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膜に転写されたタンパク質の検出用に抗体を使用する前、抗体の非特異結合を防止するために、未結合表面をブロックする必要があります。ブロックを行わないと、目的タンパク質の固定化を最初に果たした未結合部位へ、抗体や検出試薬類が結合してしまいます。原則的に、アッセイの標的またはプローブの成分に対して結合親和性を持たないタンパク質であれば、ブロッキングに使用することができます。
しかし実際、膜結合の一貫性の優れたタンパク質や、他システムの成分の機能を何らかの方法で安定させるタンパク質が存在することから、ブロッキング能力の優劣はタンパク質によって異なります。つまり、全てのウェスタンブロッティング実験に最適に作用するタンパク質やタンパク質混合物は存在しません。また、特異的抗体、膜型および基質系の所定の組み合わせで最良の結果を得るには、実証試験を行う必要があります。
膜上の遊離部位をブロックするには、ミルクや正常血清から高精製タンパク質まで、様々なブロッキングバッファーが利用されてきました。ブロッキングバッファーは、 バックグラウンド干渉を低減させ、シグナル対ノイズ比を改善することで、アッセイ感度を向上させる役割を果たします。ブロッキングバッファーは、非特異的相互作用のあらゆる潜在的部位へ結合し、エピトープの抗体結合を変更または損傷することなく、バックグラウンドを完全に排除するタイプが理想的と言えます。
抗原自体や抗原に用いる検出標識のタイプに応じて、所定ブロット用の適切なブロッカーを選択します。例えば、アルカリホスファターゼ複合体が用いられる用途では、PBSがアルカリホスファターゼへ干渉するため、TBS中にブロッキングバッファーを使用することが推奨されます。標的分析物非含有サンプルから得られるシグナルに対する、標的分析物含有サンプルからのシグナルとして測定される、シグナル対ノイズ比は、ブロッカーを選択する際の最も重要な要素となります。
添付図は、ウェスタンブロット法の最適化実験の一環として、各種ブロッキングバッファーのテスト数値を示しています。この実験例では、バッファー以外の全条件は同等とし、個々のタンパク質に対するウェスタンブロッティングの感度および特異性は、各ブロッキングバッファーによって、抑制あるいは強化が見られました。他の事例では、バッファーのタイプによって、斑点や高バックグラウンドが発生する可能性があります。
図1:ブロッキングバッファー最適化の重要性 化学発光ウェスタンブロッティングでは、ブロッキング工程を除く同一条件で処理された3種類のタンパク質が生じます。 各ブロットには、同系列の5倍希釈(1:50、1:10、1:2)に対応する3レーンのタンパク質が含まれています。 上図の2つのフィルム露光は、Fos実験から得られた結果を示しています。 カゼインベースのブロッキングバッファーはサイクリンB1タンパク質に対して最も高感度な結果が得られた一方、SuperBlock™ Blocking Bufferはp53およびFOSに対して最も高感度の結果が得られました。 ニトロセルロース膜を含むこれらの試験において、全4種類のブロッカーで低量のバックグラウンドが発生しました。条件に一致した記録は見つかりません
カタログ番号 | ブロッキングバッファー | ELISA | ウェスタンブロッティング | ドットブロッティング | 免疫組織化学 | NA / RNAハイブリダイゼーション |
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37538 | StartingBlock™ (PBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37542 | StartingBlock™ (TBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37539 | StartingBlock™ T20 (PBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37543 | StartingBlock™ T20 (TBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37515 | SuperBlock™ Blocking Buffer (PBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37535 | SuperBlock™ Blocking Buffer (TBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37517 | SuperBlock™ Blocking Buffer – Blotting in PBS | ✓ | ✓ | ✓ | ||
37537 | SuperBlock™ Blocking Buffer – Blotting in TBS | ✓ | ✓ | ✓ | ||
37516 | SuperBlock™ T20 PBS Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37536 | SuperBlock™ T20 TBS Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37527 | SEA BLOCK Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ||
37520 | Blocker BSA (TBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37525 | Blocker BSA (PBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37532 | Blocker Caesin (TBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37528 | Blocker Caesin (PBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37530 | Blocker BLOTTO (TBS) | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
37570 | Protein-Free (TBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37571 | Protein-Free T20 (TBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37572 | Protein-Free (PBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37573 | Protein-Free T20 (PBS) Blocking Buffer | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
37576 | Pierce™ Fast Blocking Buffer | ✓ | ||||
37587 | Pierce™ Clear Milk Blocking Buffer | ✓ | ||||
T2015 | I-Block™ Protein-Based Blocking Reagent | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
00-0105 | Membrane Blocking Solution | ✓ | ✓ |
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.