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サンガーシーケンスワークフロー
実績のあるワークフローで高品質のサンガーシーケンスデータを提供する
私たちのシンプルで素早いサンガーシーケンスワークフローは、サンプルから結果取得まで、1 日未満で終えることができます。Thermo Fisher Scientific は、アプライドバイオシステムズブランドの製品を提供し、PCR 増幅からデータ解析まで、当社の推奨するワークフローの多くのステップをサポートします。下記の推奨サンガーシーケンスワークフローの各ステップの詳細をご覧ください。
Download BigDye Terminator v3.1 protocol
Download BigDye Direct Protocol
ビデオ: サンガーシーケンス実施方法
サンガーシーケンスワークフロー別 試薬のご紹介
タブをクリックしていただくと、各ワークフローごとの弊社製品試薬をご紹介しています。
PCR&サンガーシーケンスのためのプライマーデザイナーツール
オンライン Invitrogen™ Primer Designer™ ツールを使用して、ヒトエクソームおよびヒトミトコンドリアゲノムをリシーケンスするために 〜65 万個のあらかじめ設計されたプライマーペアのデータベースから、正しいPCR/サンガーシーケンスプライマーペアを検索します。さまざまなリサーチアプリケーションと生物学的サンプルタイプに対応するために、異なるアンプリコンの長さから選択してください。
- 当社のプライマーは、既知の SNP およびプライマーダイマーを含まず、標的特異性が高く、ユニバーサル PCR 条件下で使用されます。
- Ion Torrent™ AmpliSeq™ Exome パネルと Ion Torrent™AmpliSeq™Cancer Hotspot パネル v.2 サンガーコンファメーションワークフロー
- 研究のニーズを満たすための柔軟なプライマー設定: プライマーは未修飾、M13 テール、HPLC 精製または脱塩で注文できます
- 全てのプライマーは質量分析により検査され、厳しい測定基準を通過しています。検証テストで>95％の成功率を示しています。
AmpliTaq Gold 360 Master Mix
AmpliTaq Gold 360 Master Mix は PCR 増幅に必要なツールを1つの便利なパッケージにしています。すべてのコンポーネントはプレミックスされていて、事前に測定されます。AmpliTaq Gold 360 Master Mix は、全範囲のターゲットを 360° カバーするように設計されています。
- 高い GC 含量、高い AT 含量、ホモポリマーランなどを含む広範囲のターゲット（<3 kb）の増幅
- 優れた収率により、PCR アンプリコンでより多くのことを行うことができます
- 細菌のバックグラウンドを減らして偽陽性の結果を減少させるのに役立ちます
- 信頼できるソースからの再現可能な結果
ExoSAP-IT Express試薬: より速い PCR クリーンアップ法
The Applied Biosystems ExoSAP-IT Expressは、従来の ExoSAP-IT と同じ優れたクリーンアップを提供しながら、迅速な処理時間とリソース使用効率の向上をもたらします。斬新な ExoSAP-IT 技術により、より少ないステップでサンプルのクリーンアップ時間を大幅に短縮し、より簡単なワークフローを実現します。
- 5 分プロトコル
- ワンチューブ、ワンステップ PCR クリーンアップ
- 斬新な酵素技術
- PCR 産物を 100％ 回収
ビデオ: ExoSAP-It Express で PCR 反応をクリーンアップする方法
私たちは、お客様のすべてのアプリケーションとテンプレートのためにソリューション提供に役立つ優れたサンガーシーケンスキットの開発を続けています。
BigDye® Direct Cycle Sequencing Kit
pplied Biosystems BigDye Direct Cycle Sequencing Kit は、PCR 後のクリーンアップとサイクルシーケンシングを 1 つのステップに組み合わせることで、標準のサンガーシーケンシングワークフローを簡素化します。BigDye Direct Cycle Sequencing Kit には、Primer Designer Tool から入手できる M13 テイルの PCR プライマーが必要です。
ビデオ: BigDye Direct Cycle Sequencing Kit によるシーケンス
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
The Applied Biosystems BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit の強力で柔軟性の高い化学反応は、PCR 産物、プラスミド、フォスミッド、BACテンプレートを用いた de novo シーケンシング、リシークエンシング、フィニッシングに最適です。
BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit
Applied Biosystems BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit は、プライマーに隣接して、最適なベースコーリングが必要な特殊アプリケーション、および迅速な電気泳動操作モジュールによる短い PCR 産物テンプレートのシークエンシングを目的として設計されています。
BigDye XTerminator Purification Kit
