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Relative fluorescent quantitation (or quantitative fluorescence PCR (QF-PCR) is a technique used in a variety of fragment analysis applications that requires accurate peak height comparisons across multiple samples. Applications that utilize this technique include screening for loss of heterozygosity (LOH) using microsatellites or SNPs, aneuploidy assays, and detecting large chromosomal deletions.

図 1: ヘテロ接合性欠失(LOH)の検出 正常なサンプル(上)とがん細胞サンプル(下)から抽出した DNA のマイクロサテライト マーカーのエレクトロフェログラム。ライフテクノロジーズ 3130 シリーズ ジェネティック アナライザで解析しました。 がん細胞サンプルではピークの高さが低く、LOH の可能性が示唆されました。

相対蛍光定量の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用した PCR による目的のマイクロサテライト ローカスの増幅

推奨製品: プライマーの設計と PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識サイズ スタンダードを標識する蛍光色素推奨サイズ スタンダード使用可能なアプリケーションその他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
相対蛍光定量
- ヘテロ接合性欠失(LOH)SSSSSSS

マイクロサテライト ローカスのサイズとピークの高さを解析します。

もっと詳しく

お客様に最適なデータ解析ソフトウェアとは?

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用した PCR による目的のマイクロサテライト ローカスの増幅

推奨製品: プライマーの設計と PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識サイズ スタンダードを標識する蛍光色素推奨サイズ スタンダード使用可能なアプリケーションその他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
相対蛍光定量
- ヘテロ接合性欠失(LOH)SSSSSSS

マイクロサテライト ローカスのサイズとピークの高さを解析します。

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相対蛍光定量の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用した PCR による目的のマイクロサテライト ローカスの増幅

推奨製品: プライマーの設計と PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識サイズ スタンダードを標識する蛍光色素推奨サイズ スタンダード使用可能なアプリケーションその他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
相対蛍光定量
- ヘテロ接合性欠失(LOH)SSSSSSS

マイクロサテライト ローカスのサイズとピークの高さを解析します。

もっと詳しく

お客様に最適なデータ解析ソフトウェアとは?

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用した PCR による目的のマイクロサテライト ローカスの増幅

推奨製品: プライマーの設計と PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識サイズ スタンダードを標識する蛍光色素推奨サイズ スタンダード使用可能なアプリケーションその他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
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3500xl
3500xL
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
相対蛍光定量
- ヘテロ接合性欠失(LOH)SSSSSSS

マイクロサテライト ローカスのサイズとピークの高さを解析します。

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蛍光定量用推奨製品

3500 シリーズ ジェネティック アナライザ

GeneMapper® ソフトウェア

Verti サーマル サイクラ

Visistat reference component

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.