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NGSを用いたワクチン・治療法開発研究
ワクチンと治療法の研究のためのスケーラブルで高速な自動NGSソリューション
ワクチンは、感染症から私たちを守り、癌などの病気を認識して闘うために免疫システムを訓練するのに役立ちます。研究者は新しいワクチンを開発し、ワクチンの有効性を改善し、有害事象を軽減するための努力を続けているため、多くの質問に答える必要があります。ワクチンの適切な標的をどのように特定しますか？ワクチンの有効性を予測するために使用できるバイオマーカーはありますか？ワクチンの投与量や個人のマイクロバイオームなどの要因は、ワクチンに対する免疫反応にどのように影響しますか？
超並列次世代シーケンス（NGS）の出現と、DNAおよびRNAを迅速にシーケンスおよび分析する機能は、ワクチン応答の背後にある遺伝学の理解を深め、ワクチン開発研究を強化するのに役立ちます。
ワクチン開発研究ワークフローにおけるIon Torrentソリューション
他のNGSアプローチとは異なり、ワクチン開発研究用に焦点を当てたIon Torrent NGSソリューションは、ワクチンソリューションの開発により多くの時間を費やし、それらを探す時間を短縮するために必要な速度、拡張性、および精度を提供します。
病原体 | 宿主免疫反応 | ||
適応免疫と免疫レパートリー分析 | 自然免疫とシグナル伝達経路 | マイクロバイオーム解析 | |
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| SARS-CoV-2およびその他の病原体アッセイの詳細 › | 免疫レパートリー応答アッセイの詳細 › | ターゲットRNAおよびトランスクリプトームアッセイの詳細 › | Microbiome Health Research Kitの詳細 › |
*ヒト・マウスモデルで利用可能
Ion TorrentターゲットNGSは、探索からワクチンの有効性まで、開発ワークフロー全体にわたるワクチン研究のための迅速かつ多次元的な遺伝子解析を提供します。Ion Torrent NGSは、病原体の生物学や標的の探索の研究でも、宿主の免疫応答を包括的な解析でも、研究者がワクチン開発を迅速かつ費用効果の高い方法で研究および改善するのに役立つソリューションを提供します。
ワクチン開発研究にIonTorrentターゲットNGSを使用する利点
- 柔軟性—ワクチン研究パイプライン全体で標準化できる1つのテクノロジーであり、複数のアプリケーションと多次元解析を可能にします
- スピード—適切な候補を特徴づけるための迅速なターンアラウンドタイム
- 自動化—導入が容易で、ユーザーの作業が少なく、ラボの効率が向上します
- 精度—ワクチンの有効性を向上させる可能性のある予測バイオマーカーを同定し、より効率的な臨床研究のために免疫応答によりサンプルを層別化し、ワクチンの安全性への対処と有害事象を軽減するのに役立ちます
SARS-CoV-2スポットライト：ワクチンおよび治療法の研究におけるウイルス変異体の研究の重要性
SARS-CoV-2ウイルスゲノム全体をシーケンスすることで、SARS-CoV-2の生物学に関する新しい洞察とワクチンや治療法の研究に役立つ可能性のある新しい創薬ターゲットを生み出すことができます。ウイルスは進化し続けるため、ワクチンまたは治療法の開発では、候補の効果が低下する可能性があるため、すべてのウイルス変異を考慮に入れる必要があります。
Ion Torrent NGSは、SARS-CoV-2ゲノム全長のシーケンスを可能にし、ワクチン研究に影響を与える可能性のあるSARS-CoV-2の地域的な拡大と変異の遷移を調査するための重要な変異を特定します。Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Researchパネル は、1日でコロナウイルスのタイピングを可能にする、高速で自動化されたターゲットNGSワークフローの一部であり、すべての血清型を含むSARS-CoV-2ゲノムおよび変異体の>99%をカバーしています。このエンドツーエンドのソリューションには、ウイルスの拡散を遅らせるために研究者が開発したアッセイとプラグインも含まれています。
ワクチン開発研究ワークフローにおけるIon Torrentソリューション
目的
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NGSソリューション | ||
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病原体解析とターゲット探索
ターゲットNGSは、病原性、免疫応答を誘発する抗原および新抗原に関連する遺伝的パターン、ならびに免疫に寄与する可能性のある、または有害事象につながる可能性のある遺伝的要因を特定するのに役立ちます。遺伝情報はワクチン開発研究を前進させ、感染に対するより良い保護のためのより特異性の高い治療法につながる可能性があり、将来的にはがんなどの疾患の治療結果を改善する可能性があります。
