リキッドバイオプシー解析 | Thermo Fisher Scientific

デジタルPCRと次世代シーケンシングによりリキッドバイオプシー研究を加速します

腫瘍学におけるリキッドバイオプシーという用語は、血液や他の液性サンプルに含まれる無細胞DNA（cfDNA）、循環腫瘍DNA（ctDNA）、循環腫瘍細胞（CTC）、またはエキソソームの検出を通じて、腫瘍の動的変化をリアルタイムで監視することを指します。

パンフレットのダウンロード

従来の生検を補完する非侵襲的なオプションとして、リキッドバイオプシーは非常に特異的で感度の高いバイオマーカーの発見を可能にし、腫瘍の進行を動的かつタイムリーに監視するために使用できます。サーモフィッシャーサイエンティフィックでは、堅牢なcfDNA用のサンプル調製ソリューションと、がんドライバーの検出、モニタリング、および再発の検出を可能にするデジタルPCR（dPCR）とターゲット次世代シーケンシング（NGS）の両方を利用した高感度リキッドバイオプシーアッセイの開発に取り組んでいます。Ion GeneStudio S5で使用するカスタマイズ可能な、または事前に設計されたターゲットNGSパネルやGenexus Integratedシーケンサで使用するOncomine Precision Assay の強力な組み合わせにより、がん関連遺伝子変異の包括的な検出を提供し、dPCRアッセイは、標的となる一連の遺伝子変異の迅速なモニタリングを提供します。リキッドバイオプシーは、がん研究における将来の標準的なサンプルになる可能性があります。

発見、監視、および再発検出のためのリキッドバイオプシーソリューションの探索

がんドライバー遺伝子変異の発見

cfDNAおよびcfRNAを含むcfNAを解析し、事前に設計されたOncomine nucleic acid assaysや、Genexus Integratedシーケンサで使用される事前に設計された Oncomine Precision Assay 、カスタマイズ可能なIon AmpliSeq HDパネルを使用して、原発性がんドライバーおよび耐性変異を特定します。

応答と抵抗の監視

TaqMan Liquid Biopsy dPCRアッセイを使用して、NGSの結果の検証や、がんドライバーおよび治療抵抗性の変異を監視します。

再発時に新しいドライバーの遺伝子変異を発見

Oncomine cell-free nucleic acid assays、またはGenexus Integratedシーケンサで使用する事前に設計された Oncomine Precision Assayを使用して、再発に関連する新しいがんドライバーおよび耐性変異を特定します。

リキッドバイオプシーソリューションとワークフロー

サンプル調製からデータ解析、および解釈まで、総合的なリキッドバイオプシーソリューションを提供します。サンプル調製キットとNGS、dPCR、およびリアルタイムPCRベースのリキッドバイオプシーソリューションの詳細については、以下をご覧ください。

