Search Thermo Fisher Scientific
サンガーシーケンスおよびフラグメント解析ソフトウェア
サンガーシーケンスおよびフラグメント解析の結果を表示し解釈するための幅広いApplied Biosystemsソフトウェアソリューションポートフォリオを提供しています。無料ツールおよび購入可能な製品については、以下をご覧ください。
ソフトウェアに関するサポートをお求めの場合、
Capillary Electrophoresis Software Support Centerをご覧ください。
ソフトウェアプラットフォーム：
ソフトウエア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
| InnoviGene Suite | ブラウザーベースのオールインワンプラットフォームで、サンガーシーケンスアプリケーションソフトウェア一式を提供し、データ解析を自動化および最適化するための一連のツールを提供します。 | Windows™ 10 Windows™ 11 |
Data collection software
| ソフトウエア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
Data Collectionソフトウェア | Data Collectionソフトウェアは、機器コントロール、サンプルのデータ収集、品質管理、ベースコール、サイズコーリングのための総合ソフトウェアです。機器の操作は、このソフトウェアで行います | |
SeqStudioジェネティックアナライザ機器本体ソフトウェア 最新版のダウンロード | SeqStudioジェネティックアナライザソフトウェアは機器本体に搭載されているソフトウェアです。 | ― |
| サンガーシーケンスソリューション | サンプルの取得からシーケンスまで、系統、量、濃度を含むエンドツーエンドのサンプル管理をサポートします。管理者はサンプル処理の過程で発生する問題を発見することができ、研究者たちは各工程で処理可能なサンプルを特定することができます。 | ― |
サンガーシーケンスソフトウェア
閲覧ソフトウェア
| ソフトウエア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
| Sequence Scannerソフトウェアを使用すると、Applied Biosystemsジェネティックアナライザ機器を使用して得られたデータを、Sequencing Analysisソフトウェアで解析した後に、表示、編集、印刷、エクスポートができます。 | Windows™ 7 |
| Quality Check（QC）Moduleは、シーケンスデータのクオリティを評価します。みやすい解析サマリーにより、サンガーシーケンスデータのクオリティレポートが得られます。Trace Detailsページからは、必要に応じてシーケンス波長を評価、編集できます。Flag Settingsページでは、クオリティー評価の閾値の調整ができます。 | 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス |
Sequence Scannerソフトウェアv2.0
一次解析ツール
| ソフトウエア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
Sequencing Analysis Softwareは、ベースコーラー・アルゴリズムを用いて、単一および混合塩基のベースコーリングを行います。 このソフトウェアは、Applied Biosystems DNAアナライザおよびジェネティックアナライザから生成されたサンプルファイルを解析、表示、編集、保存、および印刷ができます。 | Windows™ 7 | |
Smart Deep Basecaller（SDB）は、革新的な新しいベースコールアルゴリズムで、手作業によるレビュー時間を短縮しながら、より優れたサンガーシーケンス結果を得ることができます。。Smart Deep Basecallerは、Sequencing Analysisソフトウェア8で使用できます。 | Windows™ 10 |
二次解析ツール
| ソフトウエア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
Minor Variant Finderソフトウエアは、サンガーシーケンスで5%の体細胞変異の検出を可能にします。向上した検出感度により、サンガーシーケンスで、比較的少ないサンプル数の低頻度変異を迅速、低コスト、正確に検出できるようになります。 | Windows™ 7 SP1、32ビット、64ビット、またはWindows™ 10 | |
| SeqScapeソフトウェアは、変異検出と解析、SNPの発見と検証、病原体のサブタイピング、アレル同定、およびシーケンス確認が可能なリシーケンス解析のためのソフトウェアです。既知グループのシーケンスと比較するためのライブラリ検索機能、また、臨床研究ラボで重要となり得る21 CFR Part 11コンプライアンス（セキュリティ、監査および電子署名機能）をサポートする機能を備えています。 | Windows™ 7 | |
| デモ版のダウンロード› | Variant Reporterソフトウェアは、変異の検出と解析、SNPの発見と検証、シーケンス確認などのリファレンスベースおよび非リファレンスベースの解析を行うソフトウェアです。この堅牢なアルゴリズムは、Applied Biosystemsジェネティックアナライザを使用して生成されたデータのSNP、変異、挿入、欠失、ヘテロ接合性の挿入／欠失をコールします。 | Windows™ 7 |
| Variant Analysis (VA) Moduleは、サンガーシーケンスデータの迅速な解析を行います。VA Module はゲノムデータベースからリファレンスシーケンスを自動でダウンロードし、ゲノム座標情報を元に変異の検出やSNPsのゲノムアノテーションのレポートを行うことができます。重複したフォワード／リバース鎖のシーケンスデータにより、VA ModuleはSNPコールを非常に高い感度で行います。また、VA Moduleは変異ファイルを標準的な.vcfフォーマットでレポートおよびエクスポートします。ユーザーがソフトウェアのメンテナンスを行う必要はありません。 | 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス | |
| Next-Generation Confirmation (NGC) Moduleによりユーザーは、Thermo Fisher Cloud上で、標準的なNGS変異ファイルの結果とサンガーシーケンスの結果を比較することができます。 結果を正確に解釈するには、NGSの結果を堅牢なサンガーシーケンスで検証する必要があります。NGC ModuleはAB1ファイルの迅速な解析を行い、ゲノム座標情報を元に変異をレポートします。結果は、自動でゲノムデータベースから既知SNPがアノテーションされます。 | 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス | |
| MicroSEQ ID Microbial Identification（微生物同定）ソフトウェアは、細菌や真菌を同定するためのツールです。このソフトウェアは、Applied Biosystems MicroSEQケミストリーキットおよびApplied Biosystemsジェネティックアナライザを使用して生成されたデータを解析します。 | Windows™ 7 | |
| MicrobeBridge Softwareは合理化されたデスクトップソフトウェアであり、Applied Biosystems ジェネティックアナライザで生成されたDNA配列をCenters for Disease Control and Prevention（CDC）のMicrobeNet™データベースと比較し、16S rRNA遺伝子配列解析で細菌の同定を行います。ローカルでのデータベースのセットアップが不要なため、コンピュータリソースの開発が容易です。 | ||
| Applied Biosystems SeqScreener Gene Edit Confirmation（遺伝子編集確認）App（SGC）は、CRISPR-Cas9の実験で生じた変異の範囲と頻度を特定するための無料で使いやすいソフトウエアです。 |
Minor Variant Finderソフトウェア 
Variant Reporterソフトウェア
Variant Analysis (VA) Module
Next Generation Confirmation (NGC) Module
MicroSEQ ID Microbial Identificationソフトウエア
MicrobeBridgeソフトウェア
SeqScreener Gene edit confirmationアプリ（SGC）
フラグメント解析ソフトウェア
サイジングソフトウェア
| ソフトウェア名 | 要塞 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
| Peak Scannerモジュールは、DNAフラグメント解析を行うソフトウェアで、DNAフラグメントの混合物をサイズに応じて分離し、分離のプロファイルを提供し、フラグメントのサイズを正確に計算するDNAフラグメントサイジングソフトウェアです。このソフトウェアを使用すると、Applied Biosystemsジェネティックアナライザを使用して作成したフラグメント解析データを表示、編集、解析、印刷、およびエクスポートができます。 | 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス |
| Microsatellite Analysisソフトウェア（MSA）は、メチレーションマッピング実験のためのハイクオリティなPCRプライマーを設計することができます。この解析は、分離プロファイルを提供し、フラグメントサイズを正確に計算し、サンプル中に存在するマイクロサテライトアレルを決定します。マイクロサテライト解析は、がんにおけるマイクロサテライトの不安定性、神経変性疾患におけるトリプレット反復増幅、種の同定＆特性評価、およびヒトサンプル認証に一般的に使用されています。 | 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス |
| Peak Scanner SoftwareはDNAサイジングソフトウェアで、無料でダウンロードできます。 | Windows™ 7 |
| GeneMapperソフトウェアは、フレキシブルなジェノタイピングソフトウェアパッケージで、全てのApplied Biosystemsジェネティックアナライザのデータに対し、DNAサイズおよびアレルコールのレポートを作成できます。このソフトウェアは、複数のアプリケーションの解析に対応しており、Amplified Fragment Length Polymorphism（AFLP）、ヘテロ接合性欠失（LOH）、マイクロサテライト、およびSNPジェノタイピング解析を含みます。。また、セキュリティと監査機能もあり、21 CFR 11の要件を満たせるようユーザーをサポートする機能を備えています。 |
Peak Scannerソフトウェア
GeneMapperソフトウェア
プライマーデザインツール
| オフトウェア名 | 詳細 | 対応オペレーティングシステム |
|---|---|---|
無料のオンラインPrimer Designer Toolを使用すると、ヒトのエキソームおよびヒトのミトコンドリアゲノムのシーケンス用にプレデザインされた最大65万対のプライマーペアのデータベースから、ニーズに合ったPCRおよびサンガーシーケンシング用のプライマーペアを検索することができます。 | ウェブツール | |
| Methyl Primer Expressソフトウェアv1.0を使用すると、メチレーションマッピング実験のためのハイクオリティなPCRプライマーを設計することができます。目的の領域をカットしてペーストするだけです。このツールはCpGアイランドを探して、in silicoでDNAのバイサルファイト変換をシミュレートします。 |
Primer Designer Tool
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.