Applied Biosystems BigDye XTerminator Purification Kit は、DNA シーケンシング反応のための迅速で簡単な精製法を提供し、取り込まれていない BigDye ターミネーターと塩を除去します。クリーンアップは 40 分程度で完了し、通常 10 分程度の作業が必要です。
ビデオ: BigDye XTerminator Kit でシーケンスクリーンアップする方法
3つの異なるポリマー試薬、それぞれ異なる必要性: 
POP-4 ポリマー
- 粘性が低く、速いラン
- 個人識別アプリケーションやその他のフラグメント解析アプリケーション、短い DNA 断片 (<500 bp) のシークエンシングに多く使用されています。
- Applied Biosystems 310, 3130/xl, 3500/xL で利用可能
POP-6 ポリマー
- 粘性高く、低速ラン
- シークエンシングプライマーに類似したヌクレオチドの優れた分解能。短い PCR 産物をシーケンスするために、BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit と組み合わせて使用されています。
- Applied Biosystems 310, 3130/xl, 3500/xL で利用可能
POP-7 ポリマー
- PDMA と LPA の混合物
- BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit と組み合わせて 〜1,000 bp までのリード長のシーケンスに主に使用されています。
- フラグメント解析アプリケーションにも使用
- Applied Biosystems 3130/xl, 3500/xL, 3730/xl で利用可能
Minor Variant Finder Software
Applied Biosystems Minor Variant Finder Softwareを使用して改善された感度は、関連するターゲットの数がしばしば制限されている低周波体細胞変異体（5％以下）を腫瘍医および/または病理学者に呼び出すためのサンガー配列決定を理想的なものにする。このソフトウェアは、現在のサンガーシーケンスワークフローの変更を必要としません。
メリット:
- 5％ 程度の低い検出レベルでマイナーな変異を解析
- 適度な数のターゲットを低コストでシーケンスする
- アライメント・ビューとベン・ダイアグラムで次世代シーケンシングの結果を確認する
ビデオ: サンガーシーケンスを使用したマイナーな変異を検出する方法
Sanger Analysis モジュール: クラウドベースのツール
Applied Biosystems Sanger Analysis モジュールは、革新的なクラウドベースの 2 次データ解析ツールで、1 つの場所に複数のデータセットをまとめています。このオンラインソリューションは、サンガーシーケンスデータの表示、保存、解析を容易にします。
主な特長:
- 次世代シークエンシング (NGS) コンファメーション - NGS バリアントを確認する 1 つの中心的な場所
- ゲノム座標で変異報告 - リファレンスから計算する必要を排除する
- 自動データベース検索 - SNP のゲノムアノテーションを自動的に報告
- ダウンストリーム分析のための .vcf 出力 - Ion Reporter アノテーションワークフローで複数のデータベースを検索
サンガーシーケンシングとフラグメント解析ソフトウェアの詳細 ›
PCR&サンガーシーケンスのためのプライマーデザイナーツール
オンライン Invitrogen™ Primer Designer™ ツールを使用して、ヒトエクソームおよびヒトミトコンドリアゲノムをリシーケンスするために 〜65 万個のあらかじめ設計されたプライマーペアのデータベースから、正しいPCR/サンガーシーケンスプライマーペアを検索します。さまざまなリサーチアプリケーションと生物学的サンプルタイプに対応するために、異なるアンプリコンの長さから選択してください。
- 当社のプライマーは、既知の SNP およびプライマーダイマーを含まず、標的特異性が高く、ユニバーサル PCR 条件下で使用されます。
- Ion Torrent™ AmpliSeq™ Exome パネルと Ion Torrent™AmpliSeq™Cancer Hotspot パネル v.2 サンガーコンファメーションワークフロー
- 研究のニーズを満たすための柔軟なプライマー設定: プライマーは未修飾、M13 テール、HPLC 精製または脱塩で注文できます
- 全てのプライマーは質量分析により検査され、厳しい測定基準を通過しています。検証テストで>95％の成功率を示しています。
AmpliTaq Gold 360 Master Mix
AmpliTaq Gold 360 Master Mix は PCR 増幅に必要なツールを1つの便利なパッケージにしています。すべてのコンポーネントはプレミックスされていて、事前に測定されます。AmpliTaq Gold 360 Master Mix は、全範囲のターゲットを 360° カバーするように設計されています。
- 高い GC 含量、高い AT 含量、ホモポリマーランなどを含む広範囲のターゲット（<3 kb）の増幅
- 優れた収率により、PCR アンプリコンでより多くのことを行うことができます
- 細菌のバックグラウンドを減らして偽陽性の結果を減少させるのに役立ちます
- 信頼できるソースからの再現可能な結果
ExoSAP-IT Express試薬: より速い PCR クリーンアップ法
The Applied Biosystems ExoSAP-IT Expressは、従来の ExoSAP-IT と同じ優れたクリーンアップを提供しながら、迅速な処理時間とリソース使用効率の向上をもたらします。斬新な ExoSAP-IT 技術により、より少ないステップでサンプルのクリーンアップ時間を大幅に短縮し、より簡単なワークフローを実現します。
- 5 分プロトコル
