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Ion AmpliSeq ターゲットシーケンステクノロジー
Ion AmpliSeq ターゲットシーケンステクノロジーは、わずか 1 ng の DNA または RNA から、マルチプレックスの PCR ベースワークローを、明確な特異性と均一性の利点とともに提供します。
Ion AmpliSeq パネルでは以下のことが可能です。
- わずか 1 ng の DNA または RNA の低品質サンプルのシーケンシング
- 一回のランで数百の遺伝子の解析
- デザイン済みパネルから選択、テスト済み遺伝子からパネルを構成、または Ion AmpliSeq Designer を使用して任意のゲノム用にカスタマイズ
- Ion Chef または Ion S5 システムを使用して、作業時間は 45 分で、わずか 24 時間以内にサンプルから結果まで完了
オンデマンド遺伝子パネルは、いつ、どのように必要となるのでしょうか
Ion AmpliSeq On-Demand パネルは、より小さなパックサイズとテスト済み遺伝子の最適化されたカタログを、カスタムの次世代シーケンシング（NGS）パネルに付与することで、ヒト疾患研究のためのパネルデザインを効率よく簡便に繰り返し適用できます。
Ion AmpliSeq Designer を使用したターゲットパネルで始めましょう
デザインツールやアクセスコンテンツをお試しください
Ion AmpliSeq Designer を使用して以下のことが可能です。
- カスタムパネルデザインの作成
- ご自身の、または当社のプレデザイン Ion AmpliSeq パネルの変更
- プレデザイン、またはカスタム可能なパネルコンテンツへのアクセス
- 遺伝子リストや関連のある論文などの詳細情報の閲覧
シーケンシングの成功
Ion AmpliSeq ターゲットシーケンステクノロジーは 2011 年に開始して以来、世界的に採用されており、幅広いアプリケーションで 700 を超える査読論文に引用されています。アプリケーション分野は、マウス表現型変異の研究1、遺伝子コピー数変化の評価2や肺がんに関連する遺伝子変化の特定3 などの研究におよびます。
Ion AmpliSeq テクノロジーは、例えば細胞培養や新鮮な凍結組織などの使用できるサンプル量やその品質が限定されている場合に使用されているだけではなく、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織や、微細針穿刺された保存サンプル、血液から抽出された循環無細胞 DNA（cfDNA）などの困難なサンプルタイプでも成功を収めています。
- Wang et al.Natl.Acad.Sci.112: E440-E449.
- Grasso et al.(2014) J. Mol.Diagn.17: 53-63.
- de Bruin et al.(2014) Science 346: 251-256.
- Christopher Corless, MD, PhD、「私たちは 4 つのカスタム Ion AmpliSeq パネルを作成し、そのすべてが FFPE 由来の DNA で非常にうまく機能しています。」
Knight Diagnostic Laboratories,
Knight Cancer Institute、米国オレゴン州
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍細胞サンプルは取り扱いが難しいサンプルです。Nicole Pfarr 博士が Ion PGM™ システムで Ion AmpliSeq パネルを使用した経験を述べています。
Ion AmpliSeq テクノロジーがどのように研究をサポートするかについての詳細をご覧ください
Ion Torrent 半導体シーケンシングは初めてですか？このテクノロジーの詳細はこちらご確認ください
- Dr. Ian Cree、「アイデアとしては、Ion AmpliSeq RNA パネルを使用して遺伝子融合などの RNA 環境の変化を検出したり、DNA パネルを使用してゲノム変異、 SNP、インデル、コピー数変異を検出することです。」
Professor of Pathology,
The University of Warwick,
Coventry, United Kingdom
目的の遺伝子が少数でも何百でも、Ion AmpliSeq テクノロジーにはお客様のニーズを満たすのに十分な柔軟性があります。遺伝性疾患や感染症、腫瘍学まで、多くの研究アプリケーションですべてのゲノムに使用できます。
「ヒトサンプルではないのだけれど…」問題ありません。 当社の Ion AmpliSeq Designer ツールでは、あらかじめ定義づけされた 12 種類のゲノムから、またはお客様のレファレンスファイルをアップロードすることによりお客様独自のレファレンスゲノムからもカスタムパネルを設計できます。
任せておける
多くの研究者は、次世代シーケンシングは複雑で、非常に膨大なデータを開発したり作成する際に、膨大のトレーニングを必要とする熟練した技能から恩恵を受けていると思い込んでいます。 Ion S5 システム、Ion Chef システム、そして Ion AmpliSeq テクノロジーでは、より簡便に柔軟に使用することが可能です。
また、「S」は simplified（簡素化した）機器のセットアップ、straight forward（容易で）自動化されたライブラリ構築、そして swift（迅速な）データ解析を意味します。
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Ion Torrent バイオインフォーマティクスソリューションの詳細はこちら
Ion AmpliSeq Designer の使用は無料です。Thermofisher.com へのログインに使用するのと同じユーザー名とパスワードを使用してサインインするか、新規のログインアカウントを作成するだけです。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.