感染症研究における免疫応答、メカニズム、症状の進行の研究のためのターゲットNGS

Ion Torrent NGSテクノロジーは、免疫レパートリーへのより深い洞察のための正確で包括的で合理化された研究ワークフローを可能にします。各アッセイは、最先端のIon AmpliSeqテクノロジーを利用しており、データの生物学的な意義に集中できる、最適化された統合解析ソリューションを備えたエンドツーエンドのワークフローの一部です。

免疫応答を研究するためにIonTorrentターゲットNGSを使用する利点：

• 自動化されたワークフロー—自動化された核酸から解析までのワークフローは、使用者の作業を減らしてエラーを最小限に抑えます。
• バリアントの精度—塩基多型（SNV）の置換エラーが少ないため、サンプルの層化、免疫レパートリー、体細胞高頻度突然変異（SHM）の定量化が可能になります。
• 強力でユーザーフレンドリーな解析ツール—統合された使いやすい解析ツールにより、免疫レパートリーの多次元プロファイリングが可能になり、バイオインフォマティクスの経験レベルに関係なく、NGSの利用をより簡単にして、ラボの効率を改善します。

Ion Torrent TCRおよびBCRアッセイは、一般的な宿主応答の研究、疾患重症度バイオマーカーの特定、ターゲットした免疫プロファイリングの実行、およびT細胞とB細胞の特性評価に使用できます。

加えて、遺伝子発現やマイクロバイオータなどの要因がワクチンに対する免疫反応に影響を与えます。トランスクリプトーム解析とヒトマイクロバイオーム解析も、Ion TorrentのNGSで解析可能です。

Ion AmpliSeq Microbiome Health Research Kitを使用することで、サンプルから結果に至る簡便なワークフローにより種レベルでの感度と特異度が得られます。このアッセイは、コスト効率が高く、かつ包括的なヒト腸内微生物叢のプロファイリングが可能となります。また、信頼性の高い解析を実現する、完全に統合されたデータ解析ツールが含まれているため、糞便サンプルからの腸内細菌叢のバイオマーカー研究を実現できます。

ヒト細菌叢研究ににIon Torrent NGSを使用する利点：

• ターゲットパネルによる高感度と特異性—免疫腫瘍学、免疫学研究および消化器疾患研究に関連する70を超える主要な細菌種、および免疫調節または抗ウイルス特性を示す常在細菌叢を含む16S遺伝子パネルともう1つのパネルによる種レベルの解析能力
• シンプルなエンドツーエンドソリューション—最小限のハンズオン時間と標準化されたプロセスでサンプルからレポートを作成。ユーザー間のばらつきを軽減しコンタミのリスクを低減
• 高い解析能力—複数の品質チェック済みの、精選されたデータベースとQIIME 2プラグインのような一般的なツールを含む、細菌叢研究のために最適化された解析ソリューション

Ion AmpliSeq Microbiome Health Researchキットの詳細›

Ion Torrentインフォマティクスソリューションは、効率性とカスタマイズ性を兼ね備えることにより、最適化されたIon TorrentターゲットNGSワークフローを構築します。そのため、ユーザーがデータの生物学的な意義に集中できる一助となります。ワークフローの各ステップで、ラン計画、品質データ管理、バリアントコール、およびアノテーションのソリューションを作成できます。

免疫学研究のために特別に構築された一連の視覚化されたツールは、研究を迅速に進めるのに役立つ包括的なNGSソリューションの一部です。シーケンシングデータ解析は自動で行われ、グラフで表され、サンプル全体の免疫レパートリー機能を、簡単に検討することができる形式で、要約された結果が作成されます。

インタラクティブなスペクトルタイピングプロットを使用すると、レパートリー全体を表示してクローンの多様性と分布を確認したり、シングルクリックでアイソタイプにフォーカスすることができます。個々のクローンの詳細は、プロットにカーソルを合わせるだけで表示されます。

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免疫応答、メカニズム、症状の進行を研究するためのアッセイ

• BCR IGH
  • ロングリードアッセイ
  • ショートリードアッセイ（DNA）
  • ショートリードアッセイ（RNA）
• TCR beta
  • ロングリードアッセイ
  • ショートリードアッセイ（DNA）
  • ショートリードアッセイ（RNA）
• 細菌叢（マイクロバイオーム）解析
  • Microbiome health researchキット
• 遺伝子発現とトランスクリプトーム解析
  • ターゲットトランスクリプトームシーケンシングアッセイ
  • ターゲットRNAシーケンシングアッセイ
• 免疫パスウェイ研究
  • 免疫応答研究アッセイ

マウスモデルのアッセイ

• BCR IGH
  • ショートリードアッセイ（DNA）
  • ショートリードアッセイ（RNA）
• TCR beta
  • ショートリードアッセイ（DNA）
  • ショートリードアッセイ（RNA）

カスタムパネルのデザインおよび注文については、AmpliSeq.com Ion AmpliSeqDesignerにアクセスしてください。