微生物のシーケンシング

微生物 ID、菌株サブタイピング、AMR 検出、およびターゲットシーケンシングのための感染症研究パネル

疾病研究ではより速い結果と優れた成果を必要とすることから、培養アッセイや迅速生化学的検査などの伝統的な病原体同定技術から次世代シーケンシング（NGS）のような分子生物学的方法に移行しつつあります。

微生物シーケンシングアプリケーションノート
感染症研究におけるターゲットシーケンシングのフライヤー

研究者は、Ion Torrent NGS の進化によって向上したスループットや正確性、ロングリードを測定可能な高性能を活用し、合理的なサンプル調製やシンプルで最適化されたデータ解析ワークフローにより、細菌のシーケンシングを迅速かつ正確に実施できるようになりました。Ion Torrent シーケンシングは、疾病のモニタリングや感染の調査、病因の特定などのために、保管されたサンプルから迅速な結果を得るために重要になっています。微生物全ゲノムシーケンシングのダウンストリームであるデータ解析メソッドには、de novo および参照配列を用いたアセンブル、抗生物質耐性検出、そして微生物株タイピングが含まれます。

Ion AmpliSeq 技術は、16S rRNA のような特定の遺伝子セットのターゲットシーケンシングにおいて、シンプルで高速なライブラリ作製を提供します。ウルトラハイマルチプレックス PCR に基づく Ion AmpliSeq 技術は、インプット DNAをわずか 1 ng しか必要としません。研究者は、ターゲットシーケンシングを行うことで、培養することなく、混合サンプルから微生物を効率よく同定でき、アウトブレイクサンプルのレトロスペクティブ研究の実施、そして抗生物質耐性に関連する変異の発見が可能です。

全ゲノムシーケンシング

深いカバレッジによる微生物全ゲノムシーケンシングは、SNPs、挿入、欠損、逆位、そして複雑な再編成を含む全種の遺伝的変異を見出すための究極のツールです。微生物の同定や新規発見、または特定の細菌やウイルスのタイピングに使用されます。

細菌やウイルスのタイピング

アウトブレイクの調査や病因解明のための保管サンプルを使用した、疾患研究における迅速で安価な細菌およびウイルスのタイピング。

ターゲットシーケンシング

Ion AmpliSeq 技術により、混合サンプル中の微生物の同定、毒性因子や伝染パターンの研究、そして抗生物質耐性に関連する変異の発見のための、特定遺伝子のターゲットシーケンシングを実施できます。

微生物解析ワークフロー

Step 1ターゲット選択
Step 2ライブラリ作製
Step 3テンプレート調製
Step 4シーケンスラン
Step 5データ解析

Ion AmpliSeq Pan-Bacterial Community Panel
Ion AmpliSeq Antimicrobial Resistance Community Panel
Ion 16S Metagenomics Kit
Ion AmpliSeq Ebola Research Panel
Ion AmpliSeq TB Research Panel
Ion AmpliSeq Targeted Custom Panels
PathAmp Flua 試薬

Ion GeneStudio S5、S5 Plus、または S5 Prime システム

Step 1 : ターゲット選択

Ion AmpliSeq Pan-Bacterial Community Panel
Ion AmpliSeq Antimicrobial Resistance Community Panel
Ion 16S Metagenomics Kit
Ion AmpliSeq Ebola Research Panel
Ion AmpliSeq TB Research Panel
Ion AmpliSeq Targeted Custom Panels
PathAmp Flua 試薬

Step 2 : ライブラリ作製

Step 3 : テンプレート調製

Step 4 : シーケンスラン

Ion GeneStudio S5、S5 Plus、または S5 Prime システム

Step 5 : データ解析

製品選択ガイドの詳細を見る：

Ion GeneStudio システム製品選択ガイド

微生物解析のための新しいソリューション

Ion GeneStudio S5 システムのための Ion AmpliSeq Community Panels

新しい Ion AmpliSeq Pan-Bacterial および Ion AmpliSeq Antimicrobial Resistance community panelは、混合サンプル中の迅速で簡単な微生物同定および AMR 解析を提供します。

Ion GeneStudio S5システム用の 600 bp シーケンシングケミストリ

Ion 520 & Ion 530 ExT Kit-Chef は、Ion Chef および Ion GeneStudio S5、S5 Plus、または S5 Prime システムを使用することで、2 日未満で完了するロングリードシーケンシングの自動ワークフローを可能にします。

Ion PGM システム用のシーケンシングケミストリ

Ion PGM Hi-Q View シーケンシングケミストリでシーケンスする場合、色のついた Ion Sphere Particles (ISPs) を使用したテンプレート調製が可能であり、これにより GC 領域におけるカバレッジが向上します。

等温増幅を使用する Ion PGM システム用の高速テンプレート調製

Ion PGM Template IA キットは数時間かかるテンプレート調製時間を半分にすることができ、他の Ion PGM システム用のテンプレート調製ワークフローと比較して、最も高速な微生物シーケンシングワークフローを提供します。

顧客体験のビデオ微生物多様性

臨床および環境研究アプリケーションのための Ion 16S シーケンシングの使用

数十年の解析といくつもの研究により、私たちは微生物が想像以上に多様であることを学びました。そして微生物種の多様性は、良好な生態系について、あるいは、それらの微生物の相互作用が、炎症性腸疾患、肥満、慢性創傷などの疾患においてどのように関わっているのかを教えてくれます。George Watts 博士と Charles Li 博士が、彼らの臨床および環境研究アプリケーションにおいて、どのように Ion 16S シーケンシングを使用しているのかを、お聞きください。