磷酸化蛋白质组学

质谱分析中的还原与富集

磷酸肽富集降低了样品的复杂性，并且由于磷酸肽的化学计量低和电离度较差，因此需要在质谱分析之前进行。Thermo Scientific High-Select Fe-NTA 磷酸肽富集试剂盒和 High-Select TiO2 磷酸肽富集试剂盒可为质谱分析快速选择性富集磷酸化多肽。High-Select Fe-NTA 磷酸肽富集试剂盒使用铁螯合树脂离心柱，而 High-Select TiO2 磷酸肽富集试剂盒则使用 TiO2 离心吸头和经过优化的缓冲液。这两种色谱柱都能富集 0.5-5 或 3 mg 的总蛋白消化物。

加快磷酸化蛋白质组学工作流程

典型的磷酸化蛋白质组学工作流程包括样品富集，然后使用互补碎裂技术（CID、HCD、EThcD 和 ETD）进行质谱 (MS) 分析。这些磷酸化蛋白质组学质谱工作流程能够对磷酸化位点进行灵敏且确凿的结构解析。

无论是单个蛋白质分析还是大规模分析，反相液相色谱法 (RP-LC) 都能成功分离磷酸肽。Thermo Scientific 低流量 RP-LC 系统与现有磷酸化蛋白质组学工作流程和 Orbitrap 质谱仪实现了无缝集成。Thermo Scientific Vanquish Neo UHPLC 系统是磷酸化蛋白质组学的首选系统。Vanquish Neo UHPLC 系统整合了出色的创新技术，可全天候以极佳性能为各种高灵敏度 LC-MS 工作流程提供复杂混合物可重现的分离。

助您突破当前科研成果

当今的前沿研究推动 LC-MS 超越极限。更快地获取高置信度的洞察信息，以准确分辨细微差异并避免代价高昂的死胡同，这一需求比以往任何时候都更为迫切。Thermo Scientific Orbitrap Eclipse Tribrid 质谱仪借助新型创新技术超越了这些极限，提供了扩展实验范围的极高灵活性，并具有内置智能以确保获得极高的数据质量和信心。通过单一系统提供出色洞察力，助您高效地突破当前科研成果。

提高鉴定率，增加通量

数据依赖性决策树 (DDDT) 逻辑可用于所有 Thermo Scientific 组合型线性离子阱 Orbitrap 质谱仪，包括 Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos 质谱仪。与仅使用 CID 或 ETD 的分析相比，DDDT 方法提高了磷酸肽鉴定率，并增加了通量。与单独使用 HCD 或 ETD 相比，新引入的 EThcD 能够更彻底地裂解未修饰多肽和磷酸化多肽，并更可靠地定位磷酸化位点。

提高数据准确性，减少假阳性

磷酸化发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上，对准确分析磷酸肽数据构成挑战。解决方案是高分辨精确质量数 (HRAM) MS，它不仅能生成准确的数据，而且还能降低错误发现率。Thermo Scientific Proteome Discoverer 软件拥有对 HRAM-MS 混合原始文件（包括那些包含多个裂解谱的文件）进行数据挖掘所必需的一整套工具。该软件的新功能 IMP-ptmRS 提供了一种磷酸化位点置信度测量算法，可提高 LC-MS/MS 数据集的磷酸化蛋白质组覆盖率。