NGS Master：一貫したNGSライブラリ調製を低コストで実現

SPT Labtechのmosquito® およびdragonfly(R)自動化分注システムは、従来のボリュームと比較して非常に少量でNGSライブラリを効率的に調製し、最大10倍の削減を実現します。ミニチュアライゼーションにより、Illuminaシステム用Collibri NGSライブラリの品質を維持しながら、コストを節約できます。

SPT Labtechによって開発された自動化スクリプトを使用することで、ライブラリ調製キットおよびアクセサリなどのCollibriポートフォリオでの時間を節約できます。

より高いスループットを必要とするユーザーは、すべての試薬分注ステップをするためmosquito® HVと一緒にdragonfly® discoveryを使用して、行うことができます。このdragonfly® discoveryにより、試薬の非接触分注を迅速に行うことができ、プラスチック消耗品の消費も大幅に削減されます。

NGSライブラリ調製法を自動化する場合、均一なカバレッジを維持し、バイアスを最小限に抑えることが重要です。GCバイアスは、不均一なカバレッジの最大の要因が、最適なPCRマスターミックスまたは PCR フリーのライブラリ調製法を使用することで、最小限に抑えることができます。Collibri DNAライブラリ調製キットにはCollibri Library Amplification Master MIXが含まれており、幅広いGC含量にわたって均一なカバレッジを実現します。当社のクラウドベースプラットフォームであるConnectを介して、お客様の分析パイプラインでの分析用に代表的なFastqファイルをご利用いただけます。

サンプルのリクエスト

ミニチュアライゼーションにより、NGSライブラリ調製試薬の量が10分の1に減少し、従来の自動化を使用した場合よりも少ないコストで各サンプルの5～6レプリケートを生成できます。1サンプルあたり5～6回のシーケンスでは、1つのサンプルが正常にシーケンスされなかった場合に、ライブラリ調製プロセスまたはシーケンスランを繰り返す必要がありません。そのため、サンプルが最初に正常にシーケンスされる可能性が向上します。

NGSライブラリ調製キットおよびアクセサリのCollibriポートフォリオの各試薬には、ライブラリ調製の進捗を視覚化するためのトラッキング色素が含まれています。試薬が完全に混合されると、溶液の色が変化し、適切なライブラリ調製技術が示されます。ライブラリ調製プロセスの各ステップには、試薬色の形で内部制御が含まれており、NGSライブラリ生成の成功率が向上します。トラッキング用色素は、ライブラリの定量前に除去され、シーケンシングの妨げになりません。