- ワンチューブ、ワンステップ PCR クリーンアップ
- 斬新な酵素技術
- PCR 産物を 100％ 回収
ビデオ: ExoSAP-It Express で PCR 反応をクリーンアップする方法
私たちは、お客様のすべてのアプリケーションとテンプレートのためにソリューション提供に役立つ優れたサンガーシーケンスキットの開発を続けています。
BigDye® Direct Cycle Sequencing Kit
pplied Biosystems BigDye Direct Cycle Sequencing Kit は、PCR 後のクリーンアップとサイクルシーケンシングを 1 つのステップに組み合わせることで、標準のサンガーシーケンシングワークフローを簡素化します。BigDye Direct Cycle Sequencing Kit には、Primer Designer Tool から入手できる M13 テイルの PCR プライマーが必要です。
ビデオ: BigDye Direct Cycle Sequencing Kit によるシーケンス
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
The Applied Biosystems BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit の強力で柔軟性の高い化学反応は、PCR 産物、プラスミド、フォスミッド、BACテンプレートを用いた de novo シーケンシング、リシークエンシング、フィニッシングに最適です。
BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit
Applied Biosystems BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit は、プライマーに隣接して、最適なベースコーリングが必要な特殊アプリケーション、および迅速な電気泳動操作モジュールによる短い PCR 産物テンプレートのシークエンシングを目的として設計されています。
BigDye XTerminator Purification Kit
Applied Biosystems BigDye XTerminator Purification Kit は、DNA シーケンシング反応のための迅速で簡単な精製法を提供し、取り込まれていない BigDye ターミネーターと塩を除去します。クリーンアップは 40 分程度で完了し、通常 10 分程度の作業が必要です。
ビデオ: BigDye XTerminator Kit でシーケンスクリーンアップする方法
3つの異なるポリマー試薬、それぞれ異なる必要性:
POP-4 ポリマー
- 粘性が低く、速いラン
- 個人識別アプリケーションやその他のフラグメント解析アプリケーション、短い DNA 断片 (<500 bp) のシークエンシングに多く使用されています。
- Applied Biosystems 310, 3130/xl, 3500/xL で利用可能
POP-6 ポリマー
- 粘性高く、低速ラン
- シークエンシングプライマーに類似したヌクレオチドの優れた分解能。短い PCR 産物をシーケンスするために、BigDye Terminator v1.1 Cycle Sequencing Kit と組み合わせて使用されています。
- Applied Biosystems 310, 3130/xl, 3500/xL で利用可能
POP-7 ポリマー
- PDMA と LPA の混合物
- BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit と組み合わせて 〜1,000 bp までのリード長のシーケンスに主に使用されています。
- フラグメント解析アプリケーションにも使用
- Applied Biosystems 3130/xl, 3500/xL, 3730/xl で利用可能
Minor Variant Finder Software
Applied Biosystems Minor Variant Finder Softwareを使用して改善された感度は、関連するターゲットの数がしばしば制限されている低周波体細胞変異体（5％以下）を腫瘍医および/または病理学者に呼び出すためのサンガー配列決定を理想的なものにする。このソフトウェアは、現在のサンガーシーケンスワークフローの変更を必要としません。
メリット:
- 5％ 程度の低い検出レベルでマイナーな変異を解析
- 適度な数のターゲットを低コストでシーケンスする
- アライメント・ビューとベン・ダイアグラムで次世代シーケンシングの結果を確認する
ビデオ: サンガーシーケンスを使用したマイナーな変異を検出する方法
Sanger Analysis モジュール: クラウドベースのツール
Applied Biosystems Sanger Analysis モジュールは、革新的なクラウドベースの 2 次データ解析ツールで、1 つの場所に複数のデータセットをまとめています。このオンラインソリューションは、サンガーシーケンスデータの表示、保存、解析を容易にします。
主な特長:
- 次世代シークエンシング (NGS) コンファメーション - NGS バリアントを確認する 1 つの中心的な場所
- ゲノム座標で変異報告 - リファレンスから計算する必要を排除する
- 自動データベース検索 - SNP のゲノムアノテーションを自動的に報告
- ダウンストリーム分析のための .vcf 出力 - Ion Reporter アノテーションワークフローで複数のデータベースを検索
サンガーシーケンシングとフラグメント解析ソフトウェアの詳細 ›
研究用途にのみご使用ください。体外診断用には対応していません。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.