適応免疫—免疫レパートリー分析
ワクチンは、適応免疫システムが感染症をすばやく認識して戦うことを可能にするだけでなく、がんなどの病気を攻撃するために免疫システムを強化します。これらの複雑な遺伝子再配列をシーケンスし、COVID-19のような疾患に対する免疫系が時間とともにどのように変化するかを理解したり、がんワクチン療法を改善するためのがん免疫サイクルを理解したりするには、正確でターゲットを絞ったNGSアプローチが必要です。免疫レパートリー解析は、臨床試験のためのサンプル層別化を可能にするとともに解釈を容易にし、ワクチン有効性を潜在的に改善することができます。
自然免疫とシグナル伝達経路
自然免疫応答には、インターフェロンやサイトカインなどの分子が関与しますが、反応や有害事象に関するそれらの相対的な寄与はよくわかっていません。ターゲット遺伝子発現解析は、抗原やワクチンに応答して遺伝子がどのように制御されているかを理解するために、規模が大きく、費用対効果の高いアプローチを提供します。自然免疫とさまざまな免疫シグナル伝達経路を特徴づけることは、ワクチンの有効性を改善し、有害事象のリスクを最小限に抑え、適切な選択肢に関する情報を提供するのに役立つ可能性があります。
ワクチン研究のためのマイクロバイオーム解析
腸内細菌叢は私たちの「第2のゲノム」と考えられており、ワクチンの反応やワクチンの有効性に影響を与える可能性のある微生物-微生物、および宿主-微生物の関係における複雑な相互作用など、ヒトの免疫に影響を与えると考えられています。ターゲットNGSは、培養できない可能性のある微生物など、免疫調節および抗ウイルス特性のために重要となる可能性のある菌種の情報を取得できます。
ワクチン開発研究のための相補的Ion Torrent NGSシステム
小規模プロジェクトも大規模プロジェクトもサポートできる拡張可能なターゲット NGS
Ion GeneStudio S5システムは、幅広いアプリケーションの幅とスループット能力を持つターゲットNGSの主力機器です。
検体からレポートまでのワークフローを自動化し、1 日で結果を提供*
検体からレポートまでのワークフローを自動化し、わずか 2 回のユーザー操作で結果を 1 日で得ることができる、初めての次世代シーケンシング（NGS）ソリューションです。*
リソース
Webセミナー
ブログ記事
- Repertoire Convergence in Vaccine Research
- B Cell Sequencing for Rapid Vaccine Research
- How Does the Gut Microbiome Impact Potential SARS-CoV-2 Vaccines?
- Sequencing dominant SARS-CoV-2 strain in suburban, southern U.S. region
- Targeted NGS Reveals Two Distinct Immune Responses to SARS-CoV-2 Infection from Postmortem Lung Tissue
- Cytokines May Be An Indication Of Susceptibility To SARS-CoV-2
- How The Gut Microbiome May Predict SARS-CoV-2 Virus Disease Severity In The Future
- Research In Variation Of The Gut Microbiome May Be Tied To Immune Response
ホワイトペーパー
Scientific posters
- Automated TRB locus haplotype analysis by long-amplicon TCRB chain sequencing for immune-related adverse events biomarker research
- Characterization of gut microbiota and identification of key bacterial species associated with immune response using a new Ion Torrent next-generation sequencing assay
- Peripheral Blood TCRB Chain Convergence Predicts Response to Dendritic Cell-Based Immunotherapy in Advanced-Stage Melanoma Patients
*Specimen-to-reportワークフローは2021年以降、Ion Torrent Genexus Purification Systemおよびレポート機能実装後に利用可能になります。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.