掘和磷酸肽数据测量的工作流程中发挥着核心作用。

糖基化在各种生化过程中起着至关重要的作用，因为许多聚糖会发生与疾病相关的表达水平变化，而对变化的检测和量化提供了关键的诊断信息。标准工作流程涉及样品富集、质谱分析以及多种裂解方法以确定聚糖成分。

我们的转化蛋白质组学工作流程提供了大规模研究所需的标准化和可重现性，同时也有助于引导和加速从发现到临床应用的过程，包括发现蛋白质生物标志物以应用于测试、治疗和实践，从而帮助改善人类健康。

使用 TMT 标记试剂、LC-MS 仪器和蛋白质组学数据软件进行高通量多通路蛋白质定量分析，实现对更多样品同时进行相对定量分析。

在体内标记蛋白质，用氨基酸的同位素重形式替代天然存在的轻形式，然后使用 HRAM Thermo Scientific Orbitrap MS 分析和多肽计算软件进行加速、精确鉴定和相对定量。

对任何来源的蛋白质样品进行相对定量，使用高性能 LC-MS 仪器单独进行测试和分析，然后使用 Thermo Scientific Proteome Discoverer 软件中的先进非标记定量节点进行大规模评估和解析。

我们新推出的基于 PRM 方法的靶蛋白绝对定量，使用 Thermo Scientific SureQuant 靶向检测试剂盒和 Orbitrap MS，能够在一系列样品中可靠地检测和定量数百到数千个靶标，同时保持速度、灵敏度和整体性能。

在自上而下蛋白质组学中，在 MS 分析之前没有预先将蛋白质酶解成其相应的肽段，从而带来了诸如定位 PTM、检测降解产物和确定序列变体等优势。

此强大技术用于检测蛋白质-蛋白质相互作用，可与冷冻电镜或 X 射线晶体学结合使用，以获取结构信息并通过让研究人员在蛋白质复合物或单个蛋白质内创建远距离图像来实现相互作用区域的可视化。

HDX-MS 在氘化溶液中与氘交换蛋白质中的质子，交换速率提供了用于推断蛋白质结构和构象信息以及蛋白质复合物中蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体相互作用位点的信息。

使用非变性质谱法研究处于生物状态的完整蛋白质、非共价蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体复合物，对于单个蛋白质，检验特定位点的预期翻译后修饰模式及程度。

在获取蛋白质-蛋白质相互作用的动态视图方面，亲和纯化可与质谱联用以检验复杂样品中的蛋白质子集，或使用邻近生物素化方法在相互作用组水平上观察蛋白质；另外还可检验 PTM 的作用。

完整蛋白质的全面表征通常以已富集或纯化的蛋白质为研究对象，然后通过直接进样或液相色谱和电喷雾电离将其引入质谱仪。

测定样品的原始蛋白质成分，或蛋白质复合体识别单个蛋白质、亚基和PTMs的化学计量学，使用蛋白质被酶解到其多肽组分的序列数据，然后用LC-MS/MS分析。

通过引入有限量的酶来执行测序和探测蛋白质复合体的四级结构，然后进行质谱采集，类似于自下而上的蛋白质组学工作流程。