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利用两种靶向同一蛋白靶标的独立抗体,可作为检测抗体特异性的有用工具。理想情境下,所用的两种抗体靶向抗原的不重叠表位。通过获取识别同一靶标蛋白的独立区域的抗体结果,可提高抗体具有特异性、适于检测预定靶标结论的可信度。独立抗体检测是我们用来验证研究用 Invitrogen 抗体的一种方法。
独立抗体验证的常见应用会获得类似的检测模式,适于多裂解物免疫印迹、IHC 芯片、多细胞系免疫荧光、免疫沉淀、流式细胞术及其它抗体应用。
理论上说,采用独立抗体的方法较为直接,但实际上很难预测。根据样本制备、缓冲体系、多蛋白复合物内的方向及其他可能影响蛋白确认的参数,样本间结果可能不同。因此,同一种或两种待测抗体之间的表位易接触性差异可能很大。为考虑这些并发因素的影响,我们还针对靶向同一靶标的抗体采用了多克隆-单克隆方法,以确认抗体特异性。单克隆和多克隆库均有可能表现出相同的检测图案,尽管我们可以预测出二者的灵敏度存在差异。
以下实例展示了我们使用独立抗体验证靶向特异性的操作方法。
在第一个实例中,分别采用两种独立的 ER α 抗体(一种多克隆抗体,一种单克隆抗体)分析来自于 ER α-阳性的 MCF7、T47D、SK-BR-3 细胞, ER α-阴性的 Hs578T 细胞的全细胞裂解物和细胞核提取物。多克隆抗体的免疫原是来自于人 ER α蛋白 C 末端的短链合成肽段,而单克隆抗体的免疫原则是来自于大肠杆菌(E. coli)内表达的人 ER α 蛋白 C 末端区域的 35 kDa 部分蛋白。种属反应性以及质谱分析结果的差异,表明这些抗体具有明显差异的靶标结合曲线,适于进行特异性确认。正如我们预计的那样,大多数 ER 阳性细胞系细胞核提取物之中的 ER α均在主条带中检测出。此外,两种抗体在细胞核组分的 ER α 富集图案相同,进一步印证了抗体特异性。
雌激素受体 (ER) 免疫印迹分析。将 20 µg 来自于制定乳腺癌细胞系的全细胞裂解物 (WCL) 或细胞核提取物 (NE) 、10 µL PageRuler 预染蛋白分子量标准(货号 26616)后,进行电泳。将蛋白转印到 PVDF 膜(货号 88518)上,并采用含有 5% 牛奶的 TBST 在室温下至少封闭 1 小时。使用采用封闭缓冲液 1:500 稀释的 ER 多克隆抗体(货号 PA5-16440) 在 4°C 下振荡平台过夜孵育,然后采用 1:40,000 稀释的 HRP 偶联山羊抗兔 IgG 二抗(货号 31460)孵育后检测 ~43 kDa 处的 ER 。采用 SuperSignal West Dura 底物(货号 34075)进行化学发光检测。为检查各个泳道内上样的蛋白是否等量,采用 HDAC1 多克隆抗体(货号PA1-860,下图)孵育,印迹 检测到的内源性蛋白的分子量与 ER α或 ER β亚型一致。
在另一实例中,采用两种独立的单克隆抗体分析β连环蛋白:小鼠单克隆β连环蛋白抗体克隆15B8,以及小鼠单克隆β连环蛋白抗体克隆6F9。如下所示,两种抗体在检测人、小鼠和大鼠β连环蛋白时均表现出了良好的相关性。值得关注的是,克隆 15B8 还检测出了非人源原代 COS7 细胞中的 β连环蛋白,而克隆 6F9 则未检测出同一裂解物之中的β连环蛋白。两种抗体的免疫原均为重组人β连环蛋白。
通过独立抗体验证的 Invitrogen 抗体在搜索结果及相关产品页面上会显示“特异性通过验证”图标、在各个产品页面将会提供证明验证内容的数据。