サンプル調製	cfNA抽出 MagMAX Cell-Free Total Nucleic Acid Isolation Kit —磁気ビーズベースのテクノロジーを使用して、血漿、血清、または尿サンプルからcfDNAおよびcfRNAを分離および精製します。 MagMAX cfDNA Isolation Kit—磁気ビーズベースのテクノロジーを使用して、血漿、血清、尿からcfDNAを分離および精製します。 Genexus Cell-Free Total Nucleic Acid Purification Kit—Genexus Purificationシステムを使用すると、全血から分離された無細胞血漿からの全核酸の自動抽出と定量が可能になります。 Genexus Purification システム —血漿、全血、末梢血白血球（PBL）、ホルマリン固定、パラフィン包埋（FFPE）ライセート、新鮮または凍結組織、培養細胞、および骨髄穿刺液エキソソーム単離 Dynabeads製品—さまざまなサンプルからのインタクトなエクソソームを濃縮するか、柔軟でスケーラブルな試薬を使用してエクソソームを特定のサブポピュレーションにさらに精製します dPCRマスターミックス Absolute Q DNA Digital PCR Master Mix (5X)高感度かつ正確なdPCRデータを可能にする—QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRシステムによるApplied Biosystems dPCRアッセイは、専用のマスターミックスにより、より多くのサンプル量の分析を可能にし、検量線を使用せずにDNAターゲットの正確な定量を実現します。
変異検出	NGSアッセイと機器ターゲットNGS用のIon AmpliSeq HDパネル—独自のパネルを設計し、検出限界が低い（cfDNAの場合は0.1％まで検出できます）。この革新的な技術により、研究者は、ctDNAの低頻度対立遺伝子を検出する場合など、超高感度が必要な場合に日常的に回答を得ることができます。リキッドバイオプシー臨床研究のためのOncomine Cell-Free Assay—乳がん、大腸がん、肺がん用のアッセイに加えて、複数のがんタイプをカバーするPan-Cancerアッセイは、既知の体細胞変異、CNV、融合遺伝子を検出できるターゲットNGSアッセイです。 Oncomine Precision Assay —リキッドバイオプシーサンプルおよび固形腫瘍組織サンプルから、50遺伝子にわたるバイオマーカーの迅速な同時検出を可能にします Ion GeneStudio S5次世代シーケンスシステム—もっとも単純なサンプルからデータへのNGSワークフローにより、複数の研究アプリケーションにわたって大小のプロジェクトを迅速かつ効率的に実行します。 Ion Torrent Genexus システム—サンプルとライブラリ調製、シーケンス、データ解析、およびレポート作成を自動化します。このシステムは、Genexusソフトウエアとともにシームレスに動作し、サンプル情報と結果を自動的に追跡します。 dPCRアッセイおよび機器 Absolute QリキッドバイオプシーdPCRアッセイ—がん研究に関連する遺伝子のバリアント対立遺伝子頻度を0.1％まで検出できる、ウェットラボで検証されたアッセイを使用して、既知の体細胞変異の再現性のある特異的な検出を可能にします QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRシステム —QuantStudio Absolute QデジタルPCRシステムのシンプルなワンステップワークフローで、正確で高感度かつ正確なデジタルPCRデータをわずか90分で収集できます。 castPCRアッセイおよび機器 TaqMan Mutation Detection assay —TaqMan PCR（castPCR Technology）を使用して、大量の正常DNAを含むサンプル中の希少な変異DNAを検出および測定します。 QuantStudioリアルタイムPCRシステム—QuantStudioリアルタイムPCRシステムファミリーからあなたにぴったりのリアルタイムPCR装置を見つけてください
データ解析とレポート作成	NGS解析およびレポート作成ソフトウェア Torrent Suiteソフトウェア—下流のデータプロセッシングのためのIon Reporterソフトウェアとのシームレスな統合を含む、カスタマイズ可能なシーケンス解析データを自動で取得します Ion Reporterソフトウエア—高速でシンプルな変異コールとSNP、indels、CNV、および融合遺伝子のアノテーションの結果を取得します Oncomine Reporter—サンプル固有の遺伝子変異をラベル、ガイドライン、および現在の世界で実施されている臨床試験にリンクする簡単なレポートに、関連するがんドライバー遺伝子変異情報を要約して、レポート出力します dPCR解析ソフトウェア QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRソフトウェア—ユーザーは、dPCRのランを設定し、サーマルサイクリングプロセスを制御し、希少なターゲットの絶対定量やコピー数多型の測定などの実験データを解析できます castPCR解析ソフトウェア変異検出ソフトウェア—自動変異検出データ解析ソフトウエアを使用してサンプルの変異状態を判断します

サンプル調製

cfNA抽出

MagMAX Cell-Free Total Nucleic Acid Isolation Kit —磁気ビーズベースのテクノロジーを使用して、血漿、血清、または尿サンプルからcfDNAおよびcfRNAを分離および精製します。
MagMAX cfDNA Isolation Kit—磁気ビーズベースのテクノロジーを使用して、血漿、血清、尿からcfDNAを分離および精製します。
Genexus Cell-Free Total Nucleic Acid Purification Kit—Genexus Purificationシステムを使用すると、全血から分離された無細胞血漿からの全核酸の自動抽出と定量が可能になります。
Genexus Purification システム —血漿、全血、末梢血白血球（PBL）、ホルマリン固定、パラフィン包埋（FFPE）ライセート、新鮮または凍結組織、培養細胞、および骨髄穿刺液

