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Collibri NGS Whole-Genomeライブラリ調製キット（超音波による断片化法）
ゲノム解釈におけるバイアスの低減
ハイスループット Illumina System 用 Invitrogen Collibri Physically Sheared（PS）DNA ライブラリ調製キットによる困難な領域のカバレッジは、少量のサンプル （1 ng）でも多量のサンプル（1,000 ng）でも一貫性が維持されています。このため、従来のキットによるライブラリ調製法と比較して、より高い精度でライブラリ調製が可能です。24反応または96反応サイズがあり、 Unique Dual Indexe（UDI）にを使用することで、パターン化フローセル上でインデックスホッピングされたリードを排除することができます。
高い信頼性でバリアントを検出
Illumina システム用 Collibri PS DNA ライブラリ調製キットおよび Illumina システム用 Collibri PCR-Free PS DNA ライブラリ調製キットでは GC カバレッジにも一貫性があるため、1 ng ～ 1,000 ng の DNA において一貫して一塩基多型（SNPs）および挿入／欠失（INDEL）の検出が向上します。従来のライブラリ調製法と比較して、検出感度が向上しています。
図 1.Coriell NA12878 DNA をライブラリーに変換し、Illumina™ NovaSeq™ 6000 システム上で各サンプルに関して 372M リードでシーケンシングを行いました。FreeBayes v1.2.0 を使用して算出した SNP リコール
FFPE サンプルからでも、困難な領域のカバレッジが向上
一貫性のある GC カバレッジにより困難な遺伝子領域の高いカバレッジが実現し、より一貫性の高い全ゲノムカバレッジが得られます。1 ng ～ 1,000 ng において、困難なゲノム領域のカバレッジが一貫して向上しています。
図 2.100 ng の中等度に損傷した Horizon™ の FFPE DNA を、メーカーが推奨するプロトコルを使用してシーケンシングライブラリに変換し、Illumina NovaSeq 6000 システム上で 2x150 bp のリード長でシーケンシングしました。得られたパスフィルター（PF）リードは、186 m リードに正規化しました。
PCRの選択肢
Collibri PS DNA ライブラリ調製キットにおけるアダプター付加は PCR が不要で、PCR フリーのプロトコルは 500 ng ～ 1,000 ng で使用可能です。Collibri ライブラリ定量キットにより測定した 500 ng のインプット DNA からのライブラリ収量は、Illumina NovaSeq 6000 システム上にいおける定量および複数回の実行を完了させるのに十分な量です。
PCR フリーキットまたは低インプットキットの詳細かこちら。
図 3.メーカーが推奨するプロトコルを使用して Coriell NA12878 DNA からシーケンシングライブラリを調製し、Collibri ライブラリ定量キットを用いて濃度を測定しました。
より迅速なワークフロー全体をサポート
より迅速なライブラリ調製プロトコルに加え、DNA 抽出、定量、ライブラリ調製およびライブラリ定量ステップを含むすべてのワークフローに関するサポートがお客様のラボの効率を向上させます。トラブルシューティングではなく、サイエンスの探求により多くの時間を使うことができます。
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図 4.Collibri PCR-Free PS DNA ライブラリ調製キットのプロトコルは 1.5 時間以内で完了し、全ワークフロー時間を約6.5時間に短縮します。
全ゲノムライブラリ調製ワークフロー
ゲノム DNA 抽出
当社では、プロセス効率およびダウンストリーム性能を最大限に高めるために、幅広い種類の出発材料からの高感度かつ拡張可能な精製に向けて、さまざまなゲノム DNA 抽出キットを提供しています。組織、細胞、血液、血清、植物、法医学サンプルなど、さまざまなサンプルからゲノム DNA を精製するための幅広い種類のキットが含まれます。
磁気ビーズをベースとする技術と KingFisher 装置を使用した自動 DNA 抽出により DNA を結合、洗浄および溶出させ、高収量かつ優れた再現性を維持しながら操作時間を短縮させることができます。
感度および特異性の高い核酸定量
Qubit dsDNA 高感度（HS）および広範囲（BR）アッセイは、RNA および一本鎖 DNA（ssDNA）よりも二本鎖 DNA（dsDNA）に高い選択性を示します。この高感度アッセイは、dsDNA を低濃度で含むサンプルに推奨され、貴重なサンプルへの使用に理想的です。
推奨付属製品
- スループットニーズが変わる場合は、96 ウェル 0.2 mL ブロックを別のブロックタイプと交換
- モバイルアプリでリモートに（そして便利に）システムにアクセス
- 使いやすいタッチスクリーンインターフェースで機器を数秒でプログラム
- VeriFlex ブロックが正確な PCR 最適化を実現または最大 6 つの個別アッセイを実行
- 使いやすいグラフィカルインターフェース（6.5 インチの VGA タッチスクリーン）
- 高速ランプ速度を使用すると PCR サイクリング時間が減少
スループットのスケールに合わせた定量オプション
qPCR ベースの Collibri ライブラリ定量キットは、より大きなサンプルバッチで良好な測定を可能にするため、貴重サンプルや臨床検体にとって理想的な方法です。定量精度は KAPA ライブラリ定量キットと同等で、さらに、定量中に試薬の色の変化を確認できる利点があります。
Qubit dsDNA HS アッセイは、dsDNA 結合色素を使用することにより、NGS ライブラリ濃度を正確に測定する蛍光定量アッセイで、サンプルあたりわずか数分のシンプルなワークフローにベネフィットがあります。
選択するアッセイにかかわらず、良好な実験技術を用いて、ライブラリ濃度の正確な測定と高品質の Illumina シーケンシングデータを確保する必要があります。
推奨付属製品
Applied Biosystems QuantStudio リアルタイム PCR システムは、卓越した性能、信頼性、および世界トップクラスのサポートにより、お客様に真の価値を提供いたします。当社の装置は、お客様が必要とする結果を提供し、研究者同士の連携を可能にすることで、お客様の研究目標の達成を可能とします。
ゲノム DNA 抽出
当社では、プロセス効率およびダウンストリーム性能を最大限に高めるために、幅広い種類の出発材料からの高感度かつ拡張可能な精製に向けて、さまざまなゲノム DNA 抽出キットを提供しています。組織、細胞、血液、血清、植物、法医学サンプルなど、さまざまなサンプルからゲノム DNA を精製するための幅広い種類のキットが含まれます。
磁気ビーズをベースとする技術と KingFisher 装置を使用した自動 DNA 抽出により DNA を結合、洗浄および溶出させ、高収量かつ優れた再現性を維持しながら操作時間を短縮させることができます。
感度および特異性の高い核酸定量
Qubit dsDNA 高感度（HS）および広範囲（BR）アッセイは、RNA および一本鎖 DNA（ssDNA）よりも二本鎖 DNA（dsDNA）に高い選択性を示します。この高感度アッセイは、dsDNA を低濃度で含むサンプルに推奨され、貴重なサンプルへの使用に理想的です。
推奨付属製品
- スループットニーズが変わる場合は、96 ウェル 0.2 mL ブロックを別のブロックタイプと交換
- モバイルアプリでリモートに（そして便利に）システムにアクセス
- 使いやすいタッチスクリーンインターフェースで機器を数秒でプログラム
- VeriFlex ブロックが正確な PCR 最適化を実現または最大 6 つの個別アッセイを実行
- 使いやすいグラフィカルインターフェース（6.5 インチの VGA タッチスクリーン）
- 高速ランプ速度を使用すると PCR サイクリング時間が減少
スループットのスケールに合わせた定量オプション
qPCR ベースの Collibri ライブラリ定量キットは、より大きなサンプルバッチで良好な測定を可能にするため、貴重サンプルや臨床検体にとって理想的な方法です。定量精度は KAPA ライブラリ定量キットと同等で、さらに、定量中に試薬の色の変化を確認できる利点があります。
Qubit dsDNA HS アッセイは、dsDNA 結合色素を使用することにより、NGS ライブラリ濃度を正確に測定する蛍光定量アッセイで、サンプルあたりわずか数分のシンプルなワークフローにベネフィットがあります。
選択するアッセイにかかわらず、良好な実験技術を用いて、ライブラリ濃度の正確な測定と高品質の Illumina シーケンシングデータを確保する必要があります。
推奨付属製品
Applied Biosystems QuantStudio リアルタイム PCR システムは、卓越した性能、信頼性、および世界トップクラスのサポートにより、お客様に真の価値を提供いたします。当社の装置は、お客様が必要とする結果を提供し、研究者同士の連携を可能にすることで、お客様の研究目標の達成を可能とします。
ご注文情報
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.