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Collibri NGS Whole-Genomeライブラリ調製キット（酵素による断片化法）
Illumina システム用 Invitrogen Collibri PCR-Free 酵素による断片化（ES）DNA ライブラリ調製キットまたは Illumina システム用 Invitrogen Collibri ES DNA ライブラリー調製キットを使用すると、生物学的に重要な遺伝子に関して高い収量および強いカバレッジが得られ、ハイスループットシーケンシングのためのライブラリー作成が改善されます。
DNA断片化用酵素、インデックス付きアダプター、増幅用マスターミックス（必要に応じて）および精製ビーズなど、すべての試薬が含まれた、便利で高性能なキットです。24 反応または 96 反応に対応し、 Unique Dual Indexe（UDI）の使用により、パターン化フローセル上でインデックスホッピングされたリードを排除することができます。
PCR の選択肢
PCR-free Collibri ES DNA プロトコルは、Illumina™ NovaSeq™ システム上において、100 ng の DNA を定量および 2 回以上の実行に十分なライブラリに変換できるように最適化されています。得られたライブラリに含まれるキメラリード（chimeric reads）は、従来のライブラリ調製技術と比較して低減しています。
図 1.メーカーが推奨する PCR フリーのプロトコルを使用して Coriell NA12878 DNA でシーケンシングライブラリを調製し、Collibri Library Quantification キットを用いて濃度を測定しました。ライブラリのシーケンシングは、Illumina NovaSeq 6000 システム上で行いました。
生物学的に重要な遺伝子に関する高いカバレッジ
生物学的に重要な遺伝子に関する一貫性のあるカバレッジにより、シーケンス深度を増大させることなく検出力を向上させることができます。従来のライブラリ調製技術と比較して、少量のインプット DNA からの変異検出感度が改善されています。
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図 2.メーカーの推奨方法により、1 ng の Coriell NA12878 DNA をライブラリに変換し、Illumina NovaSeq 6000 上で各サンプルに関して 258 m リードで 2x150 bp のペア―ドエンドランでのシーケンシングを行いました。カバレッジは Picard Tools を使用して算出し、SNP は Freebayes v1.2.0 により検出しました。
全ゲノムライブラリ調製ワークフロー
ゲノム DNA 抽出
当社では、プロセス効率およびダウンストリーム性能を最大限に高めるために、幅広い種類の出発材料からの高感度かつ拡張可能な精製に向けて、さまざまなゲノム DNA 抽出キットをご提供しています。組織、細胞、血液、血清、植物、法医学サンプルなど、さまざまなサンプルからゲノム DNA を精製するための幅広い種類のキットが含まれます。
磁気ビーズをベースとする技術と KingFisher 装置を使用した自動 DNA 抽出により DNA を結合、洗浄および溶出させ、高収量かつ優れた再現性を維持しながら操作時間を短縮させることができます。
感度および特異性の高い核酸定量
Qubit dsDNA 高感度（HS）および広範囲（BR）アッセイは、RNA および一本鎖 DNA（ssDNA）よりも二本鎖 DNA（dsDNA）に高い選択性を示します。この高感度アッセイは、dsDNA を低濃度で含むサンプルに推奨され、貴重なサンプルへの使用に理想的です。
推奨付属製品
- スループットニーズが変わる場合は、96 ウェル 0.2 mL ブロックを別のブロックタイプと交換
- モバイルアプリでリモートに（そして便利に）システムにアクセス
- 使いやすいタッチスクリーンインターフェースで機器を数秒でプログラム
- VeriFlex ブロックが正確な PCR 最適化を実現または最大 6 つの個別アッセイを実行
- 使いやすいグラフィカルインターフェース（6.5 インチの VGA タッチスクリーン）
- 高速ランプ速度を使用すると PCR サイクリング時間が減少
スループットのスケールに合わせた定量オプション
qPCR ベースの Collibri ライブラリ定量キットは、より大きなサンプルバッチで良好な測定を可能にするため、貴重サンプルや臨床検体にとって理想的な方法です。定量精度は KAPA ライブラリ定量キットと同等で、さらに、定量中に試薬の色の変化を確認できる（つまり調整ミスがないか確認できる）という利点があります。
Qubit dsDNA HS アッセイは、dsDNA 結合色素を使用することにより、NGS ライブラリ濃度を正確に測定する蛍光定量アッセイで、サンプルあたりわずか数分のシンプルなワークフローにベネフィットがあります。
選択するアッセイにかかわらず、良好な実験技術を用いて、ライブラリ濃度の正確な測定と高品質の Illumina シーケンシングデータを確保する必要があります。
推奨付属製品
Applied Biosystems QuantStudio リアルタイム PCR システムは、卓越した性能、信頼性、および世界トップクラスのサポートにより、お客様に真の価値を提供いたします。当社の装置は、お客様が必要とする結果を提供し、研究者同士の連携を可能にすることで、お客様の研究目標の達成を可能とします。
ゲノム DNA 抽出
当社では、プロセス効率およびダウンストリーム性能を最大限に高めるために、幅広い種類の出発材料からの高感度かつ拡張可能な精製に向けて、さまざまなゲノム DNA 抽出キットをご提供しています。組織、細胞、血液、血清、植物、法医学サンプルなど、さまざまなサンプルからゲノム DNA を精製するための幅広い種類のキットが含まれます。
磁気ビーズをベースとする技術と KingFisher 装置を使用した自動 DNA 抽出により DNA を結合、洗浄および溶出させ、高収量かつ優れた再現性を維持しながら操作時間を短縮させることができます。
感度および特異性の高い核酸定量
Qubit dsDNA 高感度（HS）および広範囲（BR）アッセイは、RNA および一本鎖 DNA（ssDNA）よりも二本鎖 DNA（dsDNA）に高い選択性を示します。この高感度アッセイは、dsDNA を低濃度で含むサンプルに推奨され、貴重なサンプルへの使用に理想的です。
推奨付属製品
- スループットニーズが変わる場合は、96 ウェル 0.2 mL ブロックを別のブロックタイプと交換
- モバイルアプリでリモートに（そして便利に）システムにアクセス
- 使いやすいタッチスクリーンインターフェースで機器を数秒でプログラム
- VeriFlex ブロックが正確な PCR 最適化を実現または最大 6 つの個別アッセイを実行
- 使いやすいグラフィカルインターフェース（6.5 インチの VGA タッチスクリーン）
- 高速ランプ速度を使用すると PCR サイクリング時間が減少
スループットのスケールに合わせた定量オプション
qPCR ベースの Collibri ライブラリ定量キットは、より大きなサンプルバッチで良好な測定を可能にするため、貴重サンプルや臨床検体にとって理想的な方法です。定量精度は KAPA ライブラリ定量キットと同等で、さらに、定量中に試薬の色の変化を確認できる（つまり調整ミスがないか確認できる）という利点があります。
Qubit dsDNA HS アッセイは、dsDNA 結合色素を使用することにより、NGS ライブラリ濃度を正確に測定する蛍光定量アッセイで、サンプルあたりわずか数分のシンプルなワークフローにベネフィットがあります。
選択するアッセイにかかわらず、良好な実験技術を用いて、ライブラリ濃度の正確な測定と高品質の Illumina シーケンシングデータを確保する必要があります。
推奨付属製品
Applied Biosystems QuantStudio リアルタイム PCR システムは、卓越した性能、信頼性、および世界トップクラスのサポートにより、お客様に真の価値を提供いたします。当社の装置は、お客様が必要とする結果を提供し、研究者同士の連携を可能にすることで、お客様の研究目標の達成を可能とします。
ご注文情報
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.