multiplexed sequencing is simple with Collibri Stranded RNA Libraries

Collibri Stranded RNAライブラリは、シングルインデックスおよびデュアルインデックスライブラリでマルチプレックス法が可能です。 

  • シングルおよびデュアルインデックスライブラリのマルチプレックスシーケンシングにより、2回のシーケンシングを実施した場合と比較してコストを削減できます
  • Collibri Stranded RNAライブラリと組み合わせインデックス(CD)のサンプルシートでi5インデックスシーケンスを指定します

Illuminaシステム用Invitrogen Collibri Stranded RNAライブラリ調製キットは、高品質かつ短時間、4.5時間(mRNA)または6.5時間(rRNA除去を含む全トランスクリプトーム)シーケンシング対応ライブラリを調製し、FFPEサンプルを含むさまざまな品質のRNAサンプルに適しています。Collibri Stranded RNAキットを使用すると、Illumina次世代シーケンシング(NGS)システムでシングルまたはデュアルインデックスプライマーを使用して、ストランド特異的RNAシーケンシング用のcDNAライブラリを構築できます。

シングルインデックスプライマーはCombinatorial Dual(CD)インデックスバージョンで、デュアルインデックスプライマーはUniqueDual(UD)インデックスバージョンで提供されています。

  • i7インデックスのみを読み取る必要があるため、短いラン時間が必要な場合は、シングルインデックス(CD)をお勧めします
  • デュアルインデックス(UD)は、ンデックスホッピングの影響を最小限に抑え、サンプルのデータ整合性を保護するために、推奨されていますイ

シングルおよびデュアルインデックスライブラリのマルチプレックスシーケンシングにより、コストを削減できます

NGSシステムのスループット向上により、マルチプレックスシーケンシングはサンプルあたりのシーケンシングコストを削減する魅力的なオプションとなりました。サンプルシートを一度修正するだけで、シングルおよびデュアルインデックスを持つライブラリを、1回のシーケンスランでマルチプレックスとすることができます。Collibri Stranded RNA Library Prep Kit(CD)で調製したシングルインデックスライブラリをデュアルインデックスライブラリでプールするには、以下のシーケンスを使用してサンプルシートにi5インデックスを示す必要があります。

  • MiSeq™、HiSeq™ 2000、HiSeq™ 2500、およびNovaSeq™ 6000システム用のTCTTTCCC(図 1)
  • iSeq™ 100、MiniSeq™、NextSeq™、HiSeq™ 3000、およびHiSeq™ 4000システム用のAGATCTCR

その後、下流の解析のためにリードを逆マルチプレックス化して2回の別々のシーケンスランの必要がなくなります。

i5インデックスは、Collibri Stranded RNA Libraries with CDインデックスで一貫性があります。

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.