개요

Applied Biosystems QuantStudio real-time PCR 시스템은 최소 1.5배의 변화를 감지할 수 있습니다. 대부분의 시스템은 10로그의 주입 템플릿에 대해 재현성 있는 분리도 가능합니다.

 

소프트웨어는 QuantStudio 시스템 데이터의 분석을 위한 온라인 툴킷을 제공합니다. 이 소프트웨어는 클라우드 기반 플랫폼인 Connect를 활용하여 유연하고 빠르며 사용이 간편하고 qPCR 및 관련 데이터의 기능적 이해를 용이하게 하는 매우 다양한 분석 도구를 제공합니다.

 

이 모듈을 통해 사용자는 100개가 넘는 유전형 분석, 유전자 발현 또는 기타 qPCR 실험을 프로젝트에 결합하고 몇 분 이내에 데이터를 분석할 수 있습니다. 주요 모듈에는 설계 및 분석, High Resolution Melt(HRM) 분석, 존재 여부(Presence/Absence) 분석, 표준 곡선, 유전형 분석, hPSC Scorecard 분석 및 상대 정량화가 포함됩니다. 아래 예를 참조하십시오.

감도

1.5배의 작은 변별 감지

기타 Applied Biosystem 플랫폼, QuantStudio 7 Flex 및 7900HT 기기와 동일한 99.9% 신뢰도로 QuantStudio 7 Pro 시스템에서 2배 및 1.5배 변별을 나타내는 뚜렷한 군집. 주입시 2배 및 1.5배 차이가 나는 총 간(liver) cDNA 샘플을 평가했습니다. 실행은 자동 임계값 및 베이스라인과 함께 각각의 플랫폼 소프트웨어를 사용하여 분석한 다음, SAS JMP v13 통계 소프트웨어를 사용하여 내보내고 분석하였습니다.

증폭 플롯은 QuantStudio 7 Pro 시스템을 사용하여 1.5배의 발현 변화 감지를 보여줍니다.  KAZ 플라스미드의 희석 시리즈는 증폭되었습니다. 수직축은 ROX 염료로 정규화된 형광의 변화입니다. 수평축은 사이클 수로 왼쪽에서 오른쪽으로 갈수록 증가합니다. 이는 표준 곡선으로 플로팅하여 검증되었습니다. 표준 곡선의 수직축은 사이클 임계값이며 수평축은 희석 시리즈로 왼쪽에서 오른쪽으로 갈수록 농도가 증가합니다.

10배 희석 KAZ 플라스미드 DNA의 증폭이 96-웰 블록을 사용하여 수행되었으며 10로그의 주입 템플릿 양에 대해 재현성 높은 분리가 나타났습니다. 수직축은 ROX 염료로 정규화된 백그라운드값 제거 후의 로그값입니다. 수평축은 사이클 수로 왼쪽에서 오른쪽으로 갈수록 증가합니다.

단일 복제 검출

KAZ 플라스미드(파란색)의 단일 복제와 NTC(보라색). QuantStudio 7 Pro 시스템은 NTC와 명확하게 구별되는 단일 복제를 일관성 있게 검출합니다(양성 웰 43/48). 

복합분석

복합분석 반응에서는 FAM 라벨링된 TaqMan 프로브 및 프라이머를 사용하여 VIC 염료로 라벨링된 18S rRNA 및 TGFb 유전자를 검출합니다. 반응에서는 고속 마스터 믹스를 사용했으며 96개 복제샘플에 대해 실행되었습니다. 수직축은 ROX 염료로 정규화된 형광의 변화를 반영하고, 수평축은 사이클을 반영하며 왼쪽에서 오른쪽으로 갈수록 증가합니다. CT 값은 복제샘플 간 표준편차가 낮은 산물의 명확하고 일관된 분리를 보여줍니다.

유전형 분석

이 플롯은 유전형 분석 앱의 개선된 비주얼 및 대립형질 변별 플롯이 실제 신호 대 배경 노이즈를 정확히 반영하는 방법을 보여줍니다.

HRM

High-Resolution Melt(HRM) 분석 앱은 post-PCR 분석을 통해 핵산 염기서열의 변형을 확인하도록 설계되었습니다. 이 방법은 QuantStudio 시스템과 함께 고휘도, dsDNA 결합 염료를 통해 PCR melting(융해) 곡선의 작은 차이를 감지합니다. 시스템의 정밀한 온도 선형 제어, 고급 데이터 캡처 기능 및 HRM 분석 소프트웨어는 HRM 분석에 적합합니다.

 

 

연구용으로만 사용 가능합니다. 진단용으로는 사용할 수 없습니다.