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AutoScript TEM Software scripting environment

Thermo Scientific AutoScript TEM Software is a scripting environment combining a TEM-specific Python API with the Python editor. Thermo Scientific software packages for electron/ion microscopy, such as Maps Software and Tomography Software for automation and for mapping, are great for making collection of standard information easy. However, industrial automation and fundamental research often require advanced techniques for imaging and analysis that cannot be covered in the scope of general purpose software. AutoScript TEM Software provides access to the microscope controls in a Python environment to define your application tailored to the question at hand.

Automated electron microscopy workflows

AutoScript TEM Software for TEM is the customization toolkit tor transmission electron microscopes. Built around Python, it provides you the power to automate workflows and associated processing pipelines built to solve specific research questions.

AutoScript TEM Software:

  • Provides a direct link between research needs and microscope automation
  • Enables improved reproducibility and accuracy
  • Focuses time on the microscope for higher throughput
  • Empowers new scientific results

 


Key features

 

Automated electron microscopy and TEM imaging

 

Integrated IDE

An integrated development environment (IDE) makes it easy to get up and running with AutoScript TEM Software. Object browsing and syntax tools with auto completion are all included to ensure a rich user experience and rapid, consistent scripting framework.

Python

Harness the power of your microscope using the most popular scientific programming language. AutoScript TEM Software is built on Python 3.5 and includes a number of pre-installed libraries for scientific computing, data analysis, data visualization, image processing, and machine learning.


Specifications

Style Sheet for Products Table Specifications
System requirements
  • Thermo Scientific Spectra or Talos (S)TEM with Windows 10 operating system
Common packages
  • NumPy, SciPy, Pandas, OpenCV, SciKit-image, Matplotlib, Jupyter
Application examples
  • Acquisition of STEM images from 12 segments of Panther STEM and HAADF simultaneously
  • Tile acquisition in TEM and STEM
  • Work with apertures
  • Display of image metadata
  • Focus series acquisition
  • Acquire SmartCam image
  • Acquire rocking beam maps
Compatibility
  • Runs on Windows 10 support computer
  • Compatible with Windows 10-based Thermo Scientific transmission electron microscopes
Style Sheet for Komodo Tabs

AutoScript TEM Software microscope status and controls

  • Optics (mode, beam shift, tilt, magnification, rotation)
  • Control of Thermo Scientific Selectris Energy Filter
  • Stage (movement, position read-out) including piezo stage
  • Apertures
  • Vacuum (state), column valves controls
  • Lorentz mode support

 

AutoScript TEM Software for image acquisition

  • Acquisition (camera and detector control, single image or a sequence, simultaneous acquisition from multiple detectors or segments)
  • TEM image acquisition with Thermo Scientific Ceta, Falcon (including counting mode), and SmartCam Cameras
  • STEM detectors (insert, retract, gain, offset, individual segments)
  • STEM image acquisition with Fischione HAADF, Panther STEM, or Thermo Scientific BF/DF detector
  • Acquisition from any segment or combination of segments of Panther STEM
  • Post processing of images using integrated Vision Toolkit package

 

AutoScript TEM Software auto-functions

  • TEM autofocus and astigmatism correction
  • STEM autofocus including access to OptiSTEM/AutoSTEM (if purchased)
  • AutoComa correction
  • AI processing available with Scikit-learn

 

An optional offline mode is available to provide simulation of the microscope. Scripts can be tested offline on user PCs before going to the microscope. Regular updates available with new functionality. For latest information please check: https://www.fei-software-center.com/tem-apps/tem-applications-update-page/

 


Resources

Example how to acquire STEM image from12 segments of Panther STEM and HAADF simultaneously

Example of the tile acquisition in TEM. Please also check STEM tiled acquisition script

Example of the tile acquisition in STEM
Example of the work with apertures
Display image metadata
Example of focus series acquisition
Example how to acquire STEM image from12 segments of Panther STEM and HAADF simultaneously

Example of the tile acquisition in TEM. Please also check STEM tiled acquisition script

Example of the tile acquisition in STEM
Example of the work with apertures
Display image metadata
Example of focus series acquisition

Applications

電子顕微鏡を使用したプロセス制御

電子顕微鏡を使用したプロセス制御

近年の産業では、確かなプロセス制御によって維持される優れた品質とスループットの両立が求められています。専用の自動化ソフトウェアを搭載したSEMおよびTEMツールは、プロセスモニタリングおよびプロセス改善のための迅速なマルチスケール情報を提供します。

 

電子顕微鏡を使用した品質管理と不良解析

品質管理と不良解析

近年の産業では、品質管理と品質保証が不可欠です。私たちは、欠陥をマルチスケールかつ多モードで分析可能なEMおよび分光ツールを提供しており、これらにより得られる信頼性の高い十分な情報によりプロセス制御および改善のための決定が可能となります。

Fundamental Materials Research_R&D_Thumb_274x180_144DPI

基礎材料研究

新材料開発では、その物理的および化学的特性を最大化するために、より小さなスケールでの研究がなされています。電子顕微鏡は、マイクロスケールからナノスケールのさまざまな材料特性について重要な情報を研究者に提供します。

 


Techniques

3D材料解析

多くの場合、材料の開発にはマルチスケールの3D解析が必要です。DualBeam装置により、大量の連続スライスと、その後のナノメートルスケールでのSEMイメージングが可能となり、試料の高品質な3D再構成処理を行うことができます。

詳細はこちら ›

マルチスケール分析

新しい材料の場合、その構造全体を把握しながら、高い分解能で分析する必要があります。マルチスケール分析では、X線マイクロCT、DualBeam、レーザーPFIB、SEM、TEMなどのさまざまなイメージング技術や方法の相関が可能です。

詳細はこちら ›

3D材料解析

多くの場合、材料の開発にはマルチスケールの3D解析が必要です。DualBeam装置により、大量の連続スライスと、その後のナノメートルスケールでのSEMイメージングが可能となり、試料の高品質な3D再構成処理を行うことができます。

詳細はこちら ›

マルチスケール分析

新しい材料の場合、その構造全体を把握しながら、高い分解能で分析する必要があります。マルチスケール分析では、X線マイクロCT、DualBeam、レーザーPFIB、SEM、TEMなどのさまざまなイメージング技術や方法の相関が可能です。

詳細はこちら ›

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