エキソソーム単離

Dynabeads製品—さまざまなサンプルからのインタクトなエクソソームを濃縮するか、柔軟でスケーラブルな試薬を使用してエクソソームを特定のサブポピュレーションにさらに精製します

dPCRマスターミックス

Absolute Q DNA Digital PCR Master Mix (5X)高感度かつ正確なdPCRデータを可能にする—QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRシステムによるApplied Biosystems dPCRアッセイは、専用のマスターミックスにより、より多くのサンプル量の分析を可能にし、検量線を使用せずにDNAターゲットの正確な定量を実現します。

変異検出

NGSアッセイと機器

ターゲットNGS用のIon AmpliSeq HDパネル—独自のパネルを設計し、検出限界が低い（cfDNAの場合は0.1％まで検出できます）。この革新的な技術により、研究者は、ctDNAの低頻度対立遺伝子を検出する場合など、超高感度が必要な場合に日常的に回答を得ることができます。
リキッドバイオプシー臨床研究のためのOncomine Cell-Free Assay—乳がん、大腸がん、肺がん用のアッセイに加えて、複数のがんタイプをカバーするPan-Cancerアッセイは、既知の体細胞変異、CNV、融合遺伝子を検出できるターゲットNGSアッセイです。
Oncomine Precision Assay —リキッドバイオプシーサンプルおよび固形腫瘍組織サンプルから、50遺伝子にわたるバイオマーカーの迅速な同時検出を可能にします
Ion GeneStudio S5次世代シーケンスシステム—もっとも単純なサンプルからデータへのNGSワークフローにより、複数の研究アプリケーションにわたって大小のプロジェクトを迅速かつ効率的に実行します。
Ion Torrent Genexus システム—サンプルとライブラリ調製、シーケンス、データ解析、およびレポート作成を自動化します。このシステムは、Genexusソフトウエアとともにシームレスに動作し、サンプル情報と結果を自動的に追跡します。

dPCRアッセイおよび機器

Absolute QリキッドバイオプシーdPCRアッセイ—がん研究に関連する遺伝子のバリアント対立遺伝子頻度を0.1％まで検出できる、ウェットラボで検証されたアッセイを使用して、既知の体細胞変異の再現性のある特異的な検出を可能にします
QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRシステム —QuantStudio Absolute QデジタルPCRシステムのシンプルなワンステップワークフローで、正確で高感度かつ正確なデジタルPCRデータをわずか90分で収集できます。

castPCRアッセイおよび機器

TaqMan Mutation Detection assay —TaqMan PCR（castPCR Technology）を使用して、大量の正常DNAを含むサンプル中の希少な変異DNAを検出および測定します。
QuantStudioリアルタイムPCRシステム—QuantStudioリアルタイムPCRシステムファミリーからあなたにぴったりのリアルタイムPCR装置を見つけてください

データ解析とレポート作成

NGS解析およびレポート作成ソフトウェア

Torrent Suiteソフトウェア—下流のデータプロセッシングのためのIon Reporterソフトウェアとのシームレスな統合を含む、カスタマイズ可能なシーケンス解析データを自動で取得します
Ion Reporterソフトウエア—高速でシンプルな変異コールとSNP、indels、CNV、および融合遺伝子のアノテーションの結果を取得します
Oncomine Reporter—サンプル固有の遺伝子変異をラベル、ガイドライン、および現在の世界で実施されている臨床試験にリンクする簡単なレポートに、関連するがんドライバー遺伝子変異情報を要約して、レポート出力します

dPCR解析ソフトウェア

QuantStudio AbsoluteQデジタルPCRソフトウェア—ユーザーは、dPCRのランを設定し、サーマルサイクリングプロセスを制御し、希少なターゲットの絶対定量やコピー数多型の測定などの実験データを解析できます

castPCR解析ソフトウェア

変異検出ソフトウェア—自動変異検出データ解析ソフトウエアを使用してサンプルの変異状態を判